More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1704 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.56 
 
 		 695 aa  696    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.13 
 
 		 690 aa  730    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.14 
 
 		 691 aa  665    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.39 
 
 		 790 aa  899    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  67.95 
 
 		 706 aa  981    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.82 
 
 		 704 aa  724    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.39 
 
 		 701 aa  906    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.28 
 
 		 695 aa  693    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  56.98 
 
 		 699 aa  770    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.33 
 
 		 694 aa  767    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.13 
 
 		 695 aa  685    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.92 
 
 		 729 aa  735    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  67.66 
 
 		 706 aa  976    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.4 
 
 		 702 aa  862    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.7 
 
 		 696 aa  686    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.28 
 
 		 750 aa  711    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.24 
 
 		 703 aa  637    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.17 
 
 		 700 aa  723    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.67 
 
 		 704 aa  732    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.39 
 
 		 701 aa  877    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  56.76 
 
 		 728 aa  731    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.93 
 
 		 700 aa  663    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.78 
 
 		 729 aa  734    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  57.55 
 
 		 699 aa  734    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  67.24 
 
 		 706 aa  970    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  55.98 
 
 		 727 aa  724    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  57.26 
 
 		 699 aa  742    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.57 
 
 		 696 aa  671    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 702 aa  1404    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.13 
 
 		 697 aa  740    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.22 
 
 		 731 aa  723    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.5 
 
 		 729 aa  733    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.17 
 
 		 701 aa  905    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.49 
 
 		 694 aa  685    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.19 
 
 		 700 aa  725    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.7 
 
 		 697 aa  657    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.08 
 
 		 723 aa  623  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.01 
 
 		 686 aa  619  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  47.26 
 
 		 685 aa  579  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.01 
 
 		 709 aa  561  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  41.76 
 
 		 678 aa  538  1e-151  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.07 
 
 		 679 aa  537  1e-151  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.5 
 
 		 701 aa  535  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.79 
 
 		 673 aa  520  1e-146  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.51 
 
 		 686 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.59 
 
 		 704 aa  492  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.59 
 
 		 704 aa  492  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.76 
 
 		 693 aa  484  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0322  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.74 
 
 		 715 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.732592  normal  0.0359852 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.37 
 
 		 686 aa  480  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.57 
 
 		 683 aa  475  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.9 
 
 		 697 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.43 
 
 		 717 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.23 
 
 		 705 aa  474  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.19 
 
 		 678 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.52 
 
 		 691 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.93 
 
 		 693 aa  463  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2025  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.13 
 
 		 691 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.89 
 
 		 690 aa  460  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  42 
 
 		 692 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0037  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.15 
 
 		 693 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.99 
 
 		 690 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.48 
 
 		 703 aa  462  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.67 
 
 		 692 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4180  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.01 
 
 		 693 aa  458  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.36 
 
 		 693 aa  458  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0041  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.01 
 
 		 693 aa  458  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.74 
 
 		 690 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.15 
 
 		 691 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.94 
 
 		 693 aa  459  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.67 
 
 		 692 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.35 
 
 		 684 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1011  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.04 
 
 		 746 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4871  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.69 
 
 		 693 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708486  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.68 
 
 		 696 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.85 
 
 		 693 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.48 
 
 		 728 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.81 
 
 		 693 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.3 
 
 		 712 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0568  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.92 
 
 		 684 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.457538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0722  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.92 
 
 		 684 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000137671  hitchhiker  0.00000253506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.12 
 
 		 737 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.56 
 
 		 691 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.72 
 
 		 765 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  40 
 
 		 747 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.57 
 
 		 693 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0367  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.37 
 
 		 723 aa  451  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.469061  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.27 
 
 		 692 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.07 
 
 		 691 aa  452  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.71 
 
 		 693 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0468  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.94 
 
 		 731 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.85 
 
 		 693 aa  452  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.71 
 
 		 693 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.35 
 
 		 691 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  43 
 
 		 693 aa  452  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4496  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.35 
 
 		 693 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0376  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.24 
 
 		 723 aa  449  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.41 
 
 		 693 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001866  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.11 
 
 		 689 aa  449  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.69 
 
 		 690 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>