More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0348 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 698 aa  1427    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.07 
 
 		 702 aa  744    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.99 
 
 		 704 aa  758    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.42 
 
 		 701 aa  755    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.44 
 
 		 706 aa  730    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.42 
 
 		 703 aa  743    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.15 
 
 		 702 aa  725    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.29 
 
 		 696 aa  757    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.26 
 
 		 695 aa  714    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  50 
 
 		 700 aa  717    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.11 
 
 		 700 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.27 
 
 		 712 aa  549  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.06 
 
 		 706 aa  543  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.31 
 
 		 707 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.54 
 
 		 706 aa  533  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.17 
 
 		 706 aa  531  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.8 
 
 		 703 aa  528  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.07 
 
 		 719 aa  521  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.61 
 
 		 765 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.63 
 
 		 683 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.77 
 
 		 681 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.12 
 
 		 772 aa  505  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.74 
 
 		 689 aa  505  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.15 
 
 		 817 aa  504  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.73 
 
 		 779 aa  504  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.29 
 
 		 778 aa  503  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.29 
 
 		 786 aa  500  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.98 
 
 		 772 aa  500  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.88 
 
 		 767 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.24 
 
 		 829 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.09 
 
 		 679 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.07 
 
 		 692 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.34 
 
 		 819 aa  485  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.34 
 
 		 819 aa  485  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.7 
 
 		 717 aa  479  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.06 
 
 		 686 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.91 
 
 		 740 aa  477  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.22 
 
 		 694 aa  478  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.95 
 
 		 776 aa  476  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.2 
 
 		 818 aa  476  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  38.61 
 
 		 818 aa  477  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  41 
 
 		 714 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.74 
 
 		 684 aa  472  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.93 
 
 		 685 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.36 
 
 		 799 aa  473  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2579  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.77 
 
 		 678 aa  471  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0922078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.26 
 
 		 805 aa  472  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.56 
 
 		 688 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.51 
 
 		 827 aa  469  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.22 
 
 		 787 aa  467  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.07 
 
 		 822 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.34 
 
 		 685 aa  465  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.62 
 
 		 679 aa  462  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.26 
 
 		 904 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.11 
 
 		 686 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.17 
 
 		 691 aa  459  9.999999999999999e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3717  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.82 
 
 		 695 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.57 
 
 		 686 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1984  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.21 
 
 		 690 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.2 
 
 		 818 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.83 
 
 		 672 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.39 
 
 		 694 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.16 
 
 		 763 aa  458  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1330  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.39 
 
 		 678 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.92 
 
 		 772 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.62 
 
 		 693 aa  458  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.4 
 
 		 691 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.93 
 
 		 862 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.54 
 
 		 671 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.01 
 
 		 779 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.66 
 
 		 678 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.35 
 
 		 908 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.58 
 
 		 681 aa  455  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.19 
 
 		 676 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4871  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.85 
 
 		 693 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708486  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.99 
 
 		 822 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.46 
 
 		 692 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.8 
 
 		 827 aa  449  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.62 
 
 		 696 aa  451  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.25 
 
 		 691 aa  451  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.04 
 
 		 903 aa  449  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.57 
 
 		 683 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.19 
 
 		 846 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.5 
 
 		 696 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.14 
 
 		 696 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.35 
 
 		 696 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.35 
 
 		 696 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.11 
 
 		 753 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.62 
 
 		 832 aa  448  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.35 
 
 		 691 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.22 
 
 		 705 aa  448  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  41 
 
 		 693 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.41 
 
 		 842 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.84 
 
 		 691 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.21 
 
 		 691 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.07 
 
 		 904 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.41 
 
 		 701 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.97 
 
 		 693 aa  443  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.83 
 
 		 815 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.08 
 
 		 691 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.338064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>