More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3041 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3041  helicase domain protein  100 
 
 		 499 aa  1035    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0601765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3238  helicase domain protein  67.76 
 
 		 463 aa  642    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3730  helicase domain-containing protein  56.63 
 
 		 449 aa  536  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000982518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4987  helicase domain-containing protein  57.69 
 
 		 450 aa  521  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5282  comF operon protein 1  56.03 
 
 		 449 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000003862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5042  comF operon protein 1  55.8 
 
 		 451 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5426  ComF operon protein 1  55.8 
 
 		 449 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5300  comF operon protein 1  56.97 
 
 		 449 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4872  comF operon protein 1  57.69 
 
 		 449 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4887  comF operon protein 1  57.69 
 
 		 451 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5358  comF operon protein 1  56.97 
 
 		 449 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5645  comF operon protein 1  57.37 
 
 		 374 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0073075  hitchhiker  0.000000000065503 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5312  comF operon protein 1  56.57 
 
 		 374 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0247  superfamily II DNA/RNA helicase  43.57 
 
 		 426 aa  319  6e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0362  helicase domain-containing protein  42.36 
 
 		 443 aa  305  9.000000000000001e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0224  DEAD/DEAH box helicase-like  39.61 
 
 		 453 aa  283  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0854119  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0336  helicase, putative  38.19 
 
 		 429 aa  282  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0417  comF operon protein 1, putative  38.64 
 
 		 387 aa  270  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0406  superfamily II DNA/RNA helicase  38.79 
 
 		 439 aa  262  8e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.329953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2259  helicase domain protein  32.21 
 
 		 716 aa  260  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4755  helicase domain protein  35.86 
 
 		 623 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000089196  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1334  superfamily II DNA/RNA helicase  36.32 
 
 		 425 aa  239  5.999999999999999e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0791  helicase domain-containing protein  38.24 
 
 		 360 aa  239  8e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0788341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0774  helicase domain-containing protein  38.24 
 
 		 360 aa  239  8e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.327507  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  25.45 
 
 		 1188 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  26.25 
 
 		 1169 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0690  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.6 
 
 		 675 aa  75.5  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.100284  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  26.4 
 
 		 1153 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  24.63 
 
 		 1177 aa  74.7  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  25.16 
 
 		 1073 aa  73.6  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3682  helicase domain-containing protein  27.1 
 
 		 629 aa  71.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1894  transcription-repair coupling factor  26.52 
 
 		 1109 aa  71.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.377763  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.26 
 
 		 672 aa  71.6  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1408  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.91 
 
 		 974 aa  71.2  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.98 
 
 		 779 aa  70.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  24.75 
 
 		 1174 aa  70.5  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  25.08 
 
 		 1126 aa  70.1  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  25.68 
 
 		 1179 aa  70.1  0.00000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  24.75 
 
 		 1169 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  27.3 
 
 		 1158 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  26.55 
 
 		 1168 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  26.69 
 
 		 1169 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  26.55 
 
 		 1168 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  26.97 
 
 		 1168 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  24.78 
 
 		 1166 aa  68.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  24.75 
 
 		 1175 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  26.97 
 
 		 1158 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.24 
 
 		 671 aa  68.2  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  24.75 
 
 		 1170 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  25.15 
 
 		 1167 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  25.15 
 
 		 1167 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  25.31 
 
 		 1188 aa  67.8  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1725  transcription-repair coupling factor  26.71 
 
 		 1160 aa  67.4  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  25.89 
 
 		 1165 aa  67.4  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  24.29 
 
 		 1177 aa  67  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2579  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.22 
 
 		 678 aa  65.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0922078  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4676  transcription-repair coupling factor  28.26 
 
 		 1200 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  25.08 
 
 		 1121 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.52 
 
 		 683 aa  65.1  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1201  transcription-repair coupling factor  28.25 
 
 		 1154 aa  65.1  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.656597  normal  0.0999319 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.37 
 
 		 688 aa  65.1  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.43 
 
 		 685 aa  64.7  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  24.78 
 
 		 1196 aa  65.1  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.72 
 
 		 681 aa  64.7  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0090  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.23 
 
 		 984 aa  65.1  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000165147  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0967  transcription-repair coupling factor  25.3 
 
 		 1170 aa  64.7  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.8826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04745  transcription-repair coupling factor  27.91 
 
 		 1154 aa  64.3  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.982613  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.96 
 
 		 700 aa  64.3  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.42 
 
 		 901 aa  64.3  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0620  transcription-repair coupling factor  26.06 
 
 		 1244 aa  63.9  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1636  transcription-repair coupling factor  25.16 
 
 		 1271 aa  63.9  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000538763  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  24.57 
 
 		 1176 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  25.57 
 
 		 1153 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  24.29 
 
 		 1176 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  24.17 
 
 		 1193 aa  63.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1800  transcription-repair coupling factor  25.54 
 
 		 1166 aa  63.9  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1485  transcription-repair coupling factor  25.79 
 
 		 1172 aa  63.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432425 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0793  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.2 
 
 		 682 aa  63.5  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  25.57 
 
 		 1153 aa  63.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2399  transcription-repair coupling factor  26.16 
 
 		 1178 aa  63.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00178528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  28.23 
 
 		 1174 aa  63.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2938  transcription-repair coupling factor  28.05 
 
 		 1172 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3081  transcription-repair coupling factor  27.08 
 
 		 1171 aa  63.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195799  normal  0.080304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1518  transcription-repair coupling factor  26.46 
 
 		 1195 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.11 
 
 		 815 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  25.74 
 
 		 1180 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  27.04 
 
 		 1162 aa  62.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  24.29 
 
 		 1176 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.32 
 
 		 815 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  24.29 
 
 		 1176 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  24.29 
 
 		 1178 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  24.29 
 
 		 1176 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  24.29 
 
 		 1176 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  24.29 
 
 		 1176 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  24.29 
 
 		 1176 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1982  transcription-repair coupling factor  25.45 
 
 		 1164 aa  62.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  24.1 
 
 		 1197 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0109  transcription-repair coupling factor  25.76 
 
 		 1156 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.174112 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.56 
 
 		 679 aa  61.6  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0389  RecG-like helicase  23.23 
 
 		 636 aa  61.6  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0493519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>