More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1702 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1984  ATP-dependent DNA helicase RecG  98.76 
 
 		 690 aa  1127    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1702  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 564 aa  1140    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.56 
 
 		 679 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.38 
 
 		 681 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.46 
 
 		 818 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.31 
 
 		 689 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.43 
 
 		 819 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.43 
 
 		 819 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.03 
 
 		 694 aa  486  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.64 
 
 		 678 aa  488  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.73 
 
 		 779 aa  482  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.8 
 
 		 786 aa  481  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.4 
 
 		 827 aa  475  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  46 
 
 		 776 aa  473  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.16 
 
 		 817 aa  474  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.63 
 
 		 706 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.81 
 
 		 704 aa  473  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.4 
 
 		 681 aa  475  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.33 
 
 		 671 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.47 
 
 		 827 aa  471  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.38 
 
 		 672 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.4 
 
 		 822 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.67 
 
 		 682 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.3 
 
 		 682 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.28 
 
 		 685 aa  462  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.98 
 
 		 682 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.36 
 
 		 822 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.19 
 
 		 829 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.27 
 
 		 787 aa  463  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.79 
 
 		 763 aa  464  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.3 
 
 		 682 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.99 
 
 		 772 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.12 
 
 		 682 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.12 
 
 		 657 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.12 
 
 		 682 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.67 
 
 		 773 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.12 
 
 		 682 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.12 
 
 		 682 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.7 
 
 		 779 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.94 
 
 		 682 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.12 
 
 		 682 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.83 
 
 		 683 aa  458  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.63 
 
 		 688 aa  456  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.57 
 
 		 846 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1244  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.16 
 
 		 850 aa  456  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.912337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.32 
 
 		 767 aa  458  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1330  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.29 
 
 		 678 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.61 
 
 		 772 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.18 
 
 		 846 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.87 
 
 		 685 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.7 
 
 		 700 aa  455  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.98 
 
 		 717 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.5 
 
 		 812 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.88 
 
 		 702 aa  455  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.38 
 
 		 846 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1139  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.36 
 
 		 776 aa  454  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00836981  normal  0.0179484 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.63 
 
 		 680 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.27 
 
 		 772 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.27 
 
 		 904 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.36 
 
 		 702 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.01 
 
 		 698 aa  445  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  41.74 
 
 		 818 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.68 
 
 		 815 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.33 
 
 		 689 aa  443  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  43.05 
 
 		 700 aa  442  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.64 
 
 		 765 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.16 
 
 		 842 aa  445  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.51 
 
 		 818 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.8 
 
 		 815 aa  445  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.88 
 
 		 682 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.39 
 
 		 740 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0793  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.88 
 
 		 682 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.69 
 
 		 818 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.28 
 
 		 692 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.32 
 
 		 903 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.92 
 
 		 695 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.95 
 
 		 696 aa  442  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.36 
 
 		 799 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.47 
 
 		 778 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.7 
 
 		 842 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.23 
 
 		 714 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.03 
 
 		 685 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.02 
 
 		 862 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.04 
 
 		 818 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.93 
 
 		 701 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.08 
 
 		 904 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.21 
 
 		 805 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.74 
 
 		 703 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.93 
 
 		 676 aa  436  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1162  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.7 
 
 		 678 aa  434  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000110827  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.93 
 
 		 679 aa  433  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.73 
 
 		 720 aa  431  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.03 
 
 		 818 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.68 
 
 		 690 aa  432  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1286  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.42 
 
 		 686 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.12 
 
 		 908 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1311  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.42 
 
 		 686 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.5 
 
 		 781 aa  426  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.45 
 
 		 719 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.55 
 
 		 691 aa  429  1e-118  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>