More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7183 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.39 
 
 		 706 aa  754    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.69 
 
 		 790 aa  710    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  78.75 
 
 		 729 aa  1040    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.02 
 
 		 690 aa  803    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.68 
 
 		 701 aa  738    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.95 
 
 		 706 aa  767    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.19 
 
 		 701 aa  724    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  92.61 
 
 		 704 aa  1237    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.16 
 
 		 686 aa  670    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.98 
 
 		 697 aa  746    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  56.98 
 
 		 699 aa  731    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.76 
 
 		 691 aa  672    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.13 
 
 		 695 aa  681    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.74 
 
 		 694 aa  784    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.9 
 
 		 701 aa  733    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.67 
 
 		 706 aa  762    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.98 
 
 		 695 aa  710    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  78.47 
 
 		 729 aa  1036    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  58.61 
 
 		 728 aa  716    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.35 
 
 		 700 aa  675    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.13 
 
 		 695 aa  691    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  57.69 
 
 		 699 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  58.32 
 
 		 727 aa  722    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  56.84 
 
 		 699 aa  703    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.89 
 
 		 700 aa  716    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  78.81 
 
 		 750 aa  1040    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.18 
 
 		 696 aa  681    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.62 
 
 		 731 aa  766    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.67 
 
 		 702 aa  717    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  78.75 
 
 		 729 aa  1038    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.36 
 
 		 702 aa  710    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.59 
 
 		 700 aa  718    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.03 
 
 		 696 aa  682    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 704 aa  1378    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.69 
 
 		 694 aa  682    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.62 
 
 		 697 aa  674    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.81 
 
 		 723 aa  629  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.4 
 
 		 703 aa  628  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  51.85 
 
 		 685 aa  627  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  53.47 
 
 		 701 aa  592  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.67 
 
 		 673 aa  543  1e-153  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.65 
 
 		 709 aa  535  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.24 
 
 		 679 aa  533  1e-150  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  39.51 
 
 		 678 aa  511  1e-143  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.36 
 
 		 686 aa  485  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.51 
 
 		 728 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.09 
 
 		 693 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.32 
 
 		 686 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.09 
 
 		 737 aa  459  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.5 
 
 		 705 aa  458  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.27 
 
 		 704 aa  452  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.97 
 
 		 690 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.98 
 
 		 772 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.9 
 
 		 691 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.52 
 
 		 691 aa  455  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.27 
 
 		 704 aa  453  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.53 
 
 		 690 aa  451  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.95 
 
 		 772 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.46 
 
 		 683 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.94 
 
 		 685 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.34 
 
 		 712 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.38 
 
 		 690 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.31 
 
 		 692 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.64 
 
 		 697 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.93 
 
 		 693 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3812  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.1 
 
 		 777 aa  445  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.4 
 
 		 829 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.7 
 
 		 692 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0322  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.15 
 
 		 715 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.732592  normal  0.0359852 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.95 
 
 		 785 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.8 
 
 		 681 aa  444  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.36 
 
 		 747 aa  445  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0639  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.65 
 
 		 792 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.77 
 
 		 715 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.75 
 
 		 682 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.63 
 
 		 767 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0722  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.2 
 
 		 684 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000137671  hitchhiker  0.00000253506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.38 
 
 		 715 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0568  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.2 
 
 		 684 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.457538  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.87 
 
 		 706 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.76 
 
 		 703 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.7 
 
 		 690 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2523  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.4 
 
 		 740 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174099  normal  0.914241 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2025  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.18 
 
 		 691 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0697  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.05 
 
 		 832 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.73 
 
 		 685 aa  438  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.28 
 
 		 678 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.28 
 
 		 717 aa  438  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.19 
 
 		 691 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0240  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.44 
 
 		 771 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.55 
 
 		 765 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0724  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.44 
 
 		 771 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.84 
 
 		 692 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.84 
 
 		 692 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2711  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.98 
 
 		 671 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.72 
 
 		 717 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.33 
 
 		 680 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1280  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.04 
 
 		 859 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.99 
 
 		 684 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2662  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.78 
 
 		 791 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.139193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>