More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4987 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_5282  comF operon protein 1  82.63 
 
 		 449 aa  786    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000003862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4987  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 450 aa  932    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5300  comF operon protein 1  82.85 
 
 		 449 aa  766    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5042  comF operon protein 1  82.22 
 
 		 451 aa  786    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4872  comF operon protein 1  83.3 
 
 		 449 aa  771    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4887  comF operon protein 1  82.89 
 
 		 451 aa  773    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5358  comF operon protein 1  83.07 
 
 		 449 aa  768    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5426  ComF operon protein 1  82.41 
 
 		 449 aa  785    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3730  helicase domain-containing protein  70.67 
 
 		 449 aa  663    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000982518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5645  comF operon protein 1  84.76 
 
 		 374 aa  660    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0073075  hitchhiker  0.000000000065503 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5312  comF operon protein 1  82.89 
 
 		 374 aa  650    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3041  helicase domain protein  57.69 
 
 		 499 aa  522  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0601765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3238  helicase domain protein  55.71 
 
 		 463 aa  488  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1334  superfamily II DNA/RNA helicase  37.63 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0362  helicase domain-containing protein  40.1 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0247  superfamily II DNA/RNA helicase  39.65 
 
 		 426 aa  276  6e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0336  helicase, putative  36.23 
 
 		 429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0224  DEAD/DEAH box helicase-like  39.81 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0854119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4755  helicase domain protein  34.27 
 
 		 623 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000089196  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0417  comF operon protein 1, putative  35.26 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0406  superfamily II DNA/RNA helicase  35.41 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.329953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2259  helicase domain protein  32.61 
 
 		 716 aa  239  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0791  helicase domain-containing protein  36.86 
 
 		 360 aa  230  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0788341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0774  helicase domain-containing protein  36.86 
 
 		 360 aa  230  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.327507  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  25 
 
 		 1167 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  24.64 
 
 		 1167 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  25.39 
 
 		 1158 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  24.45 
 
 		 1168 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  25.08 
 
 		 1158 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  26.69 
 
 		 1169 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1894  transcription-repair coupling factor  24.6 
 
 		 1109 aa  63.5  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.377763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  24.07 
 
 		 1169 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  23.72 
 
 		 1153 aa  63.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0937  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.74 
 
 		 938 aa  62.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0616253  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  22.33 
 
 		 1126 aa  62.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38583  predicted protein  23.99 
 
 		 754 aa  62.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.449683  normal  0.114344 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0630  transcription-repair coupling factor  25.64 
 
 		 1109 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30585  predicted protein  22.35 
 
 		 942 aa  61.6  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  24.01 
 
 		 1177 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  24.68 
 
 		 1193 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  23.99 
 
 		 1188 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0090  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.93 
 
 		 984 aa  60.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000165147  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  24.62 
 
 		 1192 aa  60.5  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  24.1 
 
 		 1192 aa  60.1  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  24.23 
 
 		 1180 aa  60.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2147  transcription-repair coupling factor  23.2 
 
 		 1103 aa  60.1  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  25.63 
 
 		 725 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1882  transcription-repair coupling factor  22.88 
 
 		 1099 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  24.46 
 
 		 1177 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  24.23 
 
 		 1176 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  24.62 
 
 		 725 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  25.34 
 
 		 1168 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  25.34 
 
 		 1168 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1519  replication restart DNA helicase PriA  25.89 
 
 		 823 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  22.7 
 
 		 1121 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  24.5 
 
 		 1183 aa  58.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  24.7 
 
 		 1176 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  26.6 
 
 		 1059 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1696  transcription-repair coupling factor  23.01 
 
 		 1107 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000188307 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1330  transcription-repair coupling factor  22.06 
 
 		 1155 aa  57.4  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.643209  normal  0.63963 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0766  transcription-repair coupling factor  24.25 
 
 		 1120 aa  57.4  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0770  transcription-repair coupling factor  24.16 
 
 		 1116 aa  57  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  26.53 
 
 		 734 aa  57  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  23.4 
 
 		 1166 aa  57  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  24.39 
 
 		 1176 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  24.32 
 
 		 1202 aa  57  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  24.39 
 
 		 1178 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  24.39 
 
 		 1176 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  25.29 
 
 		 725 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  24.39 
 
 		 1176 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  24.39 
 
 		 1176 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  24.39 
 
 		 1176 aa  56.6  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  24.39 
 
 		 1176 aa  56.6  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  24.39 
 
 		 1176 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  23.57 
 
 		 1170 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  24.09 
 
 		 1176 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  24.64 
 
 		 754 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0690  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.4 
 
 		 675 aa  55.8  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.100284  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  23.51 
 
 		 1169 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  25.77 
 
 		 832 aa  55.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0022  transcription-repair coupling factor  25 
 
 		 1113 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  22.47 
 
 		 1174 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  23.64 
 
 		 1169 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0878  transcription-repair coupling factor  24.17 
 
 		 1127 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  24.26 
 
 		 1155 aa  55.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  23.97 
 
 		 1112 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4189  primosomal protein N'  25.27 
 
 		 725 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  24.05 
 
 		 1179 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  23.49 
 
 		 1175 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  22.89 
 
 		 1196 aa  54.7  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  24.35 
 
 		 1207 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  25.55 
 
 		 813 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  26.55 
 
 		 731 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1292  transcription-repair coupling factor  24.93 
 
 		 1161 aa  53.9  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  25.91 
 
 		 732 aa  54.3  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  22.64 
 
 		 1165 aa  54.3  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.61 
 
 		 533 aa  53.9  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3490  primosome assembly protein PriA  25.57 
 
 		 764 aa  53.9  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000105942  normal  0.279843 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  25.32 
 
 		 1162 aa  53.9  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0272  hypothetical protein  22.3 
 
 		 1123 aa  53.5  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.580517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>