More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0356 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.62 
 
 		 715 aa  842    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.12 
 
 		 692 aa  656    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.29 
 
 		 691 aa  655    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3737  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.46 
 
 		 665 aa  729    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  64.22 
 
 		 684 aa  829    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2711  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.28 
 
 		 671 aa  805    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.27 
 
 		 692 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.1 
 
 		 693 aa  635    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0065  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.45 
 
 		 691 aa  653    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.04 
 
 		 691 aa  641    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2389  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.26 
 
 		 686 aa  790    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0201  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.3 
 
 		 691 aa  650    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 683 aa  1377    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0322  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.86 
 
 		 715 aa  746    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.732592  normal  0.0359852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.72 
 
 		 686 aa  669    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.05 
 
 		 728 aa  832    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0593  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.7 
 
 		 708 aa  731    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.79 
 
 		 678 aa  784    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0692  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.08 
 
 		 773 aa  750    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153149  normal  0.329538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5068  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.95 
 
 		 709 aa  710    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3368  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.26 
 
 		 866 aa  788    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.42 
 
 		 712 aa  641    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.4 
 
 		 691 aa  646    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0639  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.37 
 
 		 792 aa  772    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3812  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.21 
 
 		 777 aa  779    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1504  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.08 
 
 		 695 aa  739    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3359  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.26 
 
 		 902 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2335  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.82 
 
 		 750 aa  728    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.01 
 
 		 671 aa  702    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.338376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.16 
 
 		 691 aa  651    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2662  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.06 
 
 		 791 aa  762    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.139193 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2575  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.26 
 
 		 902 aa  791    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2523  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.79 
 
 		 740 aa  784    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174099  normal  0.914241 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.99 
 
 		 692 aa  810    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.97 
 
 		 692 aa  672    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.27 
 
 		 692 aa  654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1280  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.41 
 
 		 859 aa  788    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0697  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.84 
 
 		 832 aa  782    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.71 
 
 		 691 aa  647    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3688  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.53 
 
 		 747 aa  707    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0367  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.76 
 
 		 723 aa  736    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.469061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6122  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.44 
 
 		 691 aa  653    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.16 
 
 		 686 aa  831    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0468  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.98 
 
 		 731 aa  723    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3988  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.69 
 
 		 768 aa  775    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.31 
 
 		 697 aa  686    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.3 
 
 		 737 aa  822    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1787  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.05 
 
 		 671 aa  734    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3325  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.26 
 
 		 902 aa  787    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.97169  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0376  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.04 
 
 		 723 aa  739    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0240  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.86 
 
 		 771 aa  766    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.51 
 
 		 691 aa  661    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.49 
 
 		 691 aa  664    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.07 
 
 		 691 aa  635    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1167  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.26 
 
 		 902 aa  791    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0306  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.26 
 
 		 902 aa  791    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.18 
 
 		 693 aa  655    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.88 
 
 		 715 aa  832    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.37 
 
 		 785 aa  777    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70570  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.59 
 
 		 691 aa  656    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.07 
 
 		 696 aa  636    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0724  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.86 
 
 		 771 aa  766    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1011  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.18 
 
 		 746 aa  753    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.07 
 
 		 696 aa  633  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.93 
 
 		 696 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.93 
 
 		 690 aa  634  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.78 
 
 		 696 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.59 
 
 		 704 aa  631  1e-179  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.59 
 
 		 704 aa  631  1e-179  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.73 
 
 		 690 aa  631  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.93 
 
 		 688 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.96 
 
 		 690 aa  623  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4592  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.97 
 
 		 691 aa  622  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000346665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.93 
 
 		 696 aa  624  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.93 
 
 		 696 aa  623  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.93 
 
 		 696 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.96 
 
 		 690 aa  621  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.3 
 
 		 693 aa  619  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.19 
 
 		 691 aa  620  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.42 
 
 		 693 aa  617  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5025  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.42 
 
 		 693 aa  617  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.02 
 
 		 696 aa  616  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00158  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.29 
 
 		 690 aa  618  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4103  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.27 
 
 		 693 aa  616  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03509  ATP-dependent DNA helicase  49.27 
 
 		 693 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0053  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.12 
 
 		 693 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4496  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.7 
 
 		 693 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.55 
 
 		 691 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0059  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.42 
 
 		 693 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3863  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.42 
 
 		 693 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03461  hypothetical protein  49.27 
 
 		 693 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4976  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.85 
 
 		 697 aa  610  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.4 
 
 		 693 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.38 
 
 		 703 aa  608  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3987  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.12 
 
 		 693 aa  611  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.29 
 
 		 693 aa  612  1e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.07 
 
 		 705 aa  610  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.11 
 
 		 705 aa  610  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0037  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.22 
 
 		 693 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.11 
 
 		 693 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>