46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1823 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1823  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 
287 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.952283  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  92.68 
 
 
287 aa  541  1e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0079  uroporphyrinogen decarboxylase  93.03 
 
 
287 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0659182  hitchhiker  0.00575431 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0422  uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  39.65 
 
 
293 aa  261  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  35.14 
 
 
342 aa  145  9e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.02 
 
 
348 aa  145  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  34.23 
 
 
342 aa  142  7e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30.42 
 
 
342 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26160  hypothetical protein  26.83 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.65 
 
 
341 aa  129  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30.81 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.82 
 
 
338 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.68 
 
 
339 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.63 
 
 
339 aa  97.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.64 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  25.83 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.35 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  27.17 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.82 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  26.88 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  29.31 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  28.74 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  28.74 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.12 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.81 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.65 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.24 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  26.4 
 
 
556 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  25.75 
 
 
363 aa  60.1  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  26.4 
 
 
372 aa  58.9  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  24.3 
 
 
349 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  26.03 
 
 
348 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  24.06 
 
 
373 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  23.12 
 
 
353 aa  49.7  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19188  uroporphyrinogen decarboxylase  28.19 
 
 
409 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.14 
 
 
337 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  24.23 
 
 
448 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28976  predicted protein  23.53 
 
 
365 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0707495  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  25.87 
 
 
355 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  25.17 
 
 
355 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  25.86 
 
 
354 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18446  predicted protein  24.1 
 
 
321 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  21.68 
 
 
355 aa  42.7  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  24.46 
 
 
348 aa  42.7  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1502  uroporphyrinogen decarboxylase  23.12 
 
 
378 aa  42.7  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>