More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1728 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.7 
 
 		 695 aa  696    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.97 
 
 		 686 aa  673    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.51 
 
 		 706 aa  736    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.26 
 
 		 729 aa  675    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.47 
 
 		 697 aa  687    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  54.8 
 
 		 699 aa  691    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.87 
 
 		 691 aa  649    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.41 
 
 		 695 aa  671    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.04 
 
 		 690 aa  674    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.74 
 
 		 700 aa  666    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.46 
 
 		 701 aa  723    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.33 
 
 		 790 aa  693    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.66 
 
 		 704 aa  689    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 703 aa  1370    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  55.02 
 
 		 728 aa  659    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  53.4 
 
 		 685 aa  641    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.63 
 
 		 700 aa  657    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.82 
 
 		 750 aa  684    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  54.88 
 
 		 699 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  55.63 
 
 		 727 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  54.46 
 
 		 699 aa  661    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.46 
 
 		 704 aa  687    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.02 
 
 		 701 aa  729    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.06 
 
 		 696 aa  669    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.59 
 
 		 702 aa  682    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.19 
 
 		 694 aa  791    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.37 
 
 		 706 aa  738    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.27 
 
 		 696 aa  659    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.33 
 
 		 694 aa  721    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.88 
 
 		 700 aa  664    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.51 
 
 		 701 aa  702    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.54 
 
 		 729 aa  673    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.27 
 
 		 695 aa  681    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.37 
 
 		 706 aa  734    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.84 
 
 		 731 aa  682    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.75 
 
 		 702 aa  689    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.54 
 
 		 729 aa  674    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  54.37 
 
 		 701 aa  622  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.85 
 
 		 697 aa  620  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.5 
 
 		 723 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.65 
 
 		 709 aa  560  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.46 
 
 		 679 aa  548  1e-154  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.05 
 
 		 673 aa  535  1e-150  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  41.74 
 
 		 678 aa  531  1e-149  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.48 
 
 		 691 aa  502  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.55 
 
 		 693 aa  482  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.71 
 
 		 686 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.71 
 
 		 767 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.26 
 
 		 697 aa  483  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03509  ATP-dependent DNA helicase  45.15 
 
 		 693 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3863  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.01 
 
 		 693 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0059  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.01 
 
 		 693 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.55 
 
 		 683 aa  477  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03461  hypothetical protein  45.15 
 
 		 693 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3987  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.15 
 
 		 693 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0053  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.01 
 
 		 693 aa  474  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.5 
 
 		 704 aa  474  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.5 
 
 		 704 aa  474  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.27 
 
 		 717 aa  474  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5025  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.01 
 
 		 693 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.75 
 
 		 772 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.03 
 
 		 829 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4103  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.01 
 
 		 693 aa  474  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.01 
 
 		 693 aa  475  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.18 
 
 		 772 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.42 
 
 		 690 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.65 
 
 		 685 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.26 
 
 		 690 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.47 
 
 		 684 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.41 
 
 		 705 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4496  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.77 
 
 		 693 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4180  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.52 
 
 		 693 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.26 
 
 		 691 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0041  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.52 
 
 		 693 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.48 
 
 		 693 aa  469  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.99 
 
 		 693 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.24 
 
 		 691 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0037  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.66 
 
 		 693 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.05 
 
 		 703 aa  468  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.34 
 
 		 765 aa  463  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.52 
 
 		 682 aa  465  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.52 
 
 		 682 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.38 
 
 		 682 aa  463  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.67 
 
 		 685 aa  463  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.19 
 
 		 704 aa  465  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.82 
 
 		 693 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.12 
 
 		 678 aa  465  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.5 
 
 		 693 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.3 
 
 		 712 aa  464  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.52 
 
 		 682 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.46 
 
 		 682 aa  465  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.52 
 
 		 682 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.85 
 
 		 693 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.56 
 
 		 693 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.67 
 
 		 682 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.13 
 
 		 693 aa  462  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4871  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.5 
 
 		 693 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708486  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.7 
 
 		 693 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.88 
 
 		 705 aa  463  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.85 
 
 		 693 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>