More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1756 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.93 
 
 		 706 aa  643    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 723 aa  1402    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0554568  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.52 
 
 		 704 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.65 
 
 		 706 aa  644    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3079  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.31 
 
 		 694 aa  645    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.71 
 
 		 729 aa  636    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.81 
 
 		 704 aa  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.65 
 
 		 706 aa  640    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.71 
 
 		 729 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1160  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.03 
 
 		 695 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304943  normal  0.597438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.71 
 
 		 729 aa  640    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0107  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.57 
 
 		 709 aa  666    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.49 
 
 		 750 aa  634  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.9 
 
 		 695 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1704  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.08 
 
 		 702 aa  626  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.244576  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.05 
 
 		 695 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.18 
 
 		 696 aa  618  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4082  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.54 
 
 		 697 aa  615  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173643  normal  0.510585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.06 
 
 		 701 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.99 
 
 		 701 aa  610  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.21 
 
 		 701 aa  612  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1320  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.29 
 
 		 731 aa  605  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.047215  normal  0.732335 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.42 
 
 		 700 aa  603  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2217  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.45 
 
 		 690 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.631945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.56 
 
 		 790 aa  601  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.87 
 
 		 686 aa  600  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.14 
 
 		 696 aa  594  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 		 697 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.48 
 
 		 702 aa  588  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1487  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.27 
 
 		 694 aa  580  1e-164  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.742549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  47.69 
 
 		 699 aa  571  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1979  DEAD/DEAH box helicase-like  50.36 
 
 		 685 aa  568  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.5 
 
 		 703 aa  561  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282187  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  48.56 
 
 		 727 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2936  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.35 
 
 		 700 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.774385  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.99 
 
 		 700 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2852  DEAD/DEAH box helicase  49.21 
 
 		 728 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2055  DEAD/DEAH box helicase-like  48.56 
 
 		 699 aa  551  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.396596  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2608  DEAD/DEAH box helicase-like  49.43 
 
 		 699 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2912  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.36 
 
 		 691 aa  539  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540627  normal  0.0770153 
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.44 
 
 		 673 aa  533  1e-150  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1651  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.14 
 
 		 701 aa  490  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.18 
 
 		 679 aa  488  1e-136  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  38.55 
 
 		 678 aa  482  1e-135  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.31 
 
 		 686 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.67 
 
 		 690 aa  437  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.75 
 
 		 697 aa  438  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.38 
 
 		 691 aa  432  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.38 
 
 		 772 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.9 
 
 		 686 aa  428  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.98 
 
 		 693 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.53 
 
 		 772 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.16 
 
 		 690 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.25 
 
 		 704 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.77 
 
 		 700 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.16 
 
 		 815 aa  422  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.74 
 
 		 690 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.8 
 
 		 683 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.39 
 
 		 678 aa  421  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.91 
 
 		 765 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0124  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.94 
 
 		 692 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.91 
 
 		 704 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.55 
 
 		 681 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.59 
 
 		 690 aa  418  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.9 
 
 		 767 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.56 
 
 		 703 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.35 
 
 		 691 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.93 
 
 		 684 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.99 
 
 		 846 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.14 
 
 		 712 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.03 
 
 		 817 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.67 
 
 		 703 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.17 
 
 		 691 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.09 
 
 		 747 aa  415  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.74 
 
 		 692 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70570  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.42 
 
 		 691 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.35 
 
 		 805 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.64 
 
 		 693 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2025  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.68 
 
 		 691 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.01 
 
 		 691 aa  412  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.59 
 
 		 692 aa  412  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6122  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.42 
 
 		 691 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.21 
 
 		 693 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.91 
 
 		 691 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.96 
 
 		 717 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.38 
 
 		 705 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.04 
 
 		 681 aa  409  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.3 
 
 		 679 aa  410  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.43 
 
 		 685 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  37.5 
 
 		 818 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0065  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.06 
 
 		 691 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2523  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.38 
 
 		 740 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174099  normal  0.914241 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001866  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.91 
 
 		 689 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.25 
 
 		 704 aa  407  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.53 
 
 		 691 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.15 
 
 		 818 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.88 
 
 		 692 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.18 
 
 		 778 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.46 
 
 		 818 aa  402  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.73 
 
 		 683 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>