More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_5282 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_5300  comF operon protein 1  90.87 
 
 		 449 aa  825    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5042  comF operon protein 1  99.33 
 
 		 451 aa  919    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4872  comF operon protein 1  97.77 
 
 		 449 aa  886    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4887  comF operon protein 1  97.77 
 
 		 451 aa  889    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5426  ComF operon protein 1  99.33 
 
 		 449 aa  918    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3730  helicase domain-containing protein  70.63 
 
 		 449 aa  658    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000982518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5645  comF operon protein 1  87.17 
 
 		 374 aa  678    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0073075  hitchhiker  0.000000000065503 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5282  comF operon protein 1  100 
 
 		 449 aa  925    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000003862 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5358  comF operon protein 1  91.54 
 
 		 449 aa  839    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4987  helicase domain-containing protein  82.63 
 
 		 450 aa  766    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5312  comF operon protein 1  85.83 
 
 		 374 aa  669    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3041  helicase domain protein  57.21 
 
 		 499 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0601765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3238  helicase domain protein  52.57 
 
 		 463 aa  478  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0336  helicase, putative  37.44 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0362  helicase domain-containing protein  39.27 
 
 		 443 aa  277  4e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1334  superfamily II DNA/RNA helicase  36.88 
 
 		 425 aa  273  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0247  superfamily II DNA/RNA helicase  37.68 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0406  superfamily II DNA/RNA helicase  35.68 
 
 		 439 aa  259  6e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.329953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0224  DEAD/DEAH box helicase-like  37.98 
 
 		 453 aa  256  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0854119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0417  comF operon protein 1, putative  35.7 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4755  helicase domain protein  33.7 
 
 		 623 aa  247  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000089196  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2259  helicase domain protein  32.42 
 
 		 716 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0774  helicase domain-containing protein  36.44 
 
 		 360 aa  229  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.327507  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0791  helicase domain-containing protein  36.44 
 
 		 360 aa  229  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0788341  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  24.55 
 
 		 1168 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  24.1 
 
 		 1158 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38583  predicted protein  22.22 
 
 		 754 aa  60.1  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.449683  normal  0.114344 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13430  transcription-repair coupling factor Mfd  25.23 
 
 		 1211 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0858576  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  23.8 
 
 		 1158 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4189  primosomal protein N'  26.13 
 
 		 725 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  23.4 
 
 		 730 aa  58.2  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  24.23 
 
 		 1169 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  25 
 
 		 1202 aa  56.6  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0690  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.75 
 
 		 675 aa  55.8  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.100284  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  24.45 
 
 		 832 aa  55.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  24.69 
 
 		 1177 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  26.37 
 
 		 731 aa  54.7  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  25.16 
 
 		 1224 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.89 
 
 		 671 aa  54.3  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  26.06 
 
 		 801 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  25.31 
 
 		 733 aa  54.3  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  23.41 
 
 		 1188 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3812  primosome assembly protein PriA  26.11 
 
 		 732 aa  53.5  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4099  primosome assembly protein PriA  26.11 
 
 		 732 aa  53.5  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0871  excinuclease ABC subunit B  33.6 
 
 		 658 aa  53.5  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2869  primosomal protein N'  21.45 
 
 		 753 aa  53.1  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0116  primosome assembly protein PriA  26.11 
 
 		 732 aa  53.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  23.3 
 
 		 1167 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  23.62 
 
 		 1167 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  25 
 
 		 1192 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  23.62 
 
 		 1126 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  23.7 
 
 		 725 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  22.71 
 
 		 1121 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  23.12 
 
 		 725 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0937  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.98 
 
 		 938 aa  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0616253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  24.01 
 
 		 1176 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  23.95 
 
 		 1192 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  27.04 
 
 		 731 aa  52.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  21.8 
 
 		 1153 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  23.12 
 
 		 725 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3497  primosome assembly protein PriA  25.97 
 
 		 765 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.631062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  23.73 
 
 		 768 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  23.71 
 
 		 1176 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  23.71 
 
 		 1176 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.54 
 
 		 712 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  23.71 
 
 		 1178 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  23.71 
 
 		 1176 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1894  transcription-repair coupling factor  23.26 
 
 		 1109 aa  51.2  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.377763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  23.71 
 
 		 1176 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1430  primosomal protein N'  23.56 
 
 		 764 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0145325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.92 
 
 		 688 aa  51.2  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  25.08 
 
 		 1169 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  23.71 
 
 		 1176 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  24.07 
 
 		 733 aa  50.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  23.71 
 
 		 1176 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  25.91 
 
 		 732 aa  51.2  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  23.04 
 
 		 732 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  23.71 
 
 		 1176 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.08 
 
 		 805 aa  51.2  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08480  transcription-repair coupling factor Mfd  24.31 
 
 		 1155 aa  50.8  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13697  normal  0.343175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.23 
 
 		 703 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4366  primosomal protein N'  24.29 
 
 		 736 aa  50.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  23.71 
 
 		 1176 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  23.71 
 
 		 1176 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  27.04 
 
 		 734 aa  50.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  23.26 
 
 		 1166 aa  50.4  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  20 
 
 		 673 aa  50.1  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3173  primosome assembly protein PriA  25.32 
 
 		 765 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  25.15 
 
 		 730 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  23.8 
 
 		 1177 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1519  replication restart DNA helicase PriA  23.86 
 
 		 823 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1602  excinuclease ABC, B subunit  30.91 
 
 		 658 aa  50.1  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  24.69 
 
 		 732 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0309  excinuclease ABC subunit B  33.33 
 
 		 660 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00254602  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4167  primosome assembly protein PriA  24.69 
 
 		 732 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  27.14 
 
 		 804 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4083  primosome assembly protein PriA  24.69 
 
 		 732 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  23.46 
 
 		 739 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2147  transcription-repair coupling factor  21.68 
 
 		 1103 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4471  primosome assembly protein PriA  24.69 
 
 		 732 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>