More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0336 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0336  helicase, putative  100 
 
 		 429 aa  891    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0406  superfamily II DNA/RNA helicase  56.88 
 
 		 439 aa  486  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.329953  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0362  helicase domain-containing protein  40.51 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3730  helicase domain-containing protein  36.89 
 
 		 449 aa  286  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000982518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3041  helicase domain protein  38.19 
 
 		 499 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0601765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5282  comF operon protein 1  37.44 
 
 		 449 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000003862 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4887  comF operon protein 1  37.68 
 
 		 451 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4872  comF operon protein 1  37.44 
 
 		 449 aa  276  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3238  helicase domain protein  36.67 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5358  comF operon protein 1  35.89 
 
 		 449 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0247  superfamily II DNA/RNA helicase  41.5 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4987  helicase domain-containing protein  36.23 
 
 		 450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5042  comF operon protein 1  36.96 
 
 		 451 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5426  ComF operon protein 1  36.96 
 
 		 449 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5300  comF operon protein 1  35.75 
 
 		 449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1334  superfamily II DNA/RNA helicase  37.5 
 
 		 425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5645  comF operon protein 1  37.23 
 
 		 374 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0073075  hitchhiker  0.000000000065503 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5312  comF operon protein 1  36.68 
 
 		 374 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4755  helicase domain protein  30.84 
 
 		 623 aa  221  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000089196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0791  helicase domain-containing protein  34.32 
 
 		 360 aa  200  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0788341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0774  helicase domain-containing protein  34.32 
 
 		 360 aa  200  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.327507  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0417  comF operon protein 1, putative  34.91 
 
 		 387 aa  199  7e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0224  DEAD/DEAH box helicase-like  32.35 
 
 		 453 aa  196  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0854119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2259  helicase domain protein  28.09 
 
 		 716 aa  161  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.89 
 
 		 819 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.89 
 
 		 819 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.48 
 
 		 779 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.4 
 
 		 827 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.86 
 
 		 818 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2579  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.43 
 
 		 678 aa  69.7  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0922078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.5 
 
 		 805 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.92 
 
 		 681 aa  68.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.31 
 
 		 822 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  23.45 
 
 		 1170 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.21 
 
 		 822 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4366  primosomal protein N'  24.08 
 
 		 736 aa  66.6  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.86 
 
 		 818 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.77 
 
 		 679 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  21.92 
 
 		 706 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  23.18 
 
 		 1174 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.9 
 
 		 901 aa  65.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.28 
 
 		 815 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.02 
 
 		 812 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.4 
 
 		 688 aa  64.3  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.06 
 
 		 680 aa  64.3  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  23.27 
 
 		 1167 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  23.27 
 
 		 1167 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.76 
 
 		 817 aa  63.9  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.78 
 
 		 763 aa  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  22.22 
 
 		 1189 aa  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.99 
 
 		 818 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.8 
 
 		 846 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.51 
 
 		 704 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  25.19 
 
 		 1168 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.34 
 
 		 676 aa  61.6  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  25.19 
 
 		 1168 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.81 
 
 		 827 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.53 
 
 		 846 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.8 
 
 		 698 aa  61.2  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.19 
 
 		 818 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1344  transcription-repair coupling factor  24.26 
 
 		 893 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252576  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1894  transcription-repair coupling factor  25.44 
 
 		 1109 aa  61.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.377763  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  24.78 
 
 		 1126 aa  60.8  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  22.25 
 
 		 1169 aa  60.1  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0594  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.65 
 
 		 686 aa  59.7  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  21.86 
 
 		 719 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  21.47 
 
 		 712 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.77 
 
 		 893 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0160807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.41 
 
 		 678 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.73 
 
 		 701 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  24.92 
 
 		 1165 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.5 
 
 		 695 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.71 
 
 		 671 aa  58.2  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001866  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.02 
 
 		 689 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.38 
 
 		 702 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.53 
 
 		 815 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.02 
 
 		 693 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  22.75 
 
 		 745 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  24.89 
 
 		 754 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  29.91 
 
 		 746 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0690  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.74 
 
 		 675 aa  57.8  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.100284  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.77 
 
 		 696 aa  57.4  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.08 
 
 		 691 aa  57  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  22.71 
 
 		 1246 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00158  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.71 
 
 		 690 aa  57  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2335  ATP-dependent DNA helicase RecG  21.37 
 
 		 750 aa  56.6  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.51 
 
 		 688 aa  56.2  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.75 
 
 		 787 aa  56.6  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  23.71 
 
 		 1166 aa  56.2  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.96 
 
 		 832 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  22.31 
 
 		 1175 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.1 
 
 		 703 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.61 
 
 		 682 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.61 
 
 		 657 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.61 
 
 		 682 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.19 
 
 		 707 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1212  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.67 
 
 		 699 aa  55.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.376481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  24.2 
 
 		 1192 aa  55.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.61 
 
 		 682 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.61 
 
 		 682 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>