More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1510 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.74 
 
 		 704 aa  706    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.55 
 
 		 729 aa  686    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.78 
 
 		 701 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.93 
 
 		 700 aa  660    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.51 
 
 		 697 aa  648    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.42 
 
 		 702 aa  665    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.56 
 
 		 706 aa  717    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.64 
 
 		 701 aa  688    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.73 
 
 		 750 aa  689    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.5 
 
 		 790 aa  706    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  51.29 
 
 		 699 aa  668    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 696 aa  1378    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.59 
 
 		 695 aa  889    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.64 
 
 		 701 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.04 
 
 		 731 aa  665    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.4 
 
 		 729 aa  696    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.22 
 
 		 690 aa  664    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  53.08 
 
 		 728 aa  657    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.89 
 
 		 704 aa  691    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  67.1 
 
 		 700 aa  920    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.28 
 
 		 706 aa  712    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  53.08 
 
 		 699 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  52.64 
 
 		 727 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  51.65 
 
 		 699 aa  646    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.44 
 
 		 695 aa  905    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.93 
 
 		 694 aa  763    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.24 
 
 		 696 aa  899    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.55 
 
 		 729 aa  686    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.7 
 
 		 702 aa  688    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  67.44 
 
 		 695 aa  919    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.13 
 
 		 706 aa  711    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.66 
 
 		 686 aa  659    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.39 
 
 		 694 aa  700    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.13 
 
 		 691 aa  647    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.29 
 
 		 700 aa  654    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.02 
 
 		 697 aa  830    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.18 
 
 		 723 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.85 
 
 		 703 aa  610  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50.94 
 
 		 701 aa  579  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  47.56 
 
 		 685 aa  571  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.68 
 
 		 673 aa  535  1e-151  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.28 
 
 		 709 aa  535  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.5 
 
 		 679 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.29 
 
 		 767 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.31 
 
 		 772 aa  505  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  38.94 
 
 		 678 aa  503  1e-141  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.5 
 
 		 829 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.98 
 
 		 693 aa  497  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.65 
 
 		 772 aa  498  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.27 
 
 		 686 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.39 
 
 		 684 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.76 
 
 		 686 aa  490  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.43 
 
 		 696 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.42 
 
 		 690 aa  482  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.57 
 
 		 690 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.28 
 
 		 691 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.98 
 
 		 696 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  42 
 
 		 765 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.67 
 
 		 714 aa  481  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.84 
 
 		 696 aa  482  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.98 
 
 		 696 aa  482  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.16 
 
 		 691 aa  480  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.69 
 
 		 696 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.71 
 
 		 688 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.88 
 
 		 717 aa  478  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.64 
 
 		 696 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.37 
 
 		 705 aa  477  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.15 
 
 		 778 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.35 
 
 		 717 aa  474  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.2 
 
 		 696 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.35 
 
 		 696 aa  474  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.9 
 
 		 728 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.64 
 
 		 692 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.18 
 
 		 693 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.85 
 
 		 747 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4592  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.16 
 
 		 691 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000346665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.23 
 
 		 703 aa  468  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.98 
 
 		 690 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.67 
 
 		 691 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.14 
 
 		 737 aa  468  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.66 
 
 		 687 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.38589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.67 
 
 		 685 aa  467  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.38 
 
 		 700 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.94 
 
 		 705 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.01 
 
 		 681 aa  464  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.22 
 
 		 683 aa  461  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3507  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.54 
 
 		 691 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.9 
 
 		 691 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.73 
 
 		 691 aa  462  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  43 
 
 		 692 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0124  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.26 
 
 		 692 aa  458  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.86 
 
 		 692 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.93 
 
 		 693 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.43 
 
 		 712 aa  457  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5025  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.93 
 
 		 693 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3717  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.36 
 
 		 695 aa  456  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.45 
 
 		 685 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.56 
 
 		 693 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.15 
 
 		 691 aa  458  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.56 
 
 		 692 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>