More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1019 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.98 
 
 		 779 aa  847    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.19 
 
 		 763 aa  851    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.66 
 
 		 773 aa  950    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 776 aa  1576    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.42 
 
 		 781 aa  619  1e-176  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.17 
 
 		 779 aa  595  1e-168  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.27 
 
 		 683 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.96 
 
 		 689 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.95 
 
 		 694 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.66 
 
 		 681 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.26 
 
 		 685 aa  572  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.22 
 
 		 685 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.34 
 
 		 680 aa  547  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.26 
 
 		 818 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.46 
 
 		 786 aa  538  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.13 
 
 		 692 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.75 
 
 		 819 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.75 
 
 		 819 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.07 
 
 		 817 aa  530  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.78 
 
 		 772 aa  531  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.76 
 
 		 778 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.88 
 
 		 679 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.65 
 
 		 772 aa  527  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.73 
 
 		 717 aa  524  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.48 
 
 		 765 aa  524  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.27 
 
 		 815 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.75 
 
 		 767 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.07 
 
 		 827 aa  516  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.28 
 
 		 714 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.91 
 
 		 827 aa  512  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.86 
 
 		 682 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.78 
 
 		 700 aa  509  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.56 
 
 		 829 aa  511  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.15 
 
 		 740 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  41.04 
 
 		 818 aa  508  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.85 
 
 		 688 aa  506  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  42 
 
 		 682 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.85 
 
 		 682 aa  503  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  42 
 
 		 682 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.89 
 
 		 682 aa  502  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.85 
 
 		 682 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.85 
 
 		 682 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.01 
 
 		 805 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.85 
 
 		 682 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.74 
 
 		 682 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  42 
 
 		 685 aa  502  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.84 
 
 		 818 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.04 
 
 		 682 aa  498  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.88 
 
 		 712 aa  498  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.41 
 
 		 695 aa  498  1e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.4 
 
 		 702 aa  498  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.52 
 
 		 822 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.47 
 
 		 822 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1139  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.77 
 
 		 776 aa  495  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00836981  normal  0.0179484 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1984  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.92 
 
 		 690 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.28 
 
 		 657 aa  490  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.33 
 
 		 812 aa  489  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.91 
 
 		 682 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.17 
 
 		 818 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.35 
 
 		 772 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.27 
 
 		 818 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.18 
 
 		 706 aa  484  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.67 
 
 		 706 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.46 
 
 		 686 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1330  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.28 
 
 		 678 aa  484  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1162  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.27 
 
 		 678 aa  484  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000110827  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.9 
 
 		 678 aa  485  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.77 
 
 		 691 aa  482  1e-134  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.74 
 
 		 704 aa  479  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.39 
 
 		 862 aa  481  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.62 
 
 		 846 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.18 
 
 		 818 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.77 
 
 		 679 aa  481  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.98 
 
 		 694 aa  476  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.34 
 
 		 846 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.2 
 
 		 904 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.88 
 
 		 706 aa  477  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.97 
 
 		 815 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.65 
 
 		 753 aa  476  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.69 
 
 		 696 aa  477  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0449  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.71 
 
 		 676 aa  478  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0217624  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.65 
 
 		 698 aa  473  1e-132  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.45 
 
 		 719 aa  474  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  40.17 
 
 		 700 aa  474  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.88 
 
 		 703 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.18 
 
 		 686 aa  475  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.9 
 
 		 693 aa  475  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.97 
 
 		 707 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.34 
 
 		 846 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.35 
 
 		 904 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.47 
 
 		 702 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.87 
 
 		 842 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.31 
 
 		 692 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.74 
 
 		 687 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.38589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.75 
 
 		 787 aa  470  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.9 
 
 		 704 aa  472  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.75 
 
 		 704 aa  470  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  40 
 
 		 689 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.62 
 
 		 691 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.42 
 
 		 690 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>