More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2912 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.06 
 
 		 704 aa  659    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.34 
 
 		 729 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.15 
 
 		 702 aa  641    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.36 
 
 		 706 aa  642    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.63 
 
 		 704 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 691 aa  1372    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.1 
 
 		 695 aa  656    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.65 
 
 		 701 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.65 
 
 		 701 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.38 
 
 		 695 aa  641    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.17 
 
 		 694 aa  708    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.07 
 
 		 706 aa  637    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.28 
 
 		 702 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.4 
 
 		 694 aa  660    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.65 
 
 		 706 aa  634  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.93 
 
 		 696 aa  632  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.38 
 
 		 695 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  50 
 
 		 790 aa  630  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.63 
 
 		 729 aa  628  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.63 
 
 		 729 aa  628  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.12 
 
 		 750 aa  625  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.13 
 
 		 696 aa  624  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.7 
 
 		 700 aa  619  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.28 
 
 		 701 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  49.79 
 
 		 699 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.14 
 
 		 690 aa  602  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.78 
 
 		 686 aa  589  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.93 
 
 		 697 aa  588  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.57 
 
 		 700 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  50.07 
 
 		 699 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.29 
 
 		 703 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  50.14 
 
 		 728 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.56 
 
 		 697 aa  577  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.14 
 
 		 700 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  48.78 
 
 		 727 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.44 
 
 		 731 aa  567  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  48.78 
 
 		 699 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  47.24 
 
 		 685 aa  558  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.93 
 
 		 701 aa  544  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.36 
 
 		 723 aa  521  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.69 
 
 		 673 aa  517  1.0000000000000001e-145  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.2 
 
 		 679 aa  513  1e-144  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  40.42 
 
 		 678 aa  506  9.999999999999999e-143  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.18 
 
 		 709 aa  499  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.35 
 
 		 700 aa  487  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.12 
 
 		 686 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.84 
 
 		 693 aa  479  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.55 
 
 		 697 aa  475  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.23 
 
 		 692 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.05 
 
 		 692 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.06 
 
 		 692 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.48 
 
 		 690 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.63 
 
 		 690 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.96 
 
 		 691 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.05 
 
 		 692 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.68 
 
 		 691 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.31 
 
 		 747 aa  463  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.55 
 
 		 829 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.37 
 
 		 705 aa  463  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2025  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.91 
 
 		 691 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.39 
 
 		 704 aa  461  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0065  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.79 
 
 		 691 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.13 
 
 		 703 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0201  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.64 
 
 		 691 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.77 
 
 		 678 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.79 
 
 		 687 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.38589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.02 
 
 		 691 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.39 
 
 		 704 aa  461  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.78 
 
 		 767 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6122  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.84 
 
 		 691 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.14 
 
 		 765 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.11 
 
 		 772 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.3 
 
 		 772 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.11 
 
 		 684 aa  457  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.3 
 
 		 685 aa  456  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.66 
 
 		 690 aa  458  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.64 
 
 		 686 aa  456  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70570  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.7 
 
 		 691 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.53 
 
 		 778 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.16 
 
 		 693 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.66 
 
 		 683 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.8 
 
 		 691 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.09 
 
 		 693 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  43 
 
 		 691 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.11 
 
 		 714 aa  452  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.31 
 
 		 715 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2711  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.81 
 
 		 671 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.09 
 
 		 688 aa  452  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.09 
 
 		 728 aa  452  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.75 
 
 		 812 aa  451  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.97 
 
 		 691 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.15 
 
 		 692 aa  449  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4496  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.58 
 
 		 693 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.75 
 
 		 685 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.43 
 
 		 693 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.39 
 
 		 696 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.24 
 
 		 846 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.57 
 
 		 702 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.64 
 
 		 696 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.79 
 
 		 696 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>