More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1281 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 695 aa  1369    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.5 
 
 		 701 aa  694    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.07 
 
 		 701 aa  691    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.31 
 
 		 731 aa  679    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.42 
 
 		 706 aa  736    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.13 
 
 		 706 aa  729    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.73 
 
 		 750 aa  684    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  51.36 
 
 		 699 aa  658    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.78 
 
 		 701 aa  673    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  99.71 
 
 		 695 aa  1367    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.86 
 
 		 700 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.13 
 
 		 706 aa  730    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.86 
 
 		 702 aa  683    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.99 
 
 		 694 aa  767    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.81 
 
 		 686 aa  665    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.68 
 
 		 729 aa  682    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  52.5 
 
 		 728 aa  645    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.78 
 
 		 790 aa  708    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.81 
 
 		 700 aa  938    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.41 
 
 		 704 aa  699    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.44 
 
 		 696 aa  891    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  51.65 
 
 		 727 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.65 
 
 		 697 aa  672    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  69.7 
 
 		 696 aa  952    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.28 
 
 		 702 aa  679    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.54 
 
 		 729 aa  679    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.93 
 
 		 700 aa  651    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.82 
 
 		 694 aa  711    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.02 
 
 		 690 aa  677    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.38 
 
 		 691 aa  650    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  92.37 
 
 		 695 aa  1268    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.27 
 
 		 704 aa  694    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.04 
 
 		 697 aa  862    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.82 
 
 		 729 aa  682    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.56 
 
 		 703 aa  629  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  51.93 
 
 		 699 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  50.64 
 
 		 699 aa  627  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.9 
 
 		 723 aa  624  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  49.35 
 
 		 685 aa  607  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  52.81 
 
 		 701 aa  598  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49 
 
 		 709 aa  543  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.66 
 
 		 673 aa  527  1e-148  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  41 
 
 		 679 aa  514  1e-144  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  39.61 
 
 		 678 aa  499  1e-140  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.19 
 
 		 686 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.14 
 
 		 686 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.53 
 
 		 772 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.52 
 
 		 693 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.82 
 
 		 829 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.6 
 
 		 691 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.12 
 
 		 692 aa  492  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.38 
 
 		 772 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.64 
 
 		 765 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.82 
 
 		 690 aa  488  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.67 
 
 		 690 aa  488  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.51 
 
 		 687 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.38589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.4 
 
 		 717 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.93 
 
 		 693 aa  483  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.22 
 
 		 684 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.05 
 
 		 685 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.9 
 
 		 697 aa  483  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.12 
 
 		 692 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.69 
 
 		 688 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.12 
 
 		 692 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.62 
 
 		 691 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.13 
 
 		 691 aa  482  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.24 
 
 		 691 aa  479  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.01 
 
 		 703 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.68 
 
 		 747 aa  478  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.76 
 
 		 683 aa  477  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.74 
 
 		 691 aa  477  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.51 
 
 		 692 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.88 
 
 		 712 aa  478  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.57 
 
 		 696 aa  479  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.27 
 
 		 696 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.27 
 
 		 691 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.39 
 
 		 705 aa  478  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.27 
 
 		 696 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.2 
 
 		 693 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.2 
 
 		 693 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4103  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.34 
 
 		 693 aa  472  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.24 
 
 		 700 aa  475  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.2 
 
 		 693 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.44 
 
 		 690 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.9 
 
 		 693 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.06 
 
 		 767 aa  473  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.65 
 
 		 693 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.86 
 
 		 685 aa  473  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.13 
 
 		 696 aa  475  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.99 
 
 		 703 aa  474  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.36 
 
 		 737 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.11 
 
 		 696 aa  474  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.69 
 
 		 691 aa  475  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.49 
 
 		 693 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5025  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.78 
 
 		 693 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0053  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.63 
 
 		 693 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0201  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.07 
 
 		 691 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.47 
 
 		 728 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3863  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.2 
 
 		 693 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.79 
 
 		 696 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>