More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1320 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.09 
 
 		 701 aa  757    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.22 
 
 		 729 aa  808    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.37 
 
 		 701 aa  763    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.07 
 
 		 694 aa  781    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.64 
 
 		 706 aa  812    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  69.79 
 
 		 690 aa  924    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.45 
 
 		 729 aa  807    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.04 
 
 		 696 aa  684    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.34 
 
 		 704 aa  796    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.95 
 
 		 697 aa  685    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.63 
 
 		 702 aa  750    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  57.65 
 
 		 699 aa  773    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.36 
 
 		 706 aa  806    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 731 aa  1454    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.45 
 
 		 695 aa  694    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.27 
 
 		 750 aa  797    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.92 
 
 		 697 aa  796    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.78 
 
 		 706 aa  811    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.34 
 
 		 700 aa  727    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.54 
 
 		 701 aa  724    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.84 
 
 		 703 aa  643    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.5 
 
 		 729 aa  810    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.03 
 
 		 695 aa  721    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  60.53 
 
 		 728 aa  770    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.95 
 
 		 790 aa  747    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.73 
 
 		 700 aa  720    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  58.92 
 
 		 699 aa  745    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.41 
 
 		 700 aa  759    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  60.25 
 
 		 727 aa  769    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  59.07 
 
 		 699 aa  749    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.31 
 
 		 695 aa  706    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.77 
 
 		 696 aa  678    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.48 
 
 		 704 aa  804    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.22 
 
 		 702 aa  741    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.13 
 
 		 694 aa  660    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.19 
 
 		 686 aa  654    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.15 
 
 		 691 aa  612  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.29 
 
 		 723 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  50.49 
 
 		 685 aa  603  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.79 
 
 		 709 aa  566  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50.21 
 
 		 701 aa  561  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.42 
 
 		 673 aa  528  1e-148  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  40.12 
 
 		 678 aa  519  1e-146  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.9 
 
 		 679 aa  521  1e-146  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.36 
 
 		 686 aa  480  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.43 
 
 		 765 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.13 
 
 		 772 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.06 
 
 		 772 aa  477  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2025  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.1 
 
 		 691 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.56 
 
 		 690 aa  470  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.87 
 
 		 693 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.45 
 
 		 686 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.56 
 
 		 690 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.67 
 
 		 767 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.11 
 
 		 829 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.9 
 
 		 685 aa  468  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.04 
 
 		 693 aa  466  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.63 
 
 		 683 aa  464  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.65 
 
 		 697 aa  464  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.86 
 
 		 691 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.04 
 
 		 747 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.45 
 
 		 691 aa  458  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.79 
 
 		 712 aa  457  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.45 
 
 		 690 aa  457  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.1 
 
 		 690 aa  457  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.73 
 
 		 704 aa  456  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.73 
 
 		 704 aa  456  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.06 
 
 		 693 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.23 
 
 		 703 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.3 
 
 		 678 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0722  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.27 
 
 		 684 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000137671  hitchhiker  0.00000253506 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.73 
 
 		 685 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.51 
 
 		 776 aa  453  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.35 
 
 		 715 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.59 
 
 		 705 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.37 
 
 		 705 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0568  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.27 
 
 		 684 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.457538  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.55 
 
 		 778 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2711  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.89 
 
 		 671 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.43 
 
 		 688 aa  449  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.88 
 
 		 692 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.13 
 
 		 692 aa  450  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.51 
 
 		 696 aa  450  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.33 
 
 		 687 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.38589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3507  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.27 
 
 		 691 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.4 
 
 		 696 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.4 
 
 		 696 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.03 
 
 		 715 aa  452  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.4 
 
 		 696 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.01 
 
 		 714 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.35 
 
 		 693 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.55 
 
 		 696 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.3 
 
 		 728 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1787  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.95 
 
 		 671 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03461  hypothetical protein  41.15 
 
 		 693 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.29 
 
 		 693 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  45 
 
 		 691 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.58 
 
 		 696 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.8 
 
 		 681 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.29 
 
 		 682 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>