More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4415 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.87 
 
 
729 aa  724    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.65 
 
 
695 aa  651    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
697 aa  1374    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.55 
 
 
706 aa  757    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.47 
 
 
750 aa  729    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.59 
 
 
729 aa  723    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.78 
 
 
701 aa  709    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.13 
 
 
706 aa  750    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  59.8 
 
 
699 aa  803    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.83 
 
 
704 aa  722    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.65 
 
 
695 aa  646    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.92 
 
 
701 aa  726    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.65 
 
 
694 aa  726    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.51 
 
 
695 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  59.14 
 
 
728 aa  756    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.5 
 
 
700 aa  649    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  59.23 
 
 
699 aa  761    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.41 
 
 
706 aa  753    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  59.37 
 
 
727 aa  771    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  60.52 
 
 
699 aa  786    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.92 
 
 
731 aa  752    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.72 
 
 
702 aa  679    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.64 
 
 
701 aa  730    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.13 
 
 
702 aa  706    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.5 
 
 
686 aa  635    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.12 
 
 
704 aa  721    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.57 
 
 
690 aa  721    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.79 
 
 
694 aa  649    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.49 
 
 
700 aa  761    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.16 
 
 
729 aa  733    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.35 
 
 
790 aa  708    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.86 
 
 
700 aa  756    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.72 
 
 
697 aa  627  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.51 
 
 
696 aa  617  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.14 
 
 
696 aa  606  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.47 
 
 
703 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  48.57 
 
 
685 aa  586  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.93 
 
 
691 aa  579  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.14 
 
 
701 aa  561  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 
723 aa  559  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.45 
 
 
709 aa  551  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.86 
 
 
679 aa  531  1e-149  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  40.75 
 
 
678 aa  525  1e-148  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.3 
 
 
673 aa  523  1e-147  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.18 
 
 
705 aa  460  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.02 
 
 
772 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.07 
 
 
765 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.42 
 
 
829 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.32 
 
 
686 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.65 
 
 
772 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.76 
 
 
767 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.01 
 
 
691 aa  452  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0690  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.51 
 
 
675 aa  446  1.0000000000000001e-124  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.100284  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.36 
 
 
686 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.01 
 
 
778 aa  445  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.54 
 
 
712 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.79 
 
 
690 aa  440  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.89 
 
 
691 aa  442  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.26 
 
 
684 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.68 
 
 
818 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.96 
 
 
692 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.5 
 
 
690 aa  437  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.12 
 
 
685 aa  435  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2711  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.84 
 
 
671 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4976  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.95 
 
 
697 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.84 
 
 
704 aa  433  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.99 
 
 
717 aa  432  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.37 
 
 
776 aa  435  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.29 
 
 
717 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0639  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.88 
 
 
792 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.25 
 
 
818 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2662  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.36 
 
 
791 aa  432  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.139193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.09 
 
 
785 aa  432  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.96 
 
 
692 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.86 
 
 
715 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.56 
 
 
693 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.4 
 
 
691 aa  428  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.51 
 
 
728 aa  429  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3812  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.63 
 
 
777 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.34 
 
 
693 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.95 
 
 
691 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.12 
 
 
819 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.11 
 
 
737 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.67 
 
 
692 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.65 
 
 
747 aa  427  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0722  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.75 
 
 
684 aa  423  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000137671  hitchhiker  0.00000253506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.97 
 
 
819 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3863  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.01 
 
 
693 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.79 
 
 
682 aa  423  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0059  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.01 
 
 
693 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.73 
 
 
678 aa  423  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0568  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.75 
 
 
684 aa  423  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.457538  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.79 
 
 
682 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.11 
 
 
818 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.81 
 
 
715 aa  425  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1280  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.25 
 
 
859 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0240  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.35 
 
 
771 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.1 
 
 
691 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.41 
 
 
689 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0724  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.35 
 
 
771 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>