More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4161 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.07 
 
 		 690 aa  800    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.85 
 
 		 700 aa  711    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.77 
 
 		 691 aa  640    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.62 
 
 		 697 aa  679    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.44 
 
 		 701 aa  749    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.73 
 
 		 701 aa  729    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.63 
 
 		 706 aa  761    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.55 
 
 		 695 aa  679    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  96.3 
 
 		 729 aa  1329    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  77.2 
 
 		 704 aa  1022    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.86 
 
 		 700 aa  706    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  56.94 
 
 		 699 aa  733    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 729 aa  1423    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.82 
 
 		 695 aa  659    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.29 
 
 		 701 aa  744    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.5 
 
 		 731 aa  776    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.34 
 
 		 702 aa  721    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  57.77 
 
 		 728 aa  714    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.4 
 
 		 696 aa  662    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.83 
 
 		 700 aa  665    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  58.5 
 
 		 699 aa  709    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.15 
 
 		 694 aa  775    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.82 
 
 		 686 aa  662    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  57.36 
 
 		 727 aa  714    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  57.51 
 
 		 699 aa  708    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.68 
 
 		 695 aa  669    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.83 
 
 		 696 aa  649    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  78.47 
 
 		 704 aa  1037    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.16 
 
 		 697 aa  742    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.2 
 
 		 702 aa  722    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.91 
 
 		 706 aa  759    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.35 
 
 		 694 aa  641    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  84.26 
 
 		 750 aa  1132    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.02 
 
 		 790 aa  711    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.34 
 
 		 706 aa  754    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  99.45 
 
 		 729 aa  1417    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.26 
 
 		 703 aa  625  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55 
 
 		 723 aa  615  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  50.99 
 
 		 685 aa  618  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.49 
 
 		 701 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.61 
 
 		 673 aa  549  1e-155  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.92 
 
 		 709 aa  550  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.78 
 
 		 679 aa  523  1e-147  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  39.74 
 
 		 678 aa  503  1e-141  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.56 
 
 		 728 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.03 
 
 		 737 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.75 
 
 		 686 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.49 
 
 		 690 aa  471  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.79 
 
 		 686 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.35 
 
 		 705 aa  467  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.9 
 
 		 690 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.6 
 
 		 683 aa  463  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.72 
 
 		 704 aa  462  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.72 
 
 		 704 aa  463  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.91 
 
 		 697 aa  460  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.9 
 
 		 747 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0367  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.29 
 
 		 723 aa  456  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.469061  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.18 
 
 		 693 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.44 
 
 		 693 aa  456  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.65 
 
 		 712 aa  456  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.3 
 
 		 690 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0376  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.07 
 
 		 723 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.1 
 
 		 681 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.27 
 
 		 685 aa  449  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.94 
 
 		 776 aa  450  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0322  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.09 
 
 		 715 aa  449  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.732592  normal  0.0359852 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.97 
 
 		 678 aa  449  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.7 
 
 		 690 aa  451  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1011  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.38 
 
 		 746 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.07 
 
 		 829 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2711  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.72 
 
 		 671 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.2 
 
 		 715 aa  449  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.62 
 
 		 695 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.61 
 
 		 691 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0593  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.38 
 
 		 708 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.73 
 
 		 702 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.76 
 
 		 681 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.11 
 
 		 691 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.93 
 
 		 691 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2662  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.25 
 
 		 791 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.139193 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4976  ATP-dependent DNA helicase RecG  41 
 
 		 697 aa  445  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.14 
 
 		 685 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.08 
 
 		 767 aa  445  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.48 
 
 		 817 aa  444  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.91 
 
 		 715 aa  445  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.92 
 
 		 765 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.65 
 
 		 785 aa  445  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.49 
 
 		 772 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0639  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.49 
 
 		 792 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.7 
 
 		 717 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2389  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.58 
 
 		 686 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3368  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.64 
 
 		 866 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3812  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.3 
 
 		 777 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3325  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.74 
 
 		 902 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.97169  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.08 
 
 		 692 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.6 
 
 		 680 aa  441  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.26 
 
 		 693 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.13 
 
 		 693 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.62 
 
 		 815 aa  442  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.73 
 
 		 689 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>