More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2363 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.5 
 
 		 695 aa  693    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.53 
 
 		 706 aa  918    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  77.18 
 
 		 701 aa  1111    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.02 
 
 		 729 aa  690    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  77.03 
 
 		 701 aa  1115    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.2 
 
 		 704 aa  681    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.02 
 
 		 729 aa  697    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  53.35 
 
 		 699 aa  717    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.35 
 
 		 697 aa  708    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 790 aa  1596    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.64 
 
 		 695 aa  685    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.5 
 
 		 696 aa  680    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.05 
 
 		 690 aa  717    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.39 
 
 		 706 aa  913    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.12 
 
 		 700 aa  692    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.56 
 
 		 694 aa  748    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.42 
 
 		 700 aa  684    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  54.89 
 
 		 728 aa  687    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.88 
 
 		 729 aa  690    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.5 
 
 		 700 aa  657    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  55.06 
 
 		 699 aa  690    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  54.4 
 
 		 727 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.62 
 
 		 704 aa  692    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  53.07 
 
 		 699 aa  678    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.68 
 
 		 706 aa  916    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.95 
 
 		 731 aa  702    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.49 
 
 		 696 aa  676    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.71 
 
 		 697 aa  665    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.39 
 
 		 702 aa  863    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  75.04 
 
 		 701 aa  1085    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.42 
 
 		 694 aa  701    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.27 
 
 		 702 aa  809    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.78 
 
 		 695 aa  693    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.81 
 
 		 750 aa  680    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.08 
 
 		 686 aa  632  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 		 691 aa  622  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.19 
 
 		 703 aa  618  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  48.51 
 
 		 685 aa  598  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.56 
 
 		 723 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.22 
 
 		 701 aa  560  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.33 
 
 		 709 aa  551  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.73 
 
 		 679 aa  534  1e-150  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.9 
 
 		 673 aa  527  1e-148  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  40.72 
 
 		 678 aa  525  1e-147  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.72 
 
 		 693 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.53 
 
 		 765 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03509  ATP-dependent DNA helicase  43.56 
 
 		 693 aa  492  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0053  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.56 
 
 		 693 aa  491  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.73 
 
 		 691 aa  491  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.27 
 
 		 693 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3863  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.42 
 
 		 693 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0059  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.42 
 
 		 693 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3987  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.27 
 
 		 693 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.7 
 
 		 686 aa  491  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03461  hypothetical protein  43.56 
 
 		 693 aa  492  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4103  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.45 
 
 		 693 aa  489  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4180  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.5 
 
 		 693 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5025  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.45 
 
 		 693 aa  488  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.21 
 
 		 691 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.32 
 
 		 686 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0037  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.5 
 
 		 693 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0041  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.5 
 
 		 693 aa  488  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.11 
 
 		 693 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.99 
 
 		 772 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.47 
 
 		 693 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.23 
 
 		 696 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.32 
 
 		 693 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.87 
 
 		 767 aa  481  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.51 
 
 		 693 aa  479  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.38 
 
 		 704 aa  480  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.23 
 
 		 696 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.38 
 
 		 704 aa  480  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4496  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.96 
 
 		 693 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.23 
 
 		 691 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.4 
 
 		 705 aa  481  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.47 
 
 		 693 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.23 
 
 		 696 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.44 
 
 		 691 aa  479  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.48 
 
 		 778 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4871  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.65 
 
 		 693 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708486  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.46 
 
 		 829 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.47 
 
 		 693 aa  479  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.12 
 
 		 691 aa  479  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.32 
 
 		 693 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0087  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.26 
 
 		 693 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.67 
 
 		 705 aa  477  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.94 
 
 		 696 aa  478  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.94 
 
 		 688 aa  475  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.38 
 
 		 717 aa  475  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.21 
 
 		 690 aa  473  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4592  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.12 
 
 		 691 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000346665 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.2 
 
 		 693 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.82 
 
 		 693 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  42 
 
 		 696 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.9 
 
 		 827 aa  474  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.5 
 
 		 696 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.5 
 
 		 696 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.64 
 
 		 696 aa  475  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.14 
 
 		 692 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3507  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.48 
 
 		 691 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>