More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1662 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.06 
 
 
731 aa  772    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  78.25 
 
 
704 aa  1043    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.84 
 
 
706 aa  759    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.58 
 
 
690 aa  795    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.56 
 
 
706 aa  754    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.8 
 
 
701 aa  723    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.2 
 
 
700 aa  704    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.91 
 
 
694 aa  759    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.98 
 
 
706 aa  755    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  57.57 
 
 
699 aa  747    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.73 
 
 
695 aa  670    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  77.82 
 
 
704 aa  1036    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.59 
 
 
695 aa  679    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.02 
 
 
695 aa  693    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.19 
 
 
700 aa  722    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.7 
 
 
703 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
750 aa  1457    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  57.4 
 
 
728 aa  719    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  52.05 
 
 
685 aa  640    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.47 
 
 
697 aa  752    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.17 
 
 
700 aa  670    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.73 
 
 
696 aa  680    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  58.7 
 
 
699 aa  724    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.57 
 
 
701 aa  741    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  57.78 
 
 
727 aa  726    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  57.85 
 
 
699 aa  723    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.43 
 
 
686 aa  693    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.14 
 
 
702 aa  711    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.2 
 
 
696 aa  636    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.79 
 
 
701 aa  744    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.28 
 
 
702 aa  703    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  82.08 
 
 
729 aa  1135    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.73 
 
 
790 aa  705    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  83.31 
 
 
729 aa  1149    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.48 
 
 
694 aa  635    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.93 
 
 
697 aa  677    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  82.35 
 
 
729 aa  1138    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.12 
 
 
691 aa  639    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.49 
 
 
723 aa  625  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.75 
 
 
701 aa  587  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.22 
 
 
709 aa  537  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.57 
 
 
673 aa  531  1e-149  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.11 
 
 
679 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  39.68 
 
 
678 aa  511  1e-143  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.42 
 
 
686 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.05 
 
 
693 aa  477  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.88 
 
 
747 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.56 
 
 
690 aa  473  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.08 
 
 
704 aa  473  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.36 
 
 
686 aa  475  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.08 
 
 
704 aa  473  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.12 
 
 
690 aa  469  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.77 
 
 
683 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.26 
 
 
690 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.66 
 
 
728 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.9 
 
 
678 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.43 
 
 
691 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.96 
 
 
691 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.11 
 
 
705 aa  469  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.74 
 
 
717 aa  464  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.09 
 
 
691 aa  465  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.28 
 
 
712 aa  462  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.69 
 
 
737 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.96 
 
 
693 aa  463  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.48 
 
 
703 aa  462  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.59 
 
 
697 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.74 
 
 
715 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.65 
 
 
829 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.85 
 
 
690 aa  456  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.86 
 
 
703 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.2 
 
 
715 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.8 
 
 
681 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.01 
 
 
685 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.74 
 
 
776 aa  450  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.31 
 
 
684 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.91 
 
 
767 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.86 
 
 
695 aa  451  1e-125  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.38 
 
 
692 aa  451  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03509  ATP-dependent DNA helicase  41.72 
 
 
693 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2711  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.36 
 
 
671 aa  449  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5025  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.01 
 
 
693 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.01 
 
 
693 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.7 
 
 
815 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4103  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.01 
 
 
693 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.48 
 
 
702 aa  448  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03461  hypothetical protein  41.72 
 
 
693 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1011  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.93 
 
 
746 aa  448  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0322  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.95 
 
 
715 aa  449  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.732592  normal  0.0359852 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.54 
 
 
693 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0053  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.72 
 
 
693 aa  445  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0059  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.86 
 
 
693 aa  446  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3359  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.5 
 
 
902 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3987  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.57 
 
 
693 aa  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.29 
 
 
680 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1280  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.8 
 
 
859 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.08 
 
 
765 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.78 
 
 
691 aa  445  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.1 
 
 
672 aa  444  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.79 
 
 
696 aa  445  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0376  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.17 
 
 
723 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>