More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0124 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.39 
 
 
686 aa  640    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.57 
 
 
697 aa  658    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0124  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
692 aa  1384    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.38 
 
 
693 aa  654    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.43 
 
 
696 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.43 
 
 
691 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.79 
 
 
692 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.35 
 
 
691 aa  622  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.51 
 
 
688 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.22 
 
 
691 aa  625  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.29 
 
 
696 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.29 
 
 
696 aa  625  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.39 
 
 
693 aa  623  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.23 
 
 
705 aa  623  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.02 
 
 
691 aa  623  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.84 
 
 
747 aa  619  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.29 
 
 
696 aa  620  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4496  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.24 
 
 
693 aa  620  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.14 
 
 
696 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  50 
 
 
696 aa  618  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  50 
 
 
696 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.51 
 
 
691 aa  615  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.36 
 
 
712 aa  615  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.2 
 
 
690 aa  615  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.63 
 
 
691 aa  616  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.22 
 
 
690 aa  617  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03509  ATP-dependent DNA helicase  50.79 
 
 
693 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3987  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.94 
 
 
693 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5025  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.94 
 
 
693 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4976  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.51 
 
 
697 aa  612  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03461  hypothetical protein  50.79 
 
 
693 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4103  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.94 
 
 
693 aa  613  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.95 
 
 
693 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.94 
 
 
693 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.77 
 
 
693 aa  612  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.86 
 
 
705 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0053  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.65 
 
 
693 aa  611  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.79 
 
 
692 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3863  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.65 
 
 
693 aa  611  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.07 
 
 
693 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.78 
 
 
693 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.07 
 
 
693 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.07 
 
 
693 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0059  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.65 
 
 
693 aa  611  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.79 
 
 
691 aa  609  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.79 
 
 
692 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.07 
 
 
693 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.79 
 
 
692 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.14 
 
 
696 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3717  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.07 
 
 
695 aa  606  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.58 
 
 
691 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.22 
 
 
693 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4592  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.98 
 
 
691 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000346665 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.99 
 
 
693 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001866  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.13 
 
 
689 aa  604  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.65 
 
 
691 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.74 
 
 
687 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.38589  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.42 
 
 
693 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0087  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.93 
 
 
693 aa  601  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6122  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.3 
 
 
691 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0065  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.36 
 
 
691 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.1 
 
 
690 aa  592  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0037  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.85 
 
 
693 aa  592  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.72 
 
 
691 aa  595  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.62 
 
 
704 aa  592  1e-168  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70570  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.3 
 
 
691 aa  594  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0041  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.71 
 
 
693 aa  590  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.52 
 
 
690 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0201  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.36 
 
 
691 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4871  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.64 
 
 
693 aa  589  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708486  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.62 
 
 
704 aa  592  1e-167  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00158  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.06 
 
 
690 aa  590  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.84 
 
 
686 aa  591  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4180  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.71 
 
 
693 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3507  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.06 
 
 
691 aa  586  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.85 
 
 
703 aa  581  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2025  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.63 
 
 
691 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.65 
 
 
683 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2283  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.64 
 
 
692 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.23 
 
 
678 aa  570  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.19 
 
 
684 aa  568  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.42 
 
 
717 aa  568  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.72 
 
 
692 aa  554  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0722  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.81 
 
 
684 aa  549  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000137671  hitchhiker  0.00000253506 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0568  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.81 
 
 
684 aa  549  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.457538  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2085  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.62 
 
 
808 aa  544  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.52 
 
 
728 aa  542  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2402  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.4 
 
 
782 aa  542  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.761831 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.03 
 
 
737 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.31 
 
 
785 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3812  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.15 
 
 
777 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0639  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.88 
 
 
792 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2523  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.44 
 
 
740 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174099  normal  0.914241 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2389  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.95 
 
 
686 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681406  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3325  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.95 
 
 
902 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.97169  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0697  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.51 
 
 
832 aa  528  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0240  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.88 
 
 
771 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3359  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.95 
 
 
902 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2575  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.95 
 
 
902 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0724  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.88 
 
 
771 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>