More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3238 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3238  helicase domain protein  100 
 
 		 463 aa  941    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3041  helicase domain protein  67.76 
 
 		 499 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0601765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5300  comF operon protein 1  53.72 
 
 		 449 aa  485  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3730  helicase domain-containing protein  52.58 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000982518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4987  helicase domain-containing protein  55.71 
 
 		 450 aa  488  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5358  comF operon protein 1  54.76 
 
 		 449 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5042  comF operon protein 1  52.57 
 
 		 451 aa  478  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4872  comF operon protein 1  55 
 
 		 449 aa  478  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5282  comF operon protein 1  52.57 
 
 		 449 aa  478  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000003862 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5426  ComF operon protein 1  52.57 
 
 		 449 aa  478  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4887  comF operon protein 1  53.49 
 
 		 451 aa  478  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5312  comF operon protein 1  53.35 
 
 		 374 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5645  comF operon protein 1  53.62 
 
 		 374 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0073075  hitchhiker  0.000000000065503 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0362  helicase domain-containing protein  40.9 
 
 		 443 aa  309  6.999999999999999e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0247  superfamily II DNA/RNA helicase  41.79 
 
 		 426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0336  helicase, putative  36.67 
 
 		 429 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0224  DEAD/DEAH box helicase-like  41.82 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0854119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0406  superfamily II DNA/RNA helicase  35.43 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.329953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4755  helicase domain protein  35.56 
 
 		 623 aa  247  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000089196  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0417  comF operon protein 1, putative  35.03 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1334  superfamily II DNA/RNA helicase  36.04 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2259  helicase domain protein  30.72 
 
 		 716 aa  229  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0791  helicase domain-containing protein  35.07 
 
 		 360 aa  216  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0788341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0774  helicase domain-containing protein  35.07 
 
 		 360 aa  216  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.327507  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  26.19 
 
 		 1126 aa  84.3  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  28.93 
 
 		 730 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1894  transcription-repair coupling factor  26.33 
 
 		 1109 aa  78.2  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.377763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  25.74 
 
 		 1188 aa  76.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  25.49 
 
 		 1153 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2989  transcription-repair coupling factor  26.18 
 
 		 1205 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.147706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1518  transcription-repair coupling factor  28.53 
 
 		 1195 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1696  transcription-repair coupling factor  24.92 
 
 		 1107 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000188307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2938  transcription-repair coupling factor  28.66 
 
 		 1172 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1212  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.74 
 
 		 699 aa  74.7  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.376481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  28.91 
 
 		 725 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  28.15 
 
 		 725 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  28.64 
 
 		 744 aa  73.6  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2579  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.95 
 
 		 678 aa  73.6  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0922078  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  24.04 
 
 		 1169 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  28.15 
 
 		 725 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2053  transcription-repair coupling factor  28.43 
 
 		 1173 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0242332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4157  transcription repair coupling factor  28.04 
 
 		 1171 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0793  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.94 
 
 		 682 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.17 
 
 		 695 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2610  transcription-repair coupling factor  28.09 
 
 		 1172 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1408  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.42 
 
 		 974 aa  72  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  29.17 
 
 		 754 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.28 
 
 		 700 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1485  transcription-repair coupling factor  28.43 
 
 		 1172 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  25.67 
 
 		 1177 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  25.74 
 
 		 1073 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  29.3 
 
 		 727 aa  71.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7185  transcription-repair coupling factor  29.14 
 
 		 1190 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.202363  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.89 
 
 		 747 aa  70.9  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6308  transcription-repair coupling factor  29.14 
 
 		 1203 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0152711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4676  transcription-repair coupling factor  28.92 
 
 		 1200 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  25.66 
 
 		 1121 aa  70.5  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1330  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.61 
 
 		 678 aa  70.1  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  27.85 
 
 		 745 aa  70.1  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1349  transcription-repair coupling factor  29.64 
 
 		 1149 aa  70.1  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  26.09 
 
 		 1166 aa  69.7  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3682  helicase domain-containing protein  25.66 
 
 		 629 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1500  transcription-repair coupling factor  29.14 
 
 		 1163 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0625318 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.72 
 
 		 671 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.01 
 
 		 695 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2850  transcription-repair coupling factor  27.86 
 
 		 1171 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.334437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.88 
 
 		 704 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.28 
 
 		 779 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  25.33 
 
 		 1177 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4532  transcription-repair coupling factor  29.85 
 
 		 1196 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.850755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1513  transcription-repair coupling factor  26.79 
 
 		 1174 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.696907  normal  0.0197286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4262  transcription-repair coupling factor  28.18 
 
 		 1168 aa  68.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336252  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  24.86 
 
 		 1167 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  24.86 
 
 		 1167 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4163  transcription-repair coupling factor  29.54 
 
 		 1196 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0389  RecG-like helicase  27.3 
 
 		 636 aa  67.8  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0493519 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2139  transcription-repair coupling factor  25.33 
 
 		 1207 aa  67.4  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.21 
 
 		 686 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  27.27 
 
 		 1188 aa  67.4  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0878  transcription-repair coupling factor  24.32 
 
 		 1127 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.36 
 
 		 688 aa  67.4  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0090  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.08 
 
 		 984 aa  67.4  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000165147  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  27.69 
 
 		 729 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.3 
 
 		 695 aa  67  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.2 
 
 		 686 aa  67  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  27.71 
 
 		 696 aa  67  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003994  transcription-repair coupling factor  25.75 
 
 		 1153 aa  67  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0770  transcription-repair coupling factor  23.72 
 
 		 1116 aa  67  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.09 
 
 		 685 aa  67  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  25.08 
 
 		 1155 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2622  transcription-repair coupling factor  27.1 
 
 		 1172 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.153021  hitchhiker  0.000463296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  26.76 
 
 		 1112 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  27.94 
 
 		 818 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.28 
 
 		 689 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  23.46 
 
 		 1179 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.98 
 
 		 695 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1647  transcription-repair coupling factor  29.85 
 
 		 1198 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0790633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2619  transcription-repair coupling factor  27.15 
 
 		 1155 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  23.48 
 
 		 1174 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0109  transcription-repair coupling factor  26.46 
 
 		 1156 aa  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.174112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>