272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0841 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  100 
 
 
339 aa  698    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  56.98 
 
 
344 aa  413  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  40 
 
 
338 aa  233  5e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  40.52 
 
 
339 aa  227  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  36.42 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  34.72 
 
 
342 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  35.31 
 
 
342 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  34.82 
 
 
342 aa  209  6e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  34.1 
 
 
355 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  35.71 
 
 
341 aa  196  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  32.45 
 
 
348 aa  196  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  32.73 
 
 
338 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  37.61 
 
 
339 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  35.2 
 
 
310 aa  187  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.23 
 
 
367 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30.15 
 
 
341 aa  180  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  32.14 
 
 
348 aa  175  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  31.94 
 
 
349 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  29.07 
 
 
350 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  27.83 
 
 
335 aa  123  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  31.5 
 
 
319 aa  122  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  27.33 
 
 
357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  28.9 
 
 
556 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  24.35 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  31.06 
 
 
337 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  27.3 
 
 
375 aa  106  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0079  uroporphyrinogen decarboxylase  31.02 
 
 
287 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0659182  hitchhiker  0.00575431 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  23.84 
 
 
363 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  23.84 
 
 
363 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  25.57 
 
 
363 aa  102  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  23.26 
 
 
363 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  29.95 
 
 
287 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1823  uroporphyrinogen decarboxylase  29.63 
 
 
287 aa  97.1  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.952283  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  24.65 
 
 
358 aa  95.5  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  24.23 
 
 
448 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  25.81 
 
 
337 aa  94  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  24.5 
 
 
348 aa  92.4  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  26.21 
 
 
340 aa  92.4  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  25.53 
 
 
339 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  26.72 
 
 
340 aa  90.9  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.9 
 
 
335 aa  89.4  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  24.57 
 
 
339 aa  89.4  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  25.23 
 
 
339 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  25.22 
 
 
349 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  28.62 
 
 
346 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  22.99 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  25.65 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  23.75 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  28.52 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  25.64 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  26.06 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  27.88 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  24.57 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  26.59 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06091  uroporphyrinogen decarboxylase  27.88 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.633731  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2887  uroporphyrinogen decarboxylase  29 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  27.13 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  25.84 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  24.62 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  25.14 
 
 
356 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  24.44 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4338  uroporphyrinogen decarboxylase  26.47 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332252  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  26.5 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26160  hypothetical protein  26.79 
 
 
296 aa  75.9  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  24.31 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18361  uroporphyrinogen decarboxylase  23.94 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  24.31 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  24.29 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0918  uroporphyrinogen decarboxylase  24.22 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763067  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19188  uroporphyrinogen decarboxylase  25.07 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  23.82 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  29.31 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  25.19 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  22.89 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0422  uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  26.36 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2386  methylcobamide:CoM methyltransferase-related protein  25.33 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 
344 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1028  uroporphyrinogen decarboxylase  24.23 
 
 
338 aa  72.4  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  24.3 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  24.72 
 
 
354 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  24.6 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  23.85 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  24.79 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  25.14 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  27.6 
 
 
335 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  25.5 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18446  predicted protein  22.56 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  24.72 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  23.14 
 
 
617 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  25.28 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  27.49 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  23.31 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2705  uroporphyrinogen decarboxylase  25.3 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  25.19 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  23.58 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  22.93 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0010  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  23.51 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  22.93 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1430  uroporphyrinogen decarboxylase  23.48 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000852244  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  23.73 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>