More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2890 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
678 aa  1394    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.16 
 
 
694 aa  589  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.83 
 
 
689 aa  582  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.58 
 
 
679 aa  544  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.74 
 
 
786 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.64 
 
 
681 aa  538  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1984  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.31 
 
 
690 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.48 
 
 
685 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.94 
 
 
683 aa  528  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.97 
 
 
685 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.79 
 
 
682 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.97 
 
 
819 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.79 
 
 
682 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.79 
 
 
682 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.97 
 
 
819 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.79 
 
 
682 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.79 
 
 
682 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.09 
 
 
682 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.64 
 
 
682 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.03 
 
 
685 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.79 
 
 
682 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.83 
 
 
818 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.33 
 
 
779 aa  509  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.72 
 
 
657 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.61 
 
 
682 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.41 
 
 
702 aa  504  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.74 
 
 
817 aa  500  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.22 
 
 
827 aa  499  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.59 
 
 
818 aa  501  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  38.93 
 
 
818 aa  497  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.18 
 
 
763 aa  498  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1139  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.41 
 
 
776 aa  496  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00836981  normal  0.0179484 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.97 
 
 
773 aa  498  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.41 
 
 
740 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  40 
 
 
779 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.35 
 
 
704 aa  491  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.15 
 
 
682 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.27 
 
 
717 aa  489  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.9 
 
 
776 aa  491  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  39.86 
 
 
700 aa  489  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1702  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.64 
 
 
564 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.48 
 
 
700 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  40 
 
 
671 aa  486  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.86 
 
 
787 aa  489  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.38 
 
 
812 aa  487  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.32 
 
 
689 aa  486  1e-136  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.07 
 
 
827 aa  484  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.63 
 
 
692 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.67 
 
 
672 aa  484  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.63 
 
 
822 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.76 
 
 
846 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.4 
 
 
703 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.03 
 
 
903 aa  479  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.43 
 
 
846 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.43 
 
 
846 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.8 
 
 
822 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.13 
 
 
695 aa  479  1e-134  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.34 
 
 
706 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1244  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.86 
 
 
850 aa  477  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.912337  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.33 
 
 
862 aa  478  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.96 
 
 
805 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.54 
 
 
681 aa  476  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.48 
 
 
702 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.75 
 
 
680 aa  473  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.36 
 
 
765 aa  475  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.3 
 
 
818 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.79 
 
 
842 aa  474  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.87 
 
 
818 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.42 
 
 
781 aa  474  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1162  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.31 
 
 
678 aa  473  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000110827  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.03 
 
 
767 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.87 
 
 
832 aa  471  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.8 
 
 
688 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.23 
 
 
690 aa  468  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.46 
 
 
686 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.45 
 
 
682 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0449  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.37 
 
 
676 aa  466  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0217624  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.16 
 
 
701 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1330  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.04 
 
 
678 aa  469  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.56 
 
 
815 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.18 
 
 
818 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.65 
 
 
815 aa  465  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.73 
 
 
696 aa  462  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.36 
 
 
778 aa  463  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.95 
 
 
842 aa  462  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.66 
 
 
698 aa  458  1e-127  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0793  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.91 
 
 
682 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.08 
 
 
772 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.54 
 
 
829 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.03 
 
 
714 aa  452  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.44 
 
 
696 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.59 
 
 
691 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.59 
 
 
696 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.63 
 
 
772 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.59 
 
 
696 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.01 
 
 
686 aa  450  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.25 
 
 
696 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.37 
 
 
693 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.8 
 
 
696 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.29 
 
 
696 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>