More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1011 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1787  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.4 
 
 		 671 aa  656    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.75 
 
 		 684 aa  675    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0376  ATP-dependent DNA helicase RecG  78.89 
 
 		 723 aa  1099    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2711  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.56 
 
 		 671 aa  723    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3359  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.84 
 
 		 902 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1504  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.28 
 
 		 695 aa  662    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2575  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.84 
 
 		 902 aa  727    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3325  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.84 
 
 		 902 aa  726    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.97169  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2389  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.84 
 
 		 686 aa  726    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681406  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.93 
 
 		 683 aa  764    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0306  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.84 
 
 		 902 aa  727    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.67 
 
 		 728 aa  757    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0322  ATP-dependent DNA helicase RecG  73.77 
 
 		 715 aa  1020    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.732592  normal  0.0359852 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.34 
 
 		 678 aa  672    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3368  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.84 
 
 		 866 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0639  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.3 
 
 		 792 aa  723    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3812  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.04 
 
 		 777 aa  724    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1167  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.84 
 
 		 902 aa  727    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0697  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.81 
 
 		 832 aa  737    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.02 
 
 		 715 aa  759    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.12 
 
 		 692 aa  713    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1280  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.19 
 
 		 859 aa  728    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0367  ATP-dependent DNA helicase RecG  78.89 
 
 		 723 aa  1098    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.469061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1011  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 746 aa  1503    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  64.41 
 
 		 671 aa  826    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.338376 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3688  ATP-dependent DNA helicase RecG  69.07 
 
 		 747 aa  982    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.07 
 
 		 686 aa  743    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0468  ATP-dependent DNA helicase RecG  72.53 
 
 		 731 aa  1003    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3988  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.01 
 
 		 768 aa  730    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.93 
 
 		 737 aa  766    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3737  ATP-dependent DNA helicase RecG  70.06 
 
 		 665 aa  890    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0240  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.04 
 
 		 771 aa  726    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0593  ATP-dependent DNA helicase RecG  82.55 
 
 		 708 aa  1145    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5068  ATP-dependent DNA helicase RecG  71.86 
 
 		 709 aa  966    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0692  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.04 
 
 		 773 aa  714    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153149  normal  0.329538 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.5 
 
 		 785 aa  726    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.23 
 
 		 715 aa  748    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2662  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.27 
 
 		 791 aa  720    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.139193 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2335  ATP-dependent DNA helicase RecG  79.11 
 
 		 750 aa  1052    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0724  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.04 
 
 		 771 aa  726    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2523  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.89 
 
 		 740 aa  736    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174099  normal  0.914241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.02 
 
 		 691 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.86 
 
 		 693 aa  610  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.92 
 
 		 686 aa  606  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.68 
 
 		 703 aa  604  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.66 
 
 		 691 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4871  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.86 
 
 		 693 aa  596  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708486  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.65 
 
 		 697 aa  596  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4976  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.07 
 
 		 697 aa  593  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.51 
 
 		 691 aa  593  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.29 
 
 		 693 aa  594  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.51 
 
 		 693 aa  589  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.53 
 
 		 696 aa  590  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.77 
 
 		 712 aa  588  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.67 
 
 		 690 aa  588  1e-167  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.53 
 
 		 696 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.39 
 
 		 696 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.29 
 
 		 692 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.39 
 
 		 691 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0041  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.28 
 
 		 693 aa  586  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4180  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.28 
 
 		 693 aa  586  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3507  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.57 
 
 		 691 aa  586  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.51 
 
 		 693 aa  587  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.39 
 
 		 696 aa  588  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0037  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.43 
 
 		 693 aa  587  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.24 
 
 		 691 aa  585  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4592  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.81 
 
 		 691 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000346665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.01 
 
 		 691 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.84 
 
 		 693 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.13 
 
 		 693 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.21 
 
 		 693 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4496  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.22 
 
 		 693 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4103  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.21 
 
 		 693 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.13 
 
 		 693 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.13 
 
 		 693 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5025  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.21 
 
 		 693 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.53 
 
 		 705 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.25 
 
 		 696 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03509  ATP-dependent DNA helicase  48.35 
 
 		 693 aa  581  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0053  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.21 
 
 		 693 aa  579  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0201  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.72 
 
 		 691 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3987  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.06 
 
 		 693 aa  579  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.99 
 
 		 693 aa  582  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03461  hypothetical protein  48.35 
 
 		 693 aa  581  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.39 
 
 		 696 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.25 
 
 		 696 aa  582  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.39 
 
 		 696 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.25 
 
 		 688 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3863  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.06 
 
 		 693 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.64 
 
 		 692 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.85 
 
 		 691 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  49 
 
 		 692 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0059  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.06 
 
 		 693 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.28 
 
 		 687 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.38589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.61 
 
 		 693 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.93 
 
 		 691 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00158  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.74 
 
 		 690 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  49 
 
 		 692 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.36 
 
 		 693 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.3 
 
 		 705 aa  575  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>