More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0107 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.57 
 
 		 723 aa  665    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 709 aa  1394    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.57 
 
 		 694 aa  605  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.8 
 
 		 701 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.82 
 
 		 702 aa  598  1e-169  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.65 
 
 		 701 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.32 
 
 		 706 aa  589  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.32 
 
 		 706 aa  589  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.2 
 
 		 706 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.33 
 
 		 790 aa  580  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.45 
 
 		 697 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.8 
 
 		 701 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  48.65 
 
 		 699 aa  572  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.36 
 
 		 690 aa  567  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.01 
 
 		 702 aa  567  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.78 
 
 		 729 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.8 
 
 		 696 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.5 
 
 		 697 aa  562  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.99 
 
 		 729 aa  560  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.38 
 
 		 686 aa  559  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.5 
 
 		 729 aa  561  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.79 
 
 		 731 aa  560  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.15 
 
 		 695 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.29 
 
 		 704 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.03 
 
 		 700 aa  555  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.43 
 
 		 704 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.22 
 
 		 750 aa  550  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  49 
 
 		 695 aa  549  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.86 
 
 		 695 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  48.23 
 
 		 685 aa  544  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  47.52 
 
 		 727 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.09 
 
 		 700 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.28 
 
 		 696 aa  542  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.51 
 
 		 700 aa  538  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  47.72 
 
 		 699 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.72 
 
 		 694 aa  537  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  47.29 
 
 		 699 aa  535  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  47.65 
 
 		 728 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.18 
 
 		 691 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.65 
 
 		 703 aa  514  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  48.86 
 
 		 701 aa  505  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  38.47 
 
 		 678 aa  486  1e-136  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.95 
 
 		 679 aa  486  1e-136  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.66 
 
 		 673 aa  468  9.999999999999999e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.09 
 
 		 692 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.96 
 
 		 686 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.09 
 
 		 692 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.29 
 
 		 692 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.83 
 
 		 691 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.09 
 
 		 692 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.41 
 
 		 691 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.39 
 
 		 704 aa  434  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.12 
 
 		 704 aa  436  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0065  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.06 
 
 		 691 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.3 
 
 		 747 aa  426  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.59 
 
 		 691 aa  428  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.62 
 
 		 693 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4976  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.77 
 
 		 697 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0201  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.81 
 
 		 691 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.72 
 
 		 693 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.14 
 
 		 693 aa  422  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6122  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.38 
 
 		 691 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.59 
 
 		 765 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70570  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.23 
 
 		 691 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.27 
 
 		 705 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.43 
 
 		 691 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.1 
 
 		 683 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0593  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.05 
 
 		 708 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001866  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.15 
 
 		 689 aa  415  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0722  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.11 
 
 		 684 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000137671  hitchhiker  0.00000253506 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.03 
 
 		 690 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.77 
 
 		 697 aa  413  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0568  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.11 
 
 		 684 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.457538  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.55 
 
 		 691 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.77 
 
 		 684 aa  411  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.55 
 
 		 690 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.87 
 
 		 712 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.88 
 
 		 829 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.11 
 
 		 817 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.13 
 
 		 696 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.55 
 
 		 696 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.74 
 
 		 705 aa  412  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.64 
 
 		 691 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.25 
 
 		 690 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.4 
 
 		 696 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.72 
 
 		 686 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.94 
 
 		 691 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.18 
 
 		 737 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.81 
 
 		 691 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.85 
 
 		 691 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.4 
 
 		 696 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3863  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.1 
 
 		 693 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1011  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.27 
 
 		 746 aa  405  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.58 
 
 		 693 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.16 
 
 		 818 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0690  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.64 
 
 		 675 aa  405  1e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.100284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.46 
 
 		 696 aa  405  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0059  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.1 
 
 		 693 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.69 
 
 		 717 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.64 
 
 		 696 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>