More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2608 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.22 
 
 		 729 aa  729    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.72 
 
 		 702 aa  709    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.55 
 
 		 706 aa  787    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.35 
 
 		 701 aa  758    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.55 
 
 		 706 aa  780    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.26 
 
 		 706 aa  781    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.71 
 
 		 690 aa  756    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.36 
 
 		 729 aa  734    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.08 
 
 		 696 aa  653    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.06 
 
 		 701 aa  744    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  84.26 
 
 		 699 aa  1159    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.79 
 
 		 695 aa  635    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  55 
 
 		 694 aa  733    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  84 
 
 		 700 aa  1110    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.7 
 
 		 750 aa  738    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.07 
 
 		 729 aa  728    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  85 
 
 		 728 aa  1114    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.93 
 
 		 695 aa  646    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.29 
 
 		 700 aa  650    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.92 
 
 		 731 aa  731    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 699 aa  1387    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  85.12 
 
 		 727 aa  1128    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  85.69 
 
 		 699 aa  1140    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.93 
 
 		 695 aa  646    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.27 
 
 		 701 aa  742    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.57 
 
 		 697 aa  648    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.55 
 
 		 702 aa  746    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.84 
 
 		 704 aa  716    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.78 
 
 		 686 aa  656    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.23 
 
 		 697 aa  806    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  79.63 
 
 		 700 aa  1065    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.06 
 
 		 790 aa  735    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.55 
 
 		 704 aa  723    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.43 
 
 		 694 aa  634  1e-180  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.46 
 
 		 703 aa  608  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.43 
 
 		 696 aa  600  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  49.5 
 
 		 685 aa  591  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.78 
 
 		 691 aa  591  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.64 
 
 		 701 aa  556  1e-157  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.43 
 
 		 723 aa  551  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.72 
 
 		 709 aa  539  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  41 
 
 		 678 aa  495  1e-139  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.81 
 
 		 686 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.08 
 
 		 679 aa  491  1e-137  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.85 
 
 		 673 aa  488  1e-136  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.86 
 
 		 686 aa  482  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.8 
 
 		 705 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.83 
 
 		 683 aa  478  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2389  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.62 
 
 		 686 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681406  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2575  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.62 
 
 		 902 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.98 
 
 		 678 aa  465  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3368  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.62 
 
 		 866 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3359  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.62 
 
 		 902 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3325  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.62 
 
 		 902 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.97169  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1011  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.89 
 
 		 746 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0306  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.62 
 
 		 902 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1167  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.62 
 
 		 902 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1280  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.77 
 
 		 859 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.62 
 
 		 737 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.3 
 
 		 684 aa  459  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.93 
 
 		 703 aa  459  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.43 
 
 		 697 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.66 
 
 		 747 aa  456  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.53 
 
 		 692 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.78 
 
 		 765 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.01 
 
 		 728 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.06 
 
 		 690 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0593  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.27 
 
 		 708 aa  451  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.46 
 
 		 767 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0367  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.92 
 
 		 723 aa  451  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.469061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2523  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.59 
 
 		 740 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174099  normal  0.914241 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.73 
 
 		 715 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2662  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.13 
 
 		 791 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.139193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.45 
 
 		 785 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0376  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.7 
 
 		 723 aa  449  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.06 
 
 		 778 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.44 
 
 		 704 aa  446  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2711  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.73 
 
 		 671 aa  449  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0697  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.35 
 
 		 832 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.2 
 
 		 691 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.54 
 
 		 692 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.44 
 
 		 704 aa  446  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.72 
 
 		 829 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0793  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.27 
 
 		 682 aa  442  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0037  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.55 
 
 		 693 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0639  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.01 
 
 		 792 aa  445  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.46 
 
 		 691 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.42 
 
 		 687 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.38589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3812  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.15 
 
 		 777 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.66 
 
 		 717 aa  444  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0322  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.77 
 
 		 715 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.732592  normal  0.0359852 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.25 
 
 		 691 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.51 
 
 		 715 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.92 
 
 		 691 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.17 
 
 		 692 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0059  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.15 
 
 		 693 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4180  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.4 
 
 		 693 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.92 
 
 		 696 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3987  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.31 
 
 		 693 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3863  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.15 
 
 		 693 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>