More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1103 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1103  transcription-repair coupling factor  100 
 
 		 978 aa  1969    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1228  transcription-repair coupling factor  98.98 
 
 		 978 aa  1954    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1039  transcription-repair coupling factor  71.88 
 
 		 979 aa  1396    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.113966  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0638  transcription-repair coupling factor  98.16 
 
 		 978 aa  1933    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1566  transcription-repair coupling factor  50.1 
 
 		 990 aa  936    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0078  transcription-repair coupling factor  60.49 
 
 		 981 aa  1176    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0469  transcription-repair coupling factor  58.13 
 
 		 986 aa  1107    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1613  transcription-repair coupling factor  52.73 
 
 		 989 aa  1009    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0737  transcription-repair coupling factor  58.13 
 
 		 985 aa  1136    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00351961  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0714  transcription-repair coupling factor  59.69 
 
 		 981 aa  1179    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.721642  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3728  transcription-repair coupling factor  31.64 
 
 		 1103 aa  511  1e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2158  transcription-repair coupling factor  42.26 
 
 		 1162 aa  496  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0247263  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1161  transcription-repair coupling factor  42.33 
 
 		 1143 aa  498  1e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2399  transcription-repair coupling factor  41.15 
 
 		 1178 aa  498  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00178528  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2157  transcription-repair coupling factor  41.2 
 
 		 1148 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2255  transcription-repair coupling factor  42.16 
 
 		 1164 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1358  transcription-repair coupling factor  39.93 
 
 		 1157 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  38.27 
 
 		 1183 aa  493  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1810  transcription-repair coupling factor  42.16 
 
 		 1160 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.540051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  40.49 
 
 		 1158 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  39.57 
 
 		 1155 aa  490  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1730  transcription-repair coupling factor  42.33 
 
 		 1160 aa  492  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119053  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25230  transcription-repair coupling factor  41.03 
 
 		 1148 aa  492  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2289  transcription-repair coupling factor  41.99 
 
 		 1160 aa  492  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00423432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2511  transcription-repair coupling factor  42.23 
 
 		 1165 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00100471  normal  0.47703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2406  transcription-repair coupling factor  42.23 
 
 		 1162 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00482386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1593  transcription-repair coupling factor  40.87 
 
 		 1145 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.383279 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1543  transcription-repair coupling factor  42.24 
 
 		 1157 aa  487  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00144396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2833  transcription-repair coupling factor  40.66 
 
 		 1157 aa  485  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000601821  hitchhiker  0.00381117 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1882  transcription-repair coupling factor  34.44 
 
 		 1099 aa  484  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1630  transcription-repair coupling factor  42.09 
 
 		 1160 aa  486  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00676636  normal  0.517783 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1674  transcription-repair coupling factor  41.96 
 
 		 1179 aa  485  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000415877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1952  transcription-repair coupling factor  42.23 
 
 		 1162 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00516748  normal  0.328047 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2395  transcription-repair coupling factor  42.23 
 
 		 1162 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000829473  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1665  transcription-repair coupling factor  41.93 
 
 		 1149 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.808978 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1642  transcription-repair coupling factor  38.51 
 
 		 1158 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3866  transcription-repair coupling factor  40.58 
 
 		 1149 aa  481  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0039  transcription-repair coupling factor  40.78 
 
 		 1193 aa  481  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0770  transcription-repair coupling factor  34.87 
 
 		 1116 aa  481  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  39.88 
 
 		 1153 aa  482  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01528  transcription-repair coupling factor  39.52 
 
 		 1153 aa  479  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0031  transcription-repair coupling factor  41.07 
 
 		 1195 aa  480  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  40.23 
 
 		 1174 aa  483  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2147  transcription-repair coupling factor  34.37 
 
 		 1103 aa  482  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14570  transcription-repair coupling factor  40.26 
 
 		 1149 aa  480  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2148  transcription-repair coupling factor  41.93 
 
 		 1149 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  42.12 
 
 		 1141 aa  478  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2139  transcription-repair coupling factor  40.84 
 
 		 1207 aa  478  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2101  transcription-repair coupling factor  41.17 
 
 		 1150 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325386  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1292  transcription-repair coupling factor  31.26 
 
 		 1148 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.208562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1689  transcription-repair coupling factor  41.93 
 
 		 1141 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281852 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1330  transcription-repair coupling factor  31.26 
 
 		 1148 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266348 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1201  transcription-repair coupling factor  39.81 
 
 		 1154 aa  478  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.656597  normal  0.0999319 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1636  transcription-repair coupling factor  40.72 
 
 		 1271 aa  476  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000538763  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1969  transcription-repair coupling factor  31.26 
 
 		 1148 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1811  transcription-repair coupling factor  40.84 
 
 		 1157 aa  478  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000258386  normal  0.0877788 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1567  transcription-repair coupling factor  41.18 
 
 		 1150 aa  479  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  39.8 
 
 		 1162 aa  478  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003994  transcription-repair coupling factor  39.78 
 
 		 1153 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  39.29 
 
 		 1159 aa  479  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6308  transcription-repair coupling factor  40.96 
 
 		 1203 aa  479  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0152711 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1330  transcription-repair coupling factor  40.69 
 
 		 1155 aa  479  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.643209  normal  0.63963 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1315  transcription-repair coupling factor  31.26 
 
 		 1148 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3594  transcription-repair coupling factor  41.93 
 
 		 1149 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  36.23 
 
 		 1170 aa  473  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1896  transcription-repair coupling factor  41.17 
 
 		 1150 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.482284 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  35.63 
 
 		 1150 aa  474  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02437  transcription-repair coupling factor  40.61 
 
 		 1165 aa  476  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.272439  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1982  transcription-repair coupling factor  40.24 
 
 		 1164 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  39.37 
 
 		 1157 aa  476  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  39.63 
 
 		 1162 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  31.68 
 
 		 1073 aa  473  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  39.37 
 
 		 1157 aa  474  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  38.02 
 
 		 1173 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3695  transcription-repair coupling factor  33.9 
 
 		 1115 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0696  transcription-repair coupling factor  38.98 
 
 		 1151 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221423  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0579  transcription-repair coupling factor  41.65 
 
 		 1122 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  38.32 
 
 		 1178 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04745  transcription-repair coupling factor  40.55 
 
 		 1154 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.982613  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  33.33 
 
 		 1121 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1702  transcription-repair coupling factor  41.36 
 
 		 1167 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  39.74 
 
 		 1177 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1598  transcription-repair coupling factor  39.03 
 
 		 1148 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000129728  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0620  transcription-repair coupling factor  38.87 
 
 		 1244 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1864  transcription-repair coupling factor  39.56 
 
 		 1147 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0555269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  38.03 
 
 		 1196 aa  467  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1484  transcription-repair coupling factor  38.25 
 
 		 1243 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.704172  normal  0.0864414 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1706  transcription-repair coupling factor  39.03 
 
 		 1148 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43136  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0997  transcription-repair coupling factor  39.37 
 
 		 1164 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1874  transcription-repair coupling factor  39.09 
 
 		 1160 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157118  normal  0.0187303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2864  transcription-repair coupling factor  39.03 
 
 		 1148 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0829666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1664  transcription-repair coupling factor  38.1 
 
 		 1243 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200808 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1653  transcription-repair coupling factor  40.75 
 
 		 1194 aa  469  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1725  transcription-repair coupling factor  38.14 
 
 		 1160 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4676  transcription-repair coupling factor  41.31 
 
 		 1200 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7185  transcription-repair coupling factor  40.64 
 
 		 1190 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.202363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  35.99 
 
 		 1189 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0878  transcription-repair coupling factor  33.33 
 
 		 1127 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1518  transcription-repair coupling factor  40.75 
 
 		 1195 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0798  transcription-repair coupling factor  39.64 
 
 		 1163 aa  464  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>