More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0362 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0362  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 443 aa  919    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0247  superfamily II DNA/RNA helicase  45.41 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0336  helicase, putative  40.51 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3238  helicase domain protein  40.9 
 
 		 463 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3041  helicase domain protein  42.36 
 
 		 499 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0601765  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1334  superfamily II DNA/RNA helicase  39.59 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0406  superfamily II DNA/RNA helicase  39.04 
 
 		 439 aa  296  6e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.329953  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3730  helicase domain-containing protein  39.8 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000982518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4987  helicase domain-containing protein  40.1 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4872  comF operon protein 1  39.51 
 
 		 449 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4887  comF operon protein 1  39.51 
 
 		 451 aa  277  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5282  comF operon protein 1  39.27 
 
 		 449 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000003862 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5426  ComF operon protein 1  39.02 
 
 		 449 aa  276  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5042  comF operon protein 1  39.02 
 
 		 451 aa  276  8e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5358  comF operon protein 1  38.28 
 
 		 449 aa  273  6e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5300  comF operon protein 1  37.99 
 
 		 449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5645  comF operon protein 1  41.97 
 
 		 374 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0073075  hitchhiker  0.000000000065503 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5312  comF operon protein 1  38.83 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0224  DEAD/DEAH box helicase-like  37.13 
 
 		 453 aa  233  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0854119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4755  helicase domain protein  32.26 
 
 		 623 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000089196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0774  helicase domain-containing protein  37.76 
 
 		 360 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.327507  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0791  helicase domain-containing protein  37.76 
 
 		 360 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0788341  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0417  comF operon protein 1, putative  36.9 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2259  helicase domain protein  27.91 
 
 		 716 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.23 
 
 		 679 aa  66.6  0.0000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  25.97 
 
 		 1188 aa  66.6  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0579  transcription-repair coupling factor  26.17 
 
 		 1122 aa  62.4  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3081  transcription-repair coupling factor  35.9 
 
 		 1171 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195799  normal  0.080304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  24.32 
 
 		 1168 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0544  transcription-repair coupling factor  26.17 
 
 		 1132 aa  62.4  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3618  excinuclease ABC, B subunit  29.41 
 
 		 677 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  22.7 
 
 		 1174 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3640  transcription-repair coupling factor  26.85 
 
 		 1170 aa  60.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  23.33 
 
 		 1170 aa  60.1  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08420  primosomal protein N'  25.32 
 
 		 786 aa  60.1  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.181256  normal  0.746709 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0563  excinuclease ABC subunit B  25 
 
 		 666 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.733421  normal  0.043063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  25.38 
 
 		 1153 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  24.23 
 
 		 1166 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1561  transcription repair coupling factor  33.94 
 
 		 1160 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224407  normal  0.305942 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0389  RecG-like helicase  25.08 
 
 		 636 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0493519 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  22.64 
 
 		 1174 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1827  excinuclease ABC subunit B  30.17 
 
 		 683 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.54987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0392  excinuclease ABC subunit B  25.85 
 
 		 669 aa  58.9  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  28.49 
 
 		 815 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  24.7 
 
 		 1169 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0109  transcription-repair coupling factor  25.4 
 
 		 1156 aa  57.4  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.174112 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1982  transcription-repair coupling factor  24.24 
 
 		 1164 aa  57.4  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0798  transcription-repair coupling factor  31.93 
 
 		 1163 aa  57.4  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151739  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1228  transcription-repair coupling factor  23.89 
 
 		 978 aa  57  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1416  excinuclease ABC subunit B  30.1 
 
 		 664 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0921  excinuclease ABC, B subunit  26.77 
 
 		 658 aa  57  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1320  excinuclease ABC subunit B  27.27 
 
 		 642 aa  57  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.223951  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43765  predicted protein  27.41 
 
 		 690 aa  57  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0853218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  24.62 
 
 		 1177 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  21.75 
 
 		 1175 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1103  transcription-repair coupling factor  23.87 
 
 		 978 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1443  transcription-repair coupling factor  33.03 
 
 		 1165 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0802912 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2850  transcription-repair coupling factor (helicase)  33.03 
 
 		 1165 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.74664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1833  excinuclease ABC subunit B  27.67 
 
 		 669 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1500  transcription-repair coupling factor  33.33 
 
 		 1163 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0625318 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  21.94 
 
 		 1169 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1894  excinuclease ABC subunit B  27.67 
 
 		 669 aa  56.6  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  23.33 
 
 		 1167 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1349  transcription-repair coupling factor  23.96 
 
 		 1149 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1702  transcription-repair coupling factor  26.06 
 
 		 1167 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  23.33 
 
 		 1167 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  24.7 
 
 		 1180 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0801  excinuclease ABC subunit B  29.76 
 
 		 691 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.177675 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  23.33 
 
 		 678 aa  55.1  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1408  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.78 
 
 		 974 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2030  excinuclease ABC subunit B  28.43 
 
 		 690 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0667365  normal  0.695875 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0714  transcription-repair coupling factor  24.61 
 
 		 981 aa  55.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.721642  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.63 
 
 		 704 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1534  excinuclease ABC, B subunit  26.11 
 
 		 665 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000060622  unclonable  1.0539100000000002e-18 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3612  excinuclease ABC, B subunit  26.5 
 
 		 673 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865526  normal  0.950041 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1318  excinuclease ABC subunit B  26.11 
 
 		 671 aa  55.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000791691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.32 
 
 		 681 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0380  excinuclease ABC subunit B  31.55 
 
 		 678 aa  54.7  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3723  excinuclease ABC subunit B  25 
 
 		 667 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.22049  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3669  excinuclease ABC subunit B  25 
 
 		 667 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4036  excinuclease ABC, B subunit  26.92 
 
 		 679 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.545808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2366  transcription-repair coupling factor  24.92 
 
 		 1175 aa  54.3  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  21.64 
 
 		 1126 aa  54.3  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2322  transcription-repair coupling factor  33.03 
 
 		 1153 aa  54.3  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.831848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf076  excinuclease ABC subunit B  26.88 
 
 		 660 aa  54.3  0.000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.136728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0099  excinuclease ABC subunit B  26.53 
 
 		 667 aa  53.9  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1320  excinuclease ABC subunit B  35.96 
 
 		 679 aa  53.9  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.350926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  24.39 
 
 		 1158 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0391  excinuclease ABC subunit B  27.69 
 
 		 695 aa  53.9  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.301443  normal  0.603789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1518  transcription-repair coupling factor  24.55 
 
 		 1195 aa  53.9  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  24.85 
 
 		 1179 aa  53.9  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1280  excinuclease ABC, B subunit  25.37 
 
 		 658 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1438  excinuclease ABC subunit B  27.05 
 
 		 661 aa  53.5  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0134  excinuclease ABC subunit B  27.18 
 
 		 662 aa  53.5  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2619  transcription-repair coupling factor  23.58 
 
 		 1155 aa  53.5  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1847  excinuclease ABC subunit B  26.83 
 
 		 662 aa  53.5  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0811  excinuclease ABC subunit B  28.74 
 
 		 663 aa  53.5  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131315  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1613  transcription-repair coupling factor  21.78 
 
 		 989 aa  53.5  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2992  excinuclease ABC subunit B  28.36 
 
 		 659 aa  53.5  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000124238  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  23.11 
 
 		 733 aa  53.5  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>