More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0793 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.23 
 
 
682 aa  716    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0793  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
682 aa  1417    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.23 
 
 
682 aa  718    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.23 
 
 
682 aa  716    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.38 
 
 
682 aa  666    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.23 
 
 
682 aa  716    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.32 
 
 
657 aa  704    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.08 
 
 
682 aa  714    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.68 
 
 
682 aa  726    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.38 
 
 
682 aa  718    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.23 
 
 
682 aa  716    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.38 
 
 
682 aa  719    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1311  ATP-dependent DNA helicase RecG  84.11 
 
 
686 aa  1229    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1286  ATP-dependent DNA helicase RecG  84.11 
 
 
686 aa  1229    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.03 
 
 
682 aa  699    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.78 
 
 
685 aa  717    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1162  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.24 
 
 
678 aa  621  1e-176  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000110827  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.76 
 
 
671 aa  619  1e-176  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.85 
 
 
681 aa  609  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.58 
 
 
672 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0449  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.99 
 
 
676 aa  590  1e-167  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0217624  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.3 
 
 
679 aa  586  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.54 
 
 
676 aa  588  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1330  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.37 
 
 
678 aa  526  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.77 
 
 
689 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.96 
 
 
683 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.69 
 
 
685 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.02 
 
 
681 aa  498  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.47 
 
 
692 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.2 
 
 
685 aa  488  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.56 
 
 
694 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.85 
 
 
740 aa  481  1e-134  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.31 
 
 
679 aa  475  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.49 
 
 
779 aa  473  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  39.56 
 
 
818 aa  475  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1984  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.47 
 
 
690 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.67 
 
 
717 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.37 
 
 
818 aa  468  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.03 
 
 
817 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.45 
 
 
786 aa  464  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.6 
 
 
818 aa  465  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.69 
 
 
765 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.58 
 
 
763 aa  465  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.41 
 
 
688 aa  461  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.28 
 
 
779 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.81 
 
 
842 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.14 
 
 
829 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.16 
 
 
827 aa  459  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.66 
 
 
832 aa  456  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.49 
 
 
819 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.01 
 
 
680 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.49 
 
 
819 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.98 
 
 
827 aa  452  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.38 
 
 
714 aa  452  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.88 
 
 
776 aa  448  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.91 
 
 
678 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.94 
 
 
773 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.26 
 
 
767 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.65 
 
 
689 aa  444  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.82 
 
 
703 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.48 
 
 
686 aa  445  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.06 
 
 
781 aa  445  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.72 
 
 
695 aa  445  1e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.59 
 
 
842 aa  442  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.86 
 
 
862 aa  443  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.88 
 
 
822 aa  442  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.73 
 
 
772 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.19 
 
 
818 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.85 
 
 
815 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.01 
 
 
701 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.43 
 
 
696 aa  439  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  40.15 
 
 
700 aa  439  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.14 
 
 
702 aa  438  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.35 
 
 
805 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.83 
 
 
706 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.97 
 
 
691 aa  437  1e-121  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.56 
 
 
778 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.61 
 
 
772 aa  438  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.72 
 
 
818 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.4 
 
 
903 aa  435  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.37 
 
 
822 aa  436  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.26 
 
 
812 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  46 
 
 
818 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.95 
 
 
799 aa  433  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2579  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.81 
 
 
678 aa  429  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0922078  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.69 
 
 
700 aa  430  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.46 
 
 
701 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1702  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.88 
 
 
564 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.78 
 
 
720 aa  429  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.36 
 
 
705 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.78 
 
 
690 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.46 
 
 
693 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.78 
 
 
846 aa  425  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.88 
 
 
787 aa  423  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0908  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.74 
 
 
703 aa  423  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.63 
 
 
704 aa  424  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.24 
 
 
697 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.46 
 
 
701 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.7 
 
 
815 aa  425  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.33 
 
 
846 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>