More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1777 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  84.41 
 
 		 714 aa  1217    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.37 
 
 		 772 aa  1050    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  50 
 
 		 904 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.36 
 
 		 717 aa  897    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.72 
 
 		 772 aa  1047    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 767 aa  1553    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  75.1 
 
 		 829 aa  1182    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.71 
 
 		 765 aa  1060    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.38 
 
 		 778 aa  1025    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.71 
 
 		 772 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  50 
 
 		 904 aa  618  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.73 
 
 		 700 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.75 
 
 		 908 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.95 
 
 		 740 aa  589  1e-167  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.22 
 
 		 685 aa  589  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  44.95 
 
 		 818 aa  590  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.06 
 
 		 818 aa  585  1e-166  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.9 
 
 		 683 aa  585  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.13 
 
 		 832 aa  579  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.14 
 
 		 753 aa  581  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.77 
 
 		 786 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.12 
 
 		 819 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.37 
 
 		 817 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.12 
 
 		 819 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.76 
 
 		 681 aa  570  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.95 
 
 		 712 aa  568  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.74 
 
 		 685 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.12 
 
 		 693 aa  565  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.67 
 
 		 689 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.01 
 
 		 827 aa  563  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.79 
 
 		 842 aa  559  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.93 
 
 		 691 aa  558  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.85 
 
 		 842 aa  558  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.33 
 
 		 691 aa  558  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.58 
 
 		 818 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001866  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.37 
 
 		 689 aa  554  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.37 
 
 		 693 aa  554  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3507  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.81 
 
 		 691 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.54 
 
 		 692 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.75 
 
 		 696 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.94 
 
 		 702 aa  547  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.25 
 
 		 706 aa  548  1e-154  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2283  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.89 
 
 		 692 aa  542  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.35 
 
 		 693 aa  545  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.36 
 
 		 693 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.36 
 
 		 693 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.58 
 
 		 706 aa  543  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.6 
 
 		 691 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.6 
 
 		 696 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.45 
 
 		 862 aa  545  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.66 
 
 		 693 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.59 
 
 		 693 aa  544  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.07 
 
 		 693 aa  542  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.36 
 
 		 693 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.33 
 
 		 686 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.46 
 
 		 696 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.87 
 
 		 703 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5025  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.97 
 
 		 693 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.03 
 
 		 815 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.97 
 
 		 693 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.06 
 
 		 684 aa  539  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.68 
 
 		 691 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.14 
 
 		 779 aa  539  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.04 
 
 		 686 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.39 
 
 		 697 aa  541  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.42 
 
 		 719 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.11 
 
 		 696 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.06 
 
 		 707 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.98 
 
 		 690 aa  541  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03509  ATP-dependent DNA helicase  44.97 
 
 		 693 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0053  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.83 
 
 		 693 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3863  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.97 
 
 		 693 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.83 
 
 		 688 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3987  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.97 
 
 		 693 aa  537  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03461  hypothetical protein  44.97 
 
 		 693 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.58 
 
 		 787 aa  538  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0059  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.97 
 
 		 693 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4103  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.83 
 
 		 693 aa  538  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.65 
 
 		 693 aa  537  1e-151  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.83 
 
 		 696 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.83 
 
 		 696 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.29 
 
 		 705 aa  538  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.94 
 
 		 691 aa  538  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.17 
 
 		 696 aa  538  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.68 
 
 		 694 aa  538  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.83 
 
 		 696 aa  532  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.6 
 
 		 903 aa  533  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.06 
 
 		 827 aa  535  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.25 
 
 		 706 aa  535  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.61 
 
 		 704 aa  534  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1139  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.15 
 
 		 776 aa  534  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00836981  normal  0.0179484 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.82 
 
 		 679 aa  530  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.31 
 
 		 822 aa  530  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.77 
 
 		 693 aa  530  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.39 
 
 		 690 aa  531  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.37 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.26 
 
 		 691 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.6 
 
 		 822 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4592  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.89 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000346665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.91 
 
 		 692 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>