More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0610 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0610  diguanylate cyclase  100 
 
 		 275 aa  545  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000115231  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3232  hypothetical protein  33.19 
 
 		 498 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0640076  normal  0.305585 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0921  putative GGDEF protein  35.52 
 
 		 322 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1425  diguanylate cyclase  37.65 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1228  diguanylate cyclase  35.36 
 
 		 490 aa  113  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05578  hypothetical protein  32.75 
 
 		 650 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0532  GGDEF domain-containing protein  37.5 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0093  diguanylate cyclase  35.06 
 
 		 426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.37 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  34.71 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2508  diguanylate cyclase  32.43 
 
 		 387 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0581  GGDEF domain-containing protein  34.85 
 
 		 625 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.916714  normal  0.0449396 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001599  GGDEF domain protein  34.57 
 
 		 637 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.707658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0276  diguanylate cyclase  33.7 
 
 		 486 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0279  diguanylate cyclase  33.7 
 
 		 486 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00774453  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0272  diguanylate cyclase  33.7 
 
 		 486 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1290  diguanylate cyclase  33.7 
 
 		 491 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0009  diguanylate cyclase  31.31 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4329  diguanylate cyclase  33.87 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.406414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0280  diguanylate cyclase  33.7 
 
 		 486 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1211  diguanylate cyclase  36.26 
 
 		 578 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 454 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4457  GGDEF domain-containing protein  34.81 
 
 		 485 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02325  GGDEF domain protein  34.52 
 
 		 949 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1282  diguanylate cyclase  36.26 
 
 		 578 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2896  cellulose binding, type IV  35.57 
 
 		 443 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808862 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1761  diguanylate cyclase  34.09 
 
 		 720 aa  105  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3218  diguanylate cyclase  32.65 
 
 		 386 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.317388 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00151  Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  38.12 
 
 		 353 aa  105  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  36.16 
 
 		 588 aa  105  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0610  response regulator PleD  37.42 
 
 		 461 aa  105  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.961713  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2569  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.26 
 
 		 310 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.809417  hitchhiker  0.000987173 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1817  GGDEF family protein  37.57 
 
 		 512 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0575  response regulator PleD  37.42 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3823  diguanylate cyclase  35.67 
 
 		 690 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0867  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.62 
 
 		 312 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.711393  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1742  diguanylate cyclase  36.31 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0534167  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3753  diguanylate cyclase  35.33 
 
 		 485 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.580016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0782  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.88 
 
 		 450 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000969424  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3170  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.54 
 
 		 312 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0256904  normal  0.861805 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3646  diguanylate cyclase  34.48 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0392  diguanylate cyclase  30.58 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0549299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.88 
 
 		 450 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000908772  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1914  GGDEF domain-containing protein  34.94 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.743896  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  32.68 
 
 		 732 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0689  putative diguanylate cyclase  32.55 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0304  diguanylate cyclase  37.65 
 
 		 464 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7026  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.3 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.398098  hitchhiker  0.000000633587 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0452  diguanylate cyclase  33.51 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1138  diguanylate cyclase  35.33 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0268  diguanylate cyclase  35.33 
 
 		 485 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.624982  hitchhiker  0.000186113 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3512  diguanylate cyclase  36.7 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0269  diguanylate cyclase  33.15 
 
 		 485 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.853723  hitchhiker  0.00000177476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  29.6 
 
 		 680 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2243  diguanylate cyclase  36.63 
 
 		 726 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0252509  normal  0.0700768 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2313  response regulator  37.06 
 
 		 301 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3308  diguanylate cyclase  37.87 
 
 		 603 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000660005  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3577  GGDEF domain-containing protein  35.71 
 
 		 322 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.635523  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1391  diguanylate cyclase  32.73 
 
 		 353 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.723857  hitchhiker  0.0000000000000157902 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1677  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.69 
 
 		 512 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00717505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0571  diguanylate cyclase  35.33 
 
 		 324 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2315  diguanylate cyclase  36.63 
 
 		 726 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000640659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1485  diguanylate cyclase  35 
 
 		 490 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0570  diguanylate cyclase  35.33 
 
 		 324 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3203  diguanylate cyclase  30.51 
 
 		 569 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0987619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0911  sensory box histidine kinase  35.98 
 
 		 581 aa  102  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4798  diguanylate cyclase  33.7 
 
 		 485 aa  102  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393558 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2979  diguanylate cyclase  35 
 
 		 490 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2747  diguanylate cyclase  32.75 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.86983  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  30.89 
 
 		 634 aa  102  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1123  diguanylate cyclase  37.58 
 
 		 357 aa  102  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0998424  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  34.94 
 
 		 509 aa  102  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3711  diguanylate cyclase  36.07 
 
 		 320 aa  102  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1336  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 495 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2693  diguanylate cyclase  36.05 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1267  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  38.18 
 
 		 476 aa  102  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.413897 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.3 
 
 		 675 aa  102  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2969  sensory box/GGDEF family protein  34.55 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1006  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.59 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0504  GGDEF domain-containing protein  34.34 
 
 		 385 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2842  diguanylate cyclase  36.78 
 
 		 785 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.02 
 
 		 632 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0014  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.05 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.927772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  30 
 
 		 422 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0691  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.88 
 
 		 686 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343759  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4400  diguanylate cyclase  36.65 
 
 		 681 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.118889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4956  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0364888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64050  putative two-component response regulator  34.81 
 
 		 542 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5563  putative two-component response regulator  34.81 
 
 		 542 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.591571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0544  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 414 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1197  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.76 
 
 		 457 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1641  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.36 
 
 		 640 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.320869  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2587  GGDEF domain-containing protein  32.84 
 
 		 621 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21731  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2959  GGDEF domain-containing protein  32.74 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000656128  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1125  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.54 
 
 		 769 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.586946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1136  diguanylate cyclase  33.86 
 
 		 582 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1536  diguanylate cyclase  37.72 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370191  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3137  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.73 
 
 		 572 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1377  diguanylate cyclase  34.05 
 
 		 368 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>