More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0724 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03509  ATP-dependent DNA helicase  52.89 
 
 
693 aa  644    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0053  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.89 
 
 
693 aa  643    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1011  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.18 
 
 
746 aa  737    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0697  ATP-dependent DNA helicase RecG  85.99 
 
 
832 aa  1173    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.88 
 
 
692 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1787  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.33 
 
 
671 aa  812    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.1 
 
 
696 aa  659    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.1 
 
 
696 aa  658    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5068  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.07 
 
 
709 aa  739    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2711  ATP-dependent DNA helicase RecG  71.36 
 
 
671 aa  914    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.1 
 
 
696 aa  658    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.26 
 
 
693 aa  645    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4496  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.11 
 
 
693 aa  643    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.73 
 
 
692 aa  686    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.94 
 
 
688 aa  638    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0065  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.23 
 
 
691 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.6 
 
 
692 aa  676    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3737  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.94 
 
 
665 aa  782    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1167  ATP-dependent DNA helicase RecG  88.19 
 
 
902 aa  1173    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2389  ATP-dependent DNA helicase RecG  87.9 
 
 
686 aa  1171    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681406  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.49 
 
 
693 aa  635    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5025  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.18 
 
 
693 aa  650    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0201  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.37 
 
 
691 aa  656    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  59 
 
 
683 aa  788    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3507  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.66 
 
 
691 aa  647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2662  ATP-dependent DNA helicase RecG  88.24 
 
 
791 aa  1292    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.139193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  72.23 
 
 
728 aa  981    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.26 
 
 
691 aa  648    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.82 
 
 
678 aa  752    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2523  ATP-dependent DNA helicase RecG  80.58 
 
 
740 aa  1165    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174099  normal  0.914241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.59 
 
 
692 aa  669    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3368  ATP-dependent DNA helicase RecG  88.34 
 
 
866 aa  1175    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  72.05 
 
 
715 aa  937    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.62 
 
 
691 aa  669    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.12 
 
 
693 aa  665    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0639  ATP-dependent DNA helicase RecG  91.99 
 
 
792 aa  1347    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3812  ATP-dependent DNA helicase RecG  94.72 
 
 
777 aa  1368    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.89 
 
 
693 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3863  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.18 
 
 
693 aa  645    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6122  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.4 
 
 
691 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.75 
 
 
693 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.75 
 
 
693 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.99 
 
 
690 aa  646    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3359  ATP-dependent DNA helicase RecG  88.34 
 
 
902 aa  1175    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2575  ATP-dependent DNA helicase RecG  88.19 
 
 
902 aa  1173    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1504  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.25 
 
 
695 aa  805    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.44 
 
 
692 aa  790    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0306  ATP-dependent DNA helicase RecG  88.19 
 
 
902 aa  1173    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1280  ATP-dependent DNA helicase RecG  87.9 
 
 
859 aa  1176    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.93 
 
 
671 aa  774    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.338376 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.9 
 
 
684 aa  780    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0087  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.46 
 
 
693 aa  636    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0593  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.26 
 
 
708 aa  751    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.94 
 
 
696 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3688  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.41 
 
 
747 aa  729    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03461  hypothetical protein  52.89 
 
 
693 aa  644    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.54 
 
 
691 aa  670    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.38 
 
 
686 aa  784    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0468  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.7 
 
 
731 aa  724    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3988  ATP-dependent DNA helicase RecG  86.29 
 
 
768 aa  1168    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.66 
 
 
691 aa  644    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0367  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.26 
 
 
723 aa  746    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.469061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.28 
 
 
697 aa  639    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  70.25 
 
 
715 aa  946    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  69.43 
 
 
737 aa  969    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.89 
 
 
693 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3325  ATP-dependent DNA helicase RecG  88.19 
 
 
902 aa  1173    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.97169  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4103  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.18 
 
 
693 aa  650    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0240  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
771 aa  1535    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.16 
 
 
691 aa  652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2335  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.42 
 
 
750 aa  735    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0059  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.18 
 
 
693 aa  645    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.24 
 
 
696 aa  660    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0376  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.1 
 
 
723 aa  742    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.1 
 
 
691 aa  657    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3987  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.18 
 
 
693 aa  648    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.23 
 
 
696 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.94 
 
 
696 aa  639    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.01 
 
 
686 aa  665    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.37 
 
 
705 aa  641    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.18 
 
 
693 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  92.68 
 
 
785 aa  1390    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70570  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.56 
 
 
691 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.94 
 
 
691 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0322  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.31 
 
 
715 aa  748    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.732592  normal  0.0359852 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0692  ATP-dependent DNA helicase RecG  99.48 
 
 
773 aa  1527    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153149  normal  0.329538 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.83 
 
 
691 aa  670    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.62 
 
 
693 aa  647    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0724  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
771 aa  1535    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.23 
 
 
696 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.89 
 
 
693 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.63 
 
 
691 aa  645    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0037  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.75 
 
 
693 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.7 
 
 
717 aa  631  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0041  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.61 
 
 
693 aa  631  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4180  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.61 
 
 
693 aa  631  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00158  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.95 
 
 
690 aa  630  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4871  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.74 
 
 
693 aa  630  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708486  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.32 
 
 
693 aa  629  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.09 
 
 
691 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>