281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_5426 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5300  comF operon protein 1  90.65 
 
 
449 aa  824    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5042  comF operon protein 1  100 
 
 
451 aa  924    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4872  comF operon protein 1  97.55 
 
 
449 aa  884    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4887  comF operon protein 1  97.55 
 
 
451 aa  887    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3730  helicase domain-containing protein  70.4 
 
 
449 aa  657    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000982518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5645  comF operon protein 1  86.9 
 
 
374 aa  677    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0073075  hitchhiker  0.000000000065503 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5426  ComF operon protein 1  100 
 
 
449 aa  924    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5358  comF operon protein 1  91.31 
 
 
449 aa  838    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5282  comF operon protein 1  99.33 
 
 
449 aa  918    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000003862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5312  comF operon protein 1  85.56 
 
 
374 aa  668    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4987  helicase domain-containing protein  82.41 
 
 
450 aa  765    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3041  helicase domain protein  56.97 
 
 
499 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0601765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3238  helicase domain protein  52.57 
 
 
463 aa  478  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0362  helicase domain-containing protein  39.02 
 
 
443 aa  276  7e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0336  helicase, putative  36.96 
 
 
429 aa  272  9e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1334  superfamily II DNA/RNA helicase  36.63 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000453066  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0247  superfamily II DNA/RNA helicase  37.44 
 
 
426 aa  258  2e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0406  superfamily II DNA/RNA helicase  35.45 
 
 
439 aa  256  7e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.329953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0224  DEAD/DEAH box helicase-like  37.75 
 
 
453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0854119  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0417  comF operon protein 1, putative  35.44 
 
 
387 aa  249  7e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4755  helicase domain protein  33.26 
 
 
623 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000089196  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2259  helicase domain protein  32.02 
 
 
716 aa  229  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642106  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0791  helicase domain-containing protein  36.15 
 
 
360 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0788341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0774  helicase domain-containing protein  36.15 
 
 
360 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.327507  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  24.1 
 
 
1158 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4189  primosomal protein N'  26.02 
 
 
725 aa  60.1  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  24.55 
 
 
1168 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13430  transcription-repair coupling factor Mfd  25.23 
 
 
1211 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0858576  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  24.7 
 
 
1158 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  24.23 
 
 
1169 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  23.12 
 
 
730 aa  57.4  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  25 
 
 
1202 aa  56.2  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38583  predicted protein  21.94 
 
 
754 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.449683  normal  0.114344 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  26.37 
 
 
731 aa  55.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  23.95 
 
 
1126 aa  54.7  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0690  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.6 
 
 
675 aa  54.7  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.100284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  26.06 
 
 
801 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  25.31 
 
 
733 aa  54.3  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4099  primosome assembly protein PriA  26.11 
 
 
732 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3812  primosome assembly protein PriA  26.11 
 
 
732 aa  53.9  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  24.69 
 
 
1177 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0116  primosome assembly protein PriA  26.11 
 
 
732 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  25.16 
 
 
1224 aa  53.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  22.84 
 
 
1188 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  22.32 
 
 
1121 aa  53.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.89 
 
 
671 aa  52.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  25.91 
 
 
1192 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  26.59 
 
 
731 aa  53.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0871  excinuclease ABC subunit B  33.6 
 
 
658 aa  52.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1894  transcription-repair coupling factor  23.59 
 
 
1109 aa  53.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.377763  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4366  primosomal protein N'  24.29 
 
 
736 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  23.3 
 
 
1167 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  23.62 
 
 
1167 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  23.73 
 
 
768 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  24.85 
 
 
1192 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  21.8 
 
 
1153 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  25.91 
 
 
732 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  23.12 
 
 
725 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2869  primosomal protein N'  21.09 
 
 
753 aa  52.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  22.54 
 
 
725 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  22.54 
 
 
725 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  24.07 
 
 
733 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  22.9 
 
 
732 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3497  primosome assembly protein PriA  25.97 
 
 
765 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.631062 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  24.01 
 
 
1176 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08480  transcription-repair coupling factor Mfd  24.31 
 
 
1155 aa  50.8  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13697  normal  0.343175 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1292  transcription-repair coupling factor  24.57 
 
 
1161 aa  50.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.54 
 
 
712 aa  50.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0878  transcription-repair coupling factor  23 
 
 
1127 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  23.71 
 
 
1176 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  23.58 
 
 
832 aa  50.4  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  23.71 
 
 
1176 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  23.71 
 
 
1176 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  23.71 
 
 
1176 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  23.3 
 
 
732 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  23.71 
 
 
1176 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  23.71 
 
 
1176 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  23.46 
 
 
739 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  23.71 
 
 
1176 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.08 
 
 
805 aa  50.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  24.69 
 
 
732 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  24.69 
 
 
732 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  23.3 
 
 
732 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  23.71 
 
 
1178 aa  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4377  primosome assembly protein PriA  24.69 
 
 
732 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.679343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4495  primosome assembly protein PriA  23.3 
 
 
732 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4471  primosome assembly protein PriA  24.69 
 
 
732 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  24.69 
 
 
732 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4083  primosome assembly protein PriA  24.69 
 
 
732 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0766  transcription-repair coupling factor  21.61 
 
 
1120 aa  50.1  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4167  primosome assembly protein PriA  24.69 
 
 
732 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  23.3 
 
 
732 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  23.3 
 
 
732 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  25.08 
 
 
1169 aa  50.1  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  26.53 
 
 
734 aa  50.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1519  replication restart DNA helicase PriA  23.74 
 
 
823 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5393  primosome assembly protein PriA  24.69 
 
 
732 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670889  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  23.26 
 
 
1166 aa  50.1  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4418  primosome assembly protein PriA  24.69 
 
 
732 aa  50.1  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  20 
 
 
673 aa  49.3  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>