More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0722 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.29 
 
 		 696 aa  652    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.99 
 
 		 692 aa  635    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.85 
 
 		 692 aa  648    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.44 
 
 		 691 aa  638    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4976  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.27 
 
 		 697 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0059  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.88 
 
 		 693 aa  635    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.88 
 
 		 693 aa  636    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.22 
 
 		 688 aa  647    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.93 
 
 		 696 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00158  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.71 
 
 		 690 aa  640    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.93 
 
 		 691 aa  650    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.3 
 
 		 712 aa  659    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.99 
 
 		 692 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4103  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.73 
 
 		 693 aa  635    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0722  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 684 aa  1365    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000137671  hitchhiker  0.00000253506 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.07 
 
 		 696 aa  650    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.09 
 
 		 693 aa  640    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3863  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.88 
 
 		 693 aa  635    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.95 
 
 		 691 aa  647    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0568  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 684 aa  1365    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.457538  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.17 
 
 		 686 aa  651    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5025  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.88 
 
 		 693 aa  636    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.29 
 
 		 691 aa  644    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.49 
 
 		 697 aa  673    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.25 
 
 		 693 aa  640    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.17 
 
 		 691 aa  669    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.29 
 
 		 696 aa  650    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.76 
 
 		 691 aa  652    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.51 
 
 		 696 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.51 
 
 		 696 aa  648    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.2 
 
 		 705 aa  656    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.22 
 
 		 696 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.37 
 
 		 696 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03509  ATP-dependent DNA helicase  50.73 
 
 		 693 aa  633  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0053  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.58 
 
 		 693 aa  632  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03461  hypothetical protein  50.73 
 
 		 693 aa  633  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.47 
 
 		 691 aa  634  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3507  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.75 
 
 		 691 aa  634  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.53 
 
 		 693 aa  634  1e-180  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.04 
 
 		 705 aa  634  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.92 
 
 		 692 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4496  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.03 
 
 		 693 aa  634  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.17 
 
 		 693 aa  631  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3987  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.58 
 
 		 693 aa  630  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4592  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.29 
 
 		 691 aa  631  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000346665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.05 
 
 		 691 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0065  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.62 
 
 		 691 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0041  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.88 
 
 		 693 aa  627  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0201  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.76 
 
 		 691 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.65 
 
 		 704 aa  627  1e-178  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0037  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.88 
 
 		 693 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.65 
 
 		 704 aa  627  1e-178  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  50 
 
 		 693 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.63 
 
 		 691 aa  627  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4871  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.29 
 
 		 693 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708486  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4180  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.88 
 
 		 693 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.76 
 
 		 693 aa  626  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.71 
 
 		 693 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  50 
 
 		 693 aa  625  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.71 
 
 		 693 aa  625  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.68 
 
 		 690 aa  624  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  50 
 
 		 693 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.15 
 
 		 693 aa  620  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.85 
 
 		 686 aa  619  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001866  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.48 
 
 		 689 aa  616  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.61 
 
 		 693 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2283  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.07 
 
 		 692 aa  615  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0087  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.71 
 
 		 693 aa  614  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3717  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.54 
 
 		 695 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70570  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.82 
 
 		 691 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6122  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.97 
 
 		 691 aa  612  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.43 
 
 		 703 aa  605  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.09 
 
 		 690 aa  600  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.21 
 
 		 690 aa  596  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.34 
 
 		 728 aa  595  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.58 
 
 		 691 aa  597  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2025  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.63 
 
 		 691 aa  594  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.77 
 
 		 690 aa  589  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.28 
 
 		 747 aa  590  1e-167  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.66 
 
 		 683 aa  588  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.52 
 
 		 684 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.5 
 
 		 717 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.48 
 
 		 737 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.88 
 
 		 715 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.57 
 
 		 687 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.38589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.67 
 
 		 715 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.53 
 
 		 785 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3737  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.78 
 
 		 665 aa  566  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3359  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.19 
 
 		 902 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3368  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.19 
 
 		 866 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3812  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.54 
 
 		 777 aa  568  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.32 
 
 		 692 aa  567  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1280  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.82 
 
 		 859 aa  568  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2389  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.04 
 
 		 686 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.59 
 
 		 678 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3325  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.19 
 
 		 902 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.97169  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2575  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.04 
 
 		 902 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0240  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.54 
 
 		 771 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0306  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.04 
 
 		 902 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0724  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.54 
 
 		 771 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>