More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3079 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.68 
 
 		 690 aa  736    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.47 
 
 		 706 aa  800    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.26 
 
 		 701 aa  794    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.01 
 
 		 729 aa  749    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.47 
 
 		 706 aa  803    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.15 
 
 		 729 aa  756    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.65 
 
 		 697 aa  726    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.21 
 
 		 700 aa  709    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.6 
 
 		 697 aa  672    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  54 
 
 		 699 aa  719    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.32 
 
 		 704 aa  765    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.14 
 
 		 695 aa  744    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.7 
 
 		 701 aa  786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.17 
 
 		 691 aa  702    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.06 
 
 		 700 aa  710    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.91 
 
 		 750 aa  731    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.57 
 
 		 703 aa  707    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.96 
 
 		 686 aa  696    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  56.21 
 
 		 728 aa  705    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  52.14 
 
 		 685 aa  641    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.34 
 
 		 700 aa  741    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.07 
 
 		 731 aa  727    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.15 
 
 		 729 aa  756    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  55 
 
 		 699 aa  692    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  55.86 
 
 		 727 aa  713    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  54.86 
 
 		 699 aa  699    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.99 
 
 		 695 aa  749    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.27 
 
 		 695 aa  760    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.76 
 
 		 696 aa  736    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.33 
 
 		 702 aa  731    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.18 
 
 		 706 aa  798    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.93 
 
 		 696 aa  726    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.69 
 
 		 694 aa  756    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.56 
 
 		 790 aa  748    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.41 
 
 		 701 aa  775    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 694 aa  1385    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.06 
 
 		 702 aa  746    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.89 
 
 		 704 aa  756    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  53.3 
 
 		 701 aa  632  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.31 
 
 		 723 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.57 
 
 		 709 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.17 
 
 		 673 aa  556  1e-157  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.36 
 
 		 679 aa  557  1e-157  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  41.65 
 
 		 678 aa  535  1e-150  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.34 
 
 		 686 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.54 
 
 		 693 aa  487  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.72 
 
 		 690 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.88 
 
 		 712 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.47 
 
 		 767 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.5 
 
 		 704 aa  481  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.5 
 
 		 704 aa  481  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.27 
 
 		 829 aa  477  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.27 
 
 		 690 aa  477  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.46 
 
 		 697 aa  478  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.82 
 
 		 772 aa  477  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.98 
 
 		 776 aa  476  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.99 
 
 		 703 aa  478  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.67 
 
 		 772 aa  475  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.11 
 
 		 681 aa  473  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.47 
 
 		 705 aa  473  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.83 
 
 		 685 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.56 
 
 		 765 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.04 
 
 		 700 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.03 
 
 		 778 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2025  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.79 
 
 		 691 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.65 
 
 		 689 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.89 
 
 		 678 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.8 
 
 		 747 aa  464  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.49 
 
 		 714 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.79 
 
 		 691 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.18 
 
 		 817 aa  461  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.96 
 
 		 692 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.74 
 
 		 805 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.06 
 
 		 691 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.25 
 
 		 683 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.93 
 
 		 728 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.73 
 
 		 686 aa  458  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.36 
 
 		 693 aa  457  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.94 
 
 		 693 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.15 
 
 		 691 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.07 
 
 		 690 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.98 
 
 		 691 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.43 
 
 		 737 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0322  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.1 
 
 		 715 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.732592  normal  0.0359852 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.4 
 
 		 691 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.1 
 
 		 691 aa  455  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.76 
 
 		 696 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.66 
 
 		 693 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.63 
 
 		 692 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.39 
 
 		 698 aa  451  1e-125  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.81 
 
 		 693 aa  450  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3987  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.92 
 
 		 693 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5025  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.77 
 
 		 693 aa  451  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.83 
 
 		 696 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.63 
 
 		 702 aa  451  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.43 
 
 		 696 aa  452  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.93 
 
 		 717 aa  451  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4103  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.77 
 
 		 693 aa  451  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.71 
 
 		 692 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.43 
 
 		 696 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>