60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0599 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0599  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  100 
 
 		 267 aa  532  1e-150  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  27.73 
 
 		 372 aa  85.5  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  31.52 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.32 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  22.39 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  32.85 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.83 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  29.01 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  27.27 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  30.3 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  31.06 
 
 		 363 aa  62  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  25.61 
 
 		 352 aa  62  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  25.58 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.02 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.82 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.89 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  31.62 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.29 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.23 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  24.24 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0918  uroporphyrinogen decarboxylase  22.81 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763067  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  27.33 
 
 		 375 aa  57  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.76 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.49 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  24.52 
 
 		 358 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  26.24 
 
 		 337 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  26.22 
 
 		 346 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18361  uroporphyrinogen decarboxylase  26.92 
 
 		 352 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  28.78 
 
 		 373 aa  52.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1086  uroporphyrinogen decarboxylase  26.76 
 
 		 354 aa  51.6  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970328 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06091  uroporphyrinogen decarboxylase  23.6 
 
 		 346 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.633731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2640  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  28.08 
 
 		 376 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 		 346 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.81 
 
 		 337 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  23.6 
 
 		 346 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.95 
 
 		 339 aa  49.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  24.1 
 
 		 351 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  28.46 
 
 		 354 aa  48.9  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28976  predicted protein  27.82 
 
 		 365 aa  48.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0707495  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.59 
 
 		 367 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  21.27 
 
 		 556 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  23.78 
 
 		 349 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17656  predicted protein  24.46 
 
 		 339 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0099841  normal  0.0141903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.53 
 
 		 339 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  23.68 
 
 		 339 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 		 386 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1713  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  26.94 
 
 		 349 aa  46.2  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00218554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  26.36 
 
 		 353 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  25.19 
 
 		 354 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  25.78 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  26.92 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  25.19 
 
 		 354 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.27 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  22.86 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18446  predicted protein  25.41 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 		 350 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  26.81 
 
 		 348 aa  42.7  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2957  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  40 
 
 		 408 aa  42.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1823  uroporphyrinogen decarboxylase  24.38 
 
 		 287 aa  42.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.952283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>