More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1516 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.68 
 
 		 729 aa  646    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.99 
 
 		 701 aa  657    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.11 
 
 		 729 aa  653    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.96 
 
 		 694 aa  696    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.28 
 
 		 706 aa  645    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.5 
 
 		 701 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.28 
 
 		 706 aa  644    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.52 
 
 		 695 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.41 
 
 		 704 aa  641    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.36 
 
 		 697 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  51.5 
 
 		 699 aa  639    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 686 aa  1358    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.6 
 
 		 704 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.43 
 
 		 750 aa  669    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.5 
 
 		 697 aa  635    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.82 
 
 		 729 aa  648    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.14 
 
 		 706 aa  641    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  63.41 
 
 		 685 aa  839    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.59 
 
 		 700 aa  650    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.66 
 
 		 696 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  65.84 
 
 		 701 aa  828    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.07 
 
 		 701 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.53 
 
 		 695 aa  641    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.53 
 
 		 695 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.08 
 
 		 790 aa  632  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.58 
 
 		 694 aa  629  1e-179  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.08 
 
 		 696 aa  626  1e-178  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  52.78 
 
 		 699 aa  621  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  52.21 
 
 		 727 aa  618  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  51.78 
 
 		 699 aa  615  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.28 
 
 		 700 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.14 
 
 		 700 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.85 
 
 		 702 aa  612  9.999999999999999e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  52.14 
 
 		 728 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.14 
 
 		 690 aa  609  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.19 
 
 		 731 aa  607  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.33 
 
 		 703 aa  598  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.01 
 
 		 702 aa  586  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.78 
 
 		 691 aa  582  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.87 
 
 		 723 aa  570  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.38 
 
 		 709 aa  527  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  40.93 
 
 		 678 aa  513  1e-144  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.08 
 
 		 673 aa  508  9.999999999999999e-143  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.5 
 
 		 679 aa  501  1e-140  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.84 
 
 		 686 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.42 
 
 		 705 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.2 
 
 		 765 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.11 
 
 		 690 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.58 
 
 		 691 aa  487  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.26 
 
 		 690 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.12 
 
 		 692 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.74 
 
 		 687 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.38589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.47 
 
 		 702 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.96 
 
 		 690 aa  473  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.54 
 
 		 772 aa  475  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.18 
 
 		 693 aa  472  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.63 
 
 		 778 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.83 
 
 		 704 aa  470  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.03 
 
 		 692 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.16 
 
 		 829 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.75 
 
 		 767 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0124  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.88 
 
 		 692 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.16 
 
 		 691 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.8 
 
 		 697 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.81 
 
 		 693 aa  472  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.83 
 
 		 704 aa  470  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.39 
 
 		 772 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.61 
 
 		 691 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.91 
 
 		 693 aa  466  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.43 
 
 		 692 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.54 
 
 		 691 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.17 
 
 		 690 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.12 
 
 		 692 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0041  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.49 
 
 		 693 aa  463  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.3 
 
 		 712 aa  464  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.03 
 
 		 691 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.63 
 
 		 693 aa  462  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4180  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.49 
 
 		 693 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0037  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.49 
 
 		 693 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.43 
 
 		 704 aa  461  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0201  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.96 
 
 		 691 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.65 
 
 		 717 aa  462  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3717  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.73 
 
 		 695 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.13 
 
 		 703 aa  460  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.57 
 
 		 693 aa  458  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.24 
 
 		 686 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.3 
 
 		 693 aa  459  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.96 
 
 		 698 aa  454  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.37 
 
 		 696 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.23 
 
 		 703 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0065  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.81 
 
 		 691 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.88 
 
 		 691 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.63 
 
 		 737 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001866  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.3 
 
 		 689 aa  455  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.3 
 
 		 696 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.96 
 
 		 693 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4871  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.1 
 
 		 693 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708486  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.22 
 
 		 696 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.06 
 
 		 696 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.84 
 
 		 705 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>