More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4082 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.33 
 
 		 704 aa  669    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.6 
 
 		 694 aa  693    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.63 
 
 		 729 aa  679    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.78 
 
 		 706 aa  685    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.14 
 
 		 701 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.57 
 
 		 701 aa  670    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.36 
 
 		 686 aa  660    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.21 
 
 		 729 aa  683    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.02 
 
 		 696 aa  822    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.49 
 
 		 729 aa  676    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  51.29 
 
 		 699 aa  654    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.35 
 
 		 702 aa  690    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.71 
 
 		 790 aa  688    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.9 
 
 		 695 aa  844    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.04 
 
 		 695 aa  853    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 697 aa  1375    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.43 
 
 		 690 aa  648    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.71 
 
 		 701 aa  671    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  52.84 
 
 		 728 aa  644    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.63 
 
 		 700 aa  818    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.5 
 
 		 700 aa  641    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.64 
 
 		 706 aa  679    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  52.57 
 
 		 699 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.81 
 
 		 695 aa  879    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.05 
 
 		 704 aa  658    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  52.5 
 
 		 727 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.72 
 
 		 697 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.64 
 
 		 706 aa  680    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.79 
 
 		 696 aa  827    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.35 
 
 		 700 aa  655    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.07 
 
 		 750 aa  672    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.7 
 
 		 702 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.95 
 
 		 731 aa  660    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.22 
 
 		 694 aa  632  1e-180  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  51.14 
 
 		 699 aa  627  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  50.22 
 
 		 685 aa  622  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.54 
 
 		 723 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.56 
 
 		 691 aa  580  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50.28 
 
 		 701 aa  565  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.63 
 
 		 703 aa  560  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.5 
 
 		 709 aa  540  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.99 
 
 		 673 aa  513  1e-144  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.39 
 
 		 679 aa  502  1e-140  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  39.49 
 
 		 678 aa  494  9.999999999999999e-139  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.11 
 
 		 772 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.53 
 
 		 717 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.85 
 
 		 691 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.53 
 
 		 765 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.97 
 
 		 772 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.02 
 
 		 712 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.1 
 
 		 691 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.76 
 
 		 686 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.67 
 
 		 691 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.28 
 
 		 692 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.58 
 
 		 692 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.96 
 
 		 829 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.04 
 
 		 693 aa  462  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.06 
 
 		 691 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.43 
 
 		 692 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.51 
 
 		 700 aa  457  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.28 
 
 		 692 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.81 
 
 		 767 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.36 
 
 		 704 aa  453  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.67 
 
 		 691 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.98 
 
 		 691 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.21 
 
 		 691 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.06 
 
 		 681 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.36 
 
 		 704 aa  453  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0065  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.75 
 
 		 691 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.52 
 
 		 690 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00158  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.11 
 
 		 690 aa  451  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.13 
 
 		 696 aa  451  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.34 
 
 		 778 aa  450  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2025  ATP-dependent DNA helicase RecG  42 
 
 		 691 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.77 
 
 		 717 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.52 
 
 		 690 aa  449  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.27 
 
 		 705 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.51 
 
 		 691 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.51 
 
 		 696 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.58 
 
 		 703 aa  442  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.37 
 
 		 696 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0201  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.75 
 
 		 691 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.33 
 
 		 693 aa  445  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.05 
 
 		 681 aa  443  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.37 
 
 		 696 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6122  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.28 
 
 		 691 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.72 
 
 		 688 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.73 
 
 		 728 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.71 
 
 		 684 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.11 
 
 		 737 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.36 
 
 		 690 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  39 
 
 		 747 aa  442  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70570  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.94 
 
 		 691 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.72 
 
 		 696 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.4 
 
 		 698 aa  439  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.68 
 
 		 693 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.03 
 
 		 693 aa  437  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.36 
 
 		 696 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.27 
 
 		 696 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.33 
 
 		 676 aa  438  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>