More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2305 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 772 aa  1565    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.31 
 
 		 714 aa  996    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.37 
 
 		 717 aa  837    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.5 
 
 		 767 aa  1055    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.35 
 
 		 829 aa  1078    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  95.85 
 
 		 772 aa  1486    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  64.09 
 
 		 765 aa  986    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.31 
 
 		 778 aa  963    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.26 
 
 		 772 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.12 
 
 		 904 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  43.82 
 
 		 818 aa  588  1e-166  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.96 
 
 		 740 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.87 
 
 		 818 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.55 
 
 		 904 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.42 
 
 		 700 aa  579  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.5 
 
 		 908 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.77 
 
 		 683 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.27 
 
 		 753 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.09 
 
 		 786 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.51 
 
 		 689 aa  565  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.25 
 
 		 779 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.15 
 
 		 685 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.78 
 
 		 685 aa  559  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.3 
 
 		 712 aa  558  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.82 
 
 		 693 aa  554  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.35 
 
 		 681 aa  555  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.32 
 
 		 703 aa  549  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.08 
 
 		 694 aa  545  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.26 
 
 		 692 aa  545  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.13 
 
 		 686 aa  543  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.35 
 
 		 692 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.98 
 
 		 702 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.55 
 
 		 817 aa  541  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.7 
 
 		 704 aa  536  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.99 
 
 		 827 aa  538  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.78 
 
 		 692 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.88 
 
 		 842 aa  538  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.36 
 
 		 707 aa  537  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.49 
 
 		 692 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.57 
 
 		 862 aa  534  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.9 
 
 		 812 aa  533  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.57 
 
 		 832 aa  533  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.82 
 
 		 691 aa  535  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.68 
 
 		 842 aa  535  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.5 
 
 		 706 aa  533  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.35 
 
 		 692 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.27 
 
 		 691 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0201  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.47 
 
 		 691 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.98 
 
 		 679 aa  531  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.31 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.18 
 
 		 696 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.03 
 
 		 691 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.18 
 
 		 696 aa  527  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.55 
 
 		 819 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.41 
 
 		 819 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.16 
 
 		 815 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.65 
 
 		 776 aa  528  1e-148  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.18 
 
 		 696 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.42 
 
 		 706 aa  527  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.74 
 
 		 706 aa  527  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.85 
 
 		 691 aa  528  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.05 
 
 		 684 aa  525  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0065  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.88 
 
 		 691 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.57 
 
 		 691 aa  523  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.66 
 
 		 691 aa  522  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.96 
 
 		 719 aa  524  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.9 
 
 		 818 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  42.69 
 
 		 700 aa  523  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.89 
 
 		 696 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.51 
 
 		 696 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.68 
 
 		 691 aa  521  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.66 
 
 		 690 aa  520  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.12 
 
 		 703 aa  519  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.13 
 
 		 688 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.52 
 
 		 693 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.62 
 
 		 781 aa  518  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.39 
 
 		 706 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  41 
 
 		 799 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.15 
 
 		 763 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.91 
 
 		 691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.07 
 
 		 696 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.07 
 
 		 696 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.58 
 
 		 695 aa  515  1e-144  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.23 
 
 		 693 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.23 
 
 		 693 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.52 
 
 		 697 aa  515  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.37 
 
 		 693 aa  515  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1139  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.64 
 
 		 776 aa  513  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00836981  normal  0.0179484 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.23 
 
 		 693 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70570  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.35 
 
 		 691 aa  515  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.79 
 
 		 693 aa  512  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001866  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.31 
 
 		 689 aa  510  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.01 
 
 		 779 aa  509  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6122  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.91 
 
 		 691 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.93 
 
 		 693 aa  512  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.21 
 
 		 686 aa  511  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.91 
 
 		 693 aa  509  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.23 
 
 		 693 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.55 
 
 		 696 aa  510  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3507  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.52 
 
 		 691 aa  510  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>