More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1700 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.04 
 
 
682 aa  679    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.19 
 
 
682 aa  681    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.9 
 
 
682 aa  679    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  78.18 
 
 
671 aa  1095    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.04 
 
 
682 aa  679    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.53 
 
 
657 aa  665    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.19 
 
 
682 aa  681    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.85 
 
 
682 aa  693    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.37 
 
 
682 aa  659    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.04 
 
 
682 aa  679    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.04 
 
 
682 aa  680    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.34 
 
 
685 aa  684    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.19 
 
 
682 aa  685    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.19 
 
 
682 aa  683    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.72 
 
 
681 aa  918    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0449  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.07 
 
 
676 aa  645    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0217624  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.19 
 
 
676 aa  662    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
672 aa  1388    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1286  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.53 
 
 
686 aa  633  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1311  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.53 
 
 
686 aa  633  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1162  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.44 
 
 
678 aa  618  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000110827  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.81 
 
 
679 aa  616  1e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0793  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.58 
 
 
682 aa  606  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.93 
 
 
685 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.01 
 
 
689 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.33 
 
 
685 aa  511  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.97 
 
 
681 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.37 
 
 
805 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1984  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.92 
 
 
690 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.02 
 
 
740 aa  499  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.47 
 
 
779 aa  496  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.63 
 
 
818 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.5 
 
 
692 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.74 
 
 
818 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.48 
 
 
683 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  40.45 
 
 
818 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.9 
 
 
819 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.9 
 
 
688 aa  491  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.9 
 
 
819 aa  492  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.63 
 
 
700 aa  489  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.14 
 
 
679 aa  488  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1330  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.67 
 
 
678 aa  487  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.88 
 
 
689 aa  484  1e-135  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.4 
 
 
767 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.7 
 
 
680 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.7 
 
 
786 aa  481  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.92 
 
 
822 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.21 
 
 
781 aa  481  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.03 
 
 
817 aa  478  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.67 
 
 
678 aa  478  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.55 
 
 
842 aa  477  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.06 
 
 
827 aa  476  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.39 
 
 
765 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.37 
 
 
694 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.05 
 
 
842 aa  472  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.09 
 
 
763 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.37 
 
 
703 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.3 
 
 
827 aa  470  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.67 
 
 
772 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.94 
 
 
787 aa  471  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.41 
 
 
772 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.86 
 
 
701 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.79 
 
 
779 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.34 
 
 
714 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.3 
 
 
829 aa  465  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.97 
 
 
822 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.35 
 
 
773 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.13 
 
 
690 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1702  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.38 
 
 
564 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.35 
 
 
695 aa  457  1e-127  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.81 
 
 
812 aa  458  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  41.32 
 
 
700 aa  456  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.06 
 
 
704 aa  454  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.45 
 
 
698 aa  453  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.56 
 
 
717 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.1 
 
 
702 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.75 
 
 
815 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.98 
 
 
702 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.39 
 
 
832 aa  451  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  40 
 
 
846 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.23 
 
 
903 aa  452  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.01 
 
 
706 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.51 
 
 
706 aa  449  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.39 
 
 
776 aa  446  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  40 
 
 
846 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.95 
 
 
862 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.43 
 
 
691 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1139  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.74 
 
 
776 aa  448  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00836981  normal  0.0179484 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.09 
 
 
778 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.58 
 
 
712 aa  444  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.78 
 
 
691 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.35 
 
 
846 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.32 
 
 
706 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.17 
 
 
683 aa  440  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.46 
 
 
728 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.31 
 
 
719 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.59 
 
 
686 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.62 
 
 
697 aa  439  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1371  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.47 
 
 
710 aa  441  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.393956  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.65 
 
 
696 aa  440  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>