More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0884 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.02 
 
 
715 aa  776    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0697  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.72 
 
 
832 aa  771    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5068  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.06 
 
 
709 aa  694    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2711  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.47 
 
 
671 aa  768    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1787  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.47 
 
 
671 aa  695    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.56 
 
 
696 aa  645    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2662  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.73 
 
 
791 aa  766    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.139193 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2575  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.65 
 
 
902 aa  760    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.36 
 
 
704 aa  665    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2389  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.65 
 
 
686 aa  761    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681406  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.8 
 
 
684 aa  783    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.99 
 
 
683 aa  810    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0593  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.21 
 
 
708 aa  701    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.5 
 
 
728 aa  788    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.73 
 
 
691 aa  655    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.26 
 
 
678 aa  789    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2523  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.71 
 
 
740 aa  773    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174099  normal  0.914241 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3368  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.65 
 
 
866 aa  762    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.58 
 
 
712 aa  658    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4496  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.71 
 
 
693 aa  639    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3812  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.3 
 
 
777 aa  772    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.55 
 
 
691 aa  644    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.27 
 
 
696 aa  642    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.16 
 
 
715 aa  780    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.88 
 
 
693 aa  656    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.6 
 
 
671 aa  667    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.338376 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
692 aa  1414    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2335  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.54 
 
 
750 aa  700    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1280  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.5 
 
 
859 aa  766    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.07 
 
 
693 aa  647    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.42 
 
 
696 aa  641    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.42 
 
 
696 aa  643    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0376  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.38 
 
 
723 aa  706    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3688  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.47 
 
 
747 aa  671    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0367  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.95 
 
 
723 aa  703    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.469061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3325  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.65 
 
 
902 aa  760    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.97169  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.94 
 
 
686 aa  822    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0468  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.98 
 
 
731 aa  672    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3988  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.36 
 
 
768 aa  763    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3359  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.65 
 
 
902 aa  761    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.19 
 
 
697 aa  680    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1167  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.65 
 
 
902 aa  760    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.07 
 
 
737 aa  781    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.43 
 
 
693 aa  640    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.44 
 
 
692 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1504  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.8 
 
 
695 aa  706    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0240  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.44 
 
 
771 aa  768    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0639  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.44 
 
 
792 aa  769    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.42 
 
 
691 aa  664    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0306  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.65 
 
 
902 aa  760    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0322  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.42 
 
 
715 aa  688    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.732592  normal  0.0359852 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.27 
 
 
696 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.27 
 
 
696 aa  639    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.44 
 
 
785 aa  774    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1011  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.67 
 
 
746 aa  708    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3737  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.7 
 
 
665 aa  695    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0724  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.44 
 
 
771 aa  768    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.98 
 
 
696 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.15 
 
 
691 aa  644    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.36 
 
 
704 aa  664    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0692  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.15 
 
 
773 aa  757    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153149  normal  0.329538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.88 
 
 
686 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.98 
 
 
688 aa  630  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0065  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.78 
 
 
691 aa  631  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.64 
 
 
691 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.29 
 
 
692 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.15 
 
 
693 aa  631  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.55 
 
 
705 aa  630  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.58 
 
 
690 aa  631  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.15 
 
 
692 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.06 
 
 
691 aa  626  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0201  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.34 
 
 
691 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.29 
 
 
692 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.69 
 
 
691 aa  628  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70570  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.93 
 
 
691 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.84 
 
 
691 aa  624  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0037  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.62 
 
 
693 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6122  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.78 
 
 
691 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.17 
 
 
690 aa  619  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.88 
 
 
690 aa  618  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.68 
 
 
693 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.68 
 
 
693 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.15 
 
 
691 aa  621  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.43 
 
 
693 aa  620  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.68 
 
 
693 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.16 
 
 
696 aa  619  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.68 
 
 
693 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.35 
 
 
691 aa  618  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4180  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.48 
 
 
693 aa  618  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.46 
 
 
693 aa  615  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.39 
 
 
693 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0041  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.48 
 
 
693 aa  618  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0059  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.91 
 
 
693 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2025  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.85 
 
 
691 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4592  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.6 
 
 
691 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000346665 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3507  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.89 
 
 
691 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3863  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.91 
 
 
693 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0053  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.48 
 
 
693 aa  608  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.81 
 
 
693 aa  610  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3987  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.63 
 
 
693 aa  610  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>