282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A5358 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_5282  comF operon protein 1  91.54 
 
 		 449 aa  860    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000003862 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5645  comF operon protein 1  88.5 
 
 		 374 aa  684    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0073075  hitchhiker  0.000000000065503 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5300  comF operon protein 1  95.55 
 
 		 449 aa  867    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3730  helicase domain-containing protein  70.54 
 
 		 449 aa  651    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000982518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5042  comF operon protein 1  91.31 
 
 		 451 aa  859    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4872  comF operon protein 1  92.2 
 
 		 449 aa  849    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4887  comF operon protein 1  92.43 
 
 		 451 aa  849    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5426  ComF operon protein 1  91.31 
 
 		 449 aa  859    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4987  helicase domain-containing protein  83.07 
 
 		 450 aa  766    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5358  comF operon protein 1  100 
 
 		 449 aa  932    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5312  comF operon protein 1  87.7 
 
 		 374 aa  681    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3041  helicase domain protein  56.97 
 
 		 499 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0601765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3238  helicase domain protein  52.57 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1334  superfamily II DNA/RNA helicase  38.42 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0336  helicase, putative  35.89 
 
 		 429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0362  helicase domain-containing protein  38.28 
 
 		 443 aa  273  6e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0247  superfamily II DNA/RNA helicase  38.42 
 
 		 426 aa  266  4e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0224  DEAD/DEAH box helicase-like  37.39 
 
 		 453 aa  257  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0854119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0406  superfamily II DNA/RNA helicase  35.97 
 
 		 439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.329953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4755  helicase domain protein  33.69 
 
 		 623 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000089196  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0417  comF operon protein 1, putative  34.26 
 
 		 387 aa  243  5e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2259  helicase domain protein  32.74 
 
 		 716 aa  237  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0774  helicase domain-containing protein  36.63 
 
 		 360 aa  229  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.327507  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0791  helicase domain-containing protein  36.63 
 
 		 360 aa  229  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0788341  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  24.46 
 
 		 1158 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  24.15 
 
 		 1158 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  25.08 
 
 		 1169 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38583  predicted protein  20.6 
 
 		 754 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.449683  normal  0.114344 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  23.19 
 
 		 1177 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4189  primosomal protein N'  25.63 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13430  transcription-repair coupling factor Mfd  24.71 
 
 		 1211 aa  58.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0858576  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  27.27 
 
 		 801 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  22.88 
 
 		 1188 aa  57.4  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  24.92 
 
 		 1224 aa  57.4  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  23.78 
 
 		 1126 aa  57  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0690  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.33 
 
 		 675 aa  56.6  0.0000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.100284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  23.72 
 
 		 1168 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  26.4 
 
 		 1169 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  24.47 
 
 		 1202 aa  55.8  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  25 
 
 		 1059 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.68 
 
 		 671 aa  55.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3497  primosome assembly protein PriA  26.67 
 
 		 765 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.631062 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  23.65 
 
 		 1192 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  23.37 
 
 		 1177 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0937  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.95 
 
 		 938 aa  55.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0616253  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  22.98 
 
 		 1166 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  23.33 
 
 		 730 aa  55.1  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  23.31 
 
 		 768 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  24.61 
 
 		 1112 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3302  primosome assembly protein PriA  26.06 
 
 		 768 aa  53.9  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.304002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  23.26 
 
 		 1121 aa  54.3  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2399  transcription-repair coupling factor  23.99 
 
 		 1178 aa  53.9  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00178528  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3173  primosome assembly protein PriA  26 
 
 		 765 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  23.35 
 
 		 1192 aa  53.9  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  22.78 
 
 		 1167 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  25.52 
 
 		 804 aa  53.9  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  23.44 
 
 		 1176 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1894  transcription-repair coupling factor  22.8 
 
 		 1109 aa  53.9  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.377763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  23.44 
 
 		 1176 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  23.44 
 
 		 1176 aa  53.5  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  23.44 
 
 		 1178 aa  53.5  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  23.44 
 
 		 1176 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  25.74 
 
 		 1168 aa  53.5  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  23.44 
 
 		 1176 aa  53.5  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  25.74 
 
 		 1168 aa  53.5  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  23.44 
 
 		 1176 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  22.78 
 
 		 1167 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  23.44 
 
 		 1176 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  23.44 
 
 		 1176 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30585  predicted protein  26.98 
 
 		 942 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0766  transcription-repair coupling factor  21.38 
 
 		 1120 aa  52.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  23.56 
 
 		 725 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  23.44 
 
 		 1176 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.52 
 
 		 688 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  22.99 
 
 		 725 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0630  transcription-repair coupling factor  24.44 
 
 		 1109 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08480  transcription-repair coupling factor Mfd  24.22 
 
 		 1155 aa  51.6  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13697  normal  0.343175 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1292  transcription-repair coupling factor  23.91 
 
 		 1161 aa  51.6  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  24.17 
 
 		 730 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3490  primosome assembly protein PriA  24.72 
 
 		 764 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000105942  normal  0.279843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  23.15 
 
 		 1176 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  24.51 
 
 		 813 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  22.76 
 
 		 1165 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  25.82 
 
 		 731 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0878  transcription-repair coupling factor  23.43 
 
 		 1127 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  24.49 
 
 		 678 aa  51.2  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  22.99 
 
 		 725 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  23.55 
 
 		 1193 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3341  primosome assembly protein PriA  24.22 
 
 		 761 aa  50.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000327838  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1519  replication restart DNA helicase PriA  21.43 
 
 		 823 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  24.27 
 
 		 1180 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  24.01 
 
 		 1188 aa  50.8  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.03 
 
 		 805 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  24.71 
 
 		 731 aa  50.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1330  transcription-repair coupling factor  23.35 
 
 		 1155 aa  50.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.643209  normal  0.63963 
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  20 
 
 		 673 aa  50.1  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  24.88 
 
 		 732 aa  50.1  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0309  excinuclease ABC subunit B  31.71 
 
 		 660 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00254602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1311  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.68 
 
 		 686 aa  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1286  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.68 
 
 		 686 aa  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>