More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1051 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  96.76 
 
 		 740 aa  1465    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.84 
 
 		 832 aa  706    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.86 
 
 		 842 aa  702    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.66 
 
 		 786 aa  706    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 		 818 aa  1683    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  89.24 
 
 		 818 aa  1515    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.44 
 
 		 842 aa  687    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.14 
 
 		 862 aa  692    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.95 
 
 		 767 aa  590  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.25 
 
 		 683 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.4 
 
 		 772 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.22 
 
 		 765 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.29 
 
 		 772 aa  582  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.46 
 
 		 829 aa  581  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.37 
 
 		 714 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.9 
 
 		 685 aa  569  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.67 
 
 		 817 aa  567  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.67 
 
 		 689 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.19 
 
 		 680 aa  564  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.98 
 
 		 685 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.5 
 
 		 681 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.24 
 
 		 778 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.87 
 
 		 692 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.11 
 
 		 819 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.11 
 
 		 694 aa  553  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.11 
 
 		 819 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.45 
 
 		 717 aa  551  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.68 
 
 		 827 aa  551  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.28 
 
 		 779 aa  544  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.47 
 
 		 815 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.66 
 
 		 818 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.82 
 
 		 679 aa  538  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.61 
 
 		 846 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.81 
 
 		 700 aa  539  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.98 
 
 		 812 aa  534  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.49 
 
 		 846 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.63 
 
 		 827 aa  534  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.35 
 
 		 682 aa  535  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.03 
 
 		 712 aa  528  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.07 
 
 		 822 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.48 
 
 		 704 aa  526  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.23 
 
 		 688 aa  528  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.35 
 
 		 822 aa  525  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.9 
 
 		 763 aa  523  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.17 
 
 		 787 aa  522  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.61 
 
 		 703 aa  519  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.75 
 
 		 779 aa  521  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.85 
 
 		 682 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.85 
 
 		 682 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.85 
 
 		 682 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.85 
 
 		 682 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.85 
 
 		 682 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.7 
 
 		 682 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.7 
 
 		 682 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1139  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.32 
 
 		 776 aa  518  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00836981  normal  0.0179484 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.85 
 
 		 682 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.15 
 
 		 682 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  40 
 
 		 706 aa  515  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.78 
 
 		 772 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.32 
 
 		 685 aa  511  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.04 
 
 		 776 aa  508  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.42 
 
 		 818 aa  505  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.99 
 
 		 657 aa  504  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.78 
 
 		 799 aa  506  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.82 
 
 		 805 aa  505  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.53 
 
 		 706 aa  505  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.36 
 
 		 702 aa  505  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.42 
 
 		 707 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.23 
 
 		 818 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.87 
 
 		 904 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.77 
 
 		 846 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.96 
 
 		 903 aa  496  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.83 
 
 		 703 aa  497  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.71 
 
 		 719 aa  498  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.97 
 
 		 781 aa  497  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.49 
 
 		 681 aa  498  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.93 
 
 		 815 aa  498  1e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.21 
 
 		 682 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  39.35 
 
 		 700 aa  494  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.45 
 
 		 672 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.87 
 
 		 904 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.26 
 
 		 689 aa  489  1e-137  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.66 
 
 		 773 aa  492  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.86 
 
 		 720 aa  488  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.93 
 
 		 678 aa  486  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.39 
 
 		 818 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1371  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.1 
 
 		 710 aa  486  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.393956  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.07 
 
 		 671 aa  483  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.32 
 
 		 701 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0449  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.34 
 
 		 676 aa  481  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0217624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.75 
 
 		 908 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1244  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.42 
 
 		 850 aa  478  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.912337  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.45 
 
 		 676 aa  476  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0793  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.56 
 
 		 682 aa  475  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.69 
 
 		 706 aa  473  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.01 
 
 		 696 aa  474  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1162  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.05 
 
 		 678 aa  470  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000110827  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1311  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.22 
 
 		 686 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.74 
 
 		 697 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1286  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.22 
 
 		 686 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>