More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3642 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.13 
 
 		 696 aa  673    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  93.91 
 
 		 706 aa  1335    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  93.91 
 
 		 706 aa  1335    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.96 
 
 		 701 aa  912    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.39 
 
 		 704 aa  735    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  57.55 
 
 		 699 aa  775    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.13 
 
 		 697 aa  750    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.13 
 
 		 695 aa  694    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.98 
 
 		 750 aa  726    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.99 
 
 		 695 aa  712    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.69 
 
 		 690 aa  760    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.82 
 
 		 704 aa  727    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.08 
 
 		 703 aa  653    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.49 
 
 		 729 aa  728    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.47 
 
 		 694 aa  800    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  58.24 
 
 		 728 aa  753    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.71 
 
 		 700 aa  690    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.17 
 
 		 700 aa  719    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  57.55 
 
 		 699 aa  734    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.81 
 
 		 701 aa  940    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  57.26 
 
 		 727 aa  752    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  56.7 
 
 		 699 aa  743    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.68 
 
 		 790 aa  916    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.39 
 
 		 702 aa  922    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.99 
 
 		 696 aa  692    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.38 
 
 		 701 aa  926    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  67.24 
 
 		 702 aa  936    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.14 
 
 		 686 aa  641    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.91 
 
 		 729 aa  734    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.77 
 
 		 694 aa  719    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 706 aa  1412    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.89 
 
 		 700 aa  749    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.77 
 
 		 729 aa  731    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.13 
 
 		 695 aa  701    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.64 
 
 		 697 aa  657    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.78 
 
 		 731 aa  757    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.65 
 
 		 691 aa  630  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.93 
 
 		 723 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  48.94 
 
 		 685 aa  592  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.67 
 
 		 679 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.2 
 
 		 709 aa  558  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.81 
 
 		 701 aa  554  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  42.04 
 
 		 678 aa  543  1e-153  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.68 
 
 		 673 aa  538  1e-151  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.19 
 
 		 765 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.15 
 
 		 829 aa  487  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.5 
 
 		 772 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.49 
 
 		 772 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.14 
 
 		 778 aa  479  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.29 
 
 		 686 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  46 
 
 		 686 aa  478  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2025  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.48 
 
 		 691 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.38 
 
 		 690 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.29 
 
 		 817 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.83 
 
 		 693 aa  469  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.07 
 
 		 693 aa  467  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.28 
 
 		 714 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.64 
 
 		 704 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.09 
 
 		 690 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.64 
 
 		 704 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.02 
 
 		 678 aa  463  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.34 
 
 		 767 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0322  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.17 
 
 		 715 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.732592  normal  0.0359852 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.37 
 
 		 717 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.13 
 
 		 683 aa  462  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.5 
 
 		 685 aa  461  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.91 
 
 		 776 aa  459  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.71 
 
 		 691 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.6 
 
 		 690 aa  457  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.92 
 
 		 697 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.92 
 
 		 704 aa  456  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.11 
 
 		 712 aa  456  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.06 
 
 		 685 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.77 
 
 		 691 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.48 
 
 		 717 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.31 
 
 		 781 aa  455  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.15 
 
 		 681 aa  455  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.09 
 
 		 706 aa  451  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.12 
 
 		 696 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  39.58 
 
 		 818 aa  452  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4592  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.12 
 
 		 691 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000346665 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.68 
 
 		 691 aa  451  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.73 
 
 		 689 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.26 
 
 		 682 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.45 
 
 		 700 aa  449  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001866  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.37 
 
 		 689 aa  452  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.3 
 
 		 692 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.21 
 
 		 712 aa  452  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.36 
 
 		 691 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.12 
 
 		 818 aa  451  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.23 
 
 		 693 aa  451  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.36 
 
 		 683 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4496  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.53 
 
 		 693 aa  451  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.11 
 
 		 786 aa  449  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.41 
 
 		 696 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.68 
 
 		 819 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.52 
 
 		 818 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.51 
 
 		 773 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4871  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.8 
 
 		 693 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708486  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.09 
 
 		 842 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>