More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2620 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.81 
 
 		 729 aa  728    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.86 
 
 		 694 aa  748    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.18 
 
 		 704 aa  736    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.25 
 
 		 731 aa  753    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  89.71 
 
 		 700 aa  1201    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.7 
 
 		 706 aa  783    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.26 
 
 		 706 aa  790    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.55 
 
 		 706 aa  780    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  80.63 
 
 		 700 aa  1080    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.93 
 
 		 695 aa  660    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.5 
 
 		 697 aa  658    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  82.55 
 
 		 699 aa  1151    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.4 
 
 		 790 aa  744    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.79 
 
 		 695 aa  637    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.48 
 
 		 729 aa  733    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.43 
 
 		 702 aa  717    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.37 
 
 		 697 aa  812    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.92 
 
 		 701 aa  748    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.7 
 
 		 701 aa  747    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.78 
 
 		 701 aa  754    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  89.97 
 
 		 728 aa  1238    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.43 
 
 		 700 aa  667    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  85.12 
 
 		 699 aa  1123    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 727 aa  1442    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  84.84 
 
 		 699 aa  1139    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.18 
 
 		 704 aa  737    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.91 
 
 		 750 aa  733    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.98 
 
 		 702 aa  728    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.65 
 
 		 695 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.21 
 
 		 686 aa  649    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.64 
 
 		 696 aa  646    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.95 
 
 		 729 aa  729    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.29 
 
 		 694 aa  649    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.43 
 
 		 690 aa  760    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.43 
 
 		 696 aa  611  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.74 
 
 		 703 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.78 
 
 		 691 aa  598  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  47.93 
 
 		 685 aa  582  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.56 
 
 		 723 aa  556  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.64 
 
 		 701 aa  555  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.52 
 
 		 709 aa  546  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.5 
 
 		 673 aa  504  1e-141  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  41.3 
 
 		 678 aa  505  1e-141  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.44 
 
 		 679 aa  497  1e-139  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.24 
 
 		 686 aa  492  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.09 
 
 		 686 aa  485  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.24 
 
 		 683 aa  485  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1280  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.13 
 
 		 859 aa  475  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.01 
 
 		 705 aa  473  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3325  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.54 
 
 		 902 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.97169  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2389  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.6 
 
 		 686 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3368  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.54 
 
 		 866 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1167  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.54 
 
 		 902 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0306  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.54 
 
 		 902 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2575  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.54 
 
 		 902 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3359  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.54 
 
 		 902 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2523  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.64 
 
 		 740 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174099  normal  0.914241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.56 
 
 		 737 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.11 
 
 		 703 aa  469  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2662  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.43 
 
 		 791 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.139193 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.71 
 
 		 747 aa  462  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.18 
 
 		 691 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  40 
 
 		 765 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.54 
 
 		 785 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.98 
 
 		 704 aa  458  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.88 
 
 		 717 aa  458  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0697  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.43 
 
 		 832 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.98 
 
 		 704 aa  459  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.56 
 
 		 715 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.67 
 
 		 684 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.98 
 
 		 693 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  41 
 
 		 690 aa  453  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.15 
 
 		 728 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3812  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.15 
 
 		 777 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0639  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.1 
 
 		 792 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.01 
 
 		 697 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0322  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.55 
 
 		 715 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.732592  normal  0.0359852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0376  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.33 
 
 		 723 aa  455  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0367  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.48 
 
 		 723 aa  455  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.469061  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.34 
 
 		 715 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.43 
 
 		 690 aa  451  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1011  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.31 
 
 		 746 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.55 
 
 		 691 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.31 
 
 		 767 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3988  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.02 
 
 		 768 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0240  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.56 
 
 		 771 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0724  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.56 
 
 		 771 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.47 
 
 		 678 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3737  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.78 
 
 		 665 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.15 
 
 		 691 aa  448  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2711  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.94 
 
 		 671 aa  445  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.52 
 
 		 691 aa  443  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.41 
 
 		 692 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.2 
 
 		 829 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.05 
 
 		 692 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.84 
 
 		 691 aa  445  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3717  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.66 
 
 		 695 aa  442  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.46 
 
 		 691 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0593  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.25 
 
 		 708 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.5 
 
 		 691 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>