More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2852 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.36 
 
 		 729 aa  736    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.14 
 
 		 697 aa  805    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  93 
 
 		 700 aa  1243    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.89 
 
 		 790 aa  733    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  81.08 
 
 		 700 aa  1081    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.81 
 
 		 706 aa  798    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.21 
 
 		 694 aa  749    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.05 
 
 		 701 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.5 
 
 		 695 aa  658    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.84 
 
 		 697 aa  660    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  81.57 
 
 		 699 aa  1139    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.65 
 
 		 695 aa  652    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.46 
 
 		 704 aa  739    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.32 
 
 		 704 aa  738    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.53 
 
 		 706 aa  792    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.61 
 
 		 690 aa  755    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  100 
 
 		 728 aa  1445    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.34 
 
 		 700 aa  676    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.08 
 
 		 696 aa  657    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  85 
 
 		 699 aa  1116    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.73 
 
 		 729 aa  738    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  89.97 
 
 		 727 aa  1245    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  83.14 
 
 		 699 aa  1120    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.33 
 
 		 750 aa  735    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.13 
 
 		 701 aa  748    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.76 
 
 		 702 aa  745    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.93 
 
 		 702 aa  726    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.14 
 
 		 686 aa  647    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.43 
 
 		 694 aa  659    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.22 
 
 		 729 aa  734    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.24 
 
 		 706 aa  798    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.53 
 
 		 731 aa  759    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.7 
 
 		 701 aa  745    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.65 
 
 		 695 aa  670    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.43 
 
 		 696 aa  618  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.46 
 
 		 703 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.14 
 
 		 691 aa  608  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  48.93 
 
 		 685 aa  593  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50.21 
 
 		 701 aa  568  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.21 
 
 		 723 aa  558  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.65 
 
 		 709 aa  539  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.81 
 
 		 686 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  40.5 
 
 		 678 aa  497  1e-139  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.47 
 
 		 673 aa  493  9.999999999999999e-139  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.03 
 
 		 679 aa  489  1e-137  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.93 
 
 		 686 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.86 
 
 		 683 aa  484  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.64 
 
 		 705 aa  481  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2389  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.6 
 
 		 686 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3359  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.54 
 
 		 902 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3368  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.54 
 
 		 866 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2575  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.54 
 
 		 902 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1280  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.83 
 
 		 859 aa  475  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0306  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.54 
 
 		 902 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3325  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.54 
 
 		 902 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.97169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1167  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.54 
 
 		 902 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0367  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.05 
 
 		 723 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.469061  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.16 
 
 		 703 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.91 
 
 		 697 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.82 
 
 		 737 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0376  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.81 
 
 		 723 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2523  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.25 
 
 		 740 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174099  normal  0.914241 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0322  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.51 
 
 		 715 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.732592  normal  0.0359852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.19 
 
 		 684 aa  463  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.15 
 
 		 728 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1011  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.96 
 
 		 746 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.58 
 
 		 704 aa  461  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.02 
 
 		 715 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.17 
 
 		 765 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.58 
 
 		 704 aa  461  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2662  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.41 
 
 		 791 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.139193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0697  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.13 
 
 		 832 aa  459  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.96 
 
 		 693 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.4 
 
 		 717 aa  458  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.26 
 
 		 691 aa  456  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0593  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.44 
 
 		 708 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.56 
 
 		 691 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.33 
 
 		 785 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.57 
 
 		 687 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.38589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.49 
 
 		 715 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.3 
 
 		 690 aa  454  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.34 
 
 		 772 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.7 
 
 		 712 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.97 
 
 		 691 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3812  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.08 
 
 		 777 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.86 
 
 		 692 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.15 
 
 		 767 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.22 
 
 		 690 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.78 
 
 		 691 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3737  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.13 
 
 		 665 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.06 
 
 		 772 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  40 
 
 		 829 aa  452  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2711  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.39 
 
 		 671 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.01 
 
 		 678 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0639  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.89 
 
 		 792 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3988  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.69 
 
 		 768 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4592  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.06 
 
 		 691 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000346665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.57 
 
 		 691 aa  452  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.48 
 
 		 778 aa  452  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.58 
 
 		 692 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>