More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2935 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.07 
 
 		 698 aa  738    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  71.86 
 
 		 700 aa  1063    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.27 
 
 		 703 aa  798    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.14 
 
 		 700 aa  644    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.3 
 
 		 695 aa  761    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.77 
 
 		 696 aa  827    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.18 
 
 		 702 aa  813    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.14 
 
 		 704 aa  981    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 702 aa  1449    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.8 
 
 		 706 aa  795    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.08 
 
 		 701 aa  822    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.16 
 
 		 706 aa  566  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.4 
 
 		 819 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.4 
 
 		 819 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.93 
 
 		 712 aa  565  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.98 
 
 		 817 aa  560  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.91 
 
 		 818 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.88 
 
 		 719 aa  555  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.15 
 
 		 689 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.69 
 
 		 772 aa  550  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.45 
 
 		 706 aa  545  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.94 
 
 		 767 aa  547  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.54 
 
 		 786 aa  543  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.3 
 
 		 827 aa  545  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.9 
 
 		 779 aa  539  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.98 
 
 		 772 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  41 
 
 		 707 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.22 
 
 		 829 aa  534  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.25 
 
 		 706 aa  535  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.73 
 
 		 822 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.45 
 
 		 717 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.69 
 
 		 703 aa  530  1e-149  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.88 
 
 		 714 aa  525  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.03 
 
 		 778 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.53 
 
 		 765 aa  521  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.19 
 
 		 827 aa  519  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.66 
 
 		 679 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.67 
 
 		 842 aa  515  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.58 
 
 		 842 aa  510  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.92 
 
 		 763 aa  511  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.62 
 
 		 779 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.43 
 
 		 822 aa  508  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.88 
 
 		 772 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.81 
 
 		 681 aa  503  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  39.36 
 
 		 818 aa  505  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.93 
 
 		 904 aa  502  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.22 
 
 		 818 aa  500  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.9 
 
 		 686 aa  500  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.82 
 
 		 691 aa  501  1e-140  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.8 
 
 		 740 aa  498  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.98 
 
 		 799 aa  497  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.98 
 
 		 815 aa  498  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.4 
 
 		 776 aa  498  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.96 
 
 		 787 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.53 
 
 		 846 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.41 
 
 		 678 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.75 
 
 		 683 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.68 
 
 		 846 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.58 
 
 		 712 aa  489  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.39 
 
 		 862 aa  491  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.32 
 
 		 671 aa  487  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.47 
 
 		 812 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.18 
 
 		 904 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.78 
 
 		 682 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.52 
 
 		 694 aa  486  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.62 
 
 		 688 aa  488  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.26 
 
 		 805 aa  489  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.41 
 
 		 908 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.09 
 
 		 685 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.03 
 
 		 685 aa  484  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.84 
 
 		 682 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.34 
 
 		 692 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.92 
 
 		 903 aa  482  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.32 
 
 		 846 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.09 
 
 		 781 aa  476  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.43 
 
 		 832 aa  478  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.47 
 
 		 686 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.64 
 
 		 682 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.53 
 
 		 815 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.74 
 
 		 685 aa  472  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.53 
 
 		 818 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.94 
 
 		 689 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.88 
 
 		 682 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.03 
 
 		 682 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.03 
 
 		 682 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.61 
 
 		 728 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.94 
 
 		 690 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.03 
 
 		 682 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.03 
 
 		 682 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.94 
 
 		 720 aa  472  1.0000000000000001e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.74 
 
 		 682 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.23 
 
 		 753 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.09 
 
 		 686 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.88 
 
 		 682 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.03 
 
 		 682 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.2 
 
 		 790 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.25 
 
 		 683 aa  467  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.37 
 
 		 687 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.38589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1139  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.23 
 
 		 776 aa  468  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00836981  normal  0.0179484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.01 
 
 		 701 aa  469  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>