More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0034 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.87 
 
 		 781 aa  637    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.26 
 
 		 763 aa  812    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.66 
 
 		 776 aa  963    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.26 
 
 		 779 aa  813    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 773 aa  1556    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.38 
 
 		 683 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.8 
 
 		 689 aa  552  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.16 
 
 		 681 aa  553  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.38 
 
 		 685 aa  549  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.95 
 
 		 818 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.62 
 
 		 819 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.62 
 
 		 819 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.18 
 
 		 694 aa  544  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.61 
 
 		 685 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.46 
 
 		 779 aa  537  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.79 
 
 		 717 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.34 
 
 		 692 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.67 
 
 		 680 aa  528  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.71 
 
 		 829 aa  522  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.22 
 
 		 772 aa  522  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.81 
 
 		 772 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.76 
 
 		 827 aa  520  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.8 
 
 		 817 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.02 
 
 		 679 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.53 
 
 		 700 aa  515  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.55 
 
 		 786 aa  509  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.27 
 
 		 827 aa  508  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1984  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.65 
 
 		 690 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.24 
 
 		 765 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.12 
 
 		 682 aa  503  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.84 
 
 		 767 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.27 
 
 		 682 aa  505  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.56 
 
 		 682 aa  504  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.97 
 
 		 678 aa  503  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.12 
 
 		 682 aa  501  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.97 
 
 		 682 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.97 
 
 		 682 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.81 
 
 		 682 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.97 
 
 		 682 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.67 
 
 		 818 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.13 
 
 		 685 aa  500  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  39.8 
 
 		 818 aa  501  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.24 
 
 		 778 aa  502  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.53 
 
 		 740 aa  499  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.49 
 
 		 682 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.81 
 
 		 682 aa  499  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.46 
 
 		 822 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1139  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.8 
 
 		 776 aa  496  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00836981  normal  0.0179484 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.71 
 
 		 714 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.14 
 
 		 822 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.55 
 
 		 812 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.17 
 
 		 862 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.06 
 
 		 815 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.16 
 
 		 712 aa  490  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.44 
 
 		 657 aa  491  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.17 
 
 		 679 aa  489  1e-137  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.48 
 
 		 688 aa  486  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.06 
 
 		 846 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.12 
 
 		 846 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.27 
 
 		 846 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  42 
 
 		 681 aa  485  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.33 
 
 		 671 aa  479  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  41 
 
 		 704 aa  479  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.03 
 
 		 706 aa  479  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.8 
 
 		 695 aa  482  1e-134  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.6 
 
 		 832 aa  476  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.92 
 
 		 805 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0449  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.64 
 
 		 676 aa  478  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0217624  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.01 
 
 		 676 aa  477  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1162  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.06 
 
 		 678 aa  474  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000110827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1330  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.82 
 
 		 678 aa  475  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.86 
 
 		 693 aa  473  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.35 
 
 		 672 aa  473  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.41 
 
 		 707 aa  474  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.77 
 
 		 686 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.64 
 
 		 682 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.74 
 
 		 787 aa  468  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.99 
 
 		 702 aa  468  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.97 
 
 		 703 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.54 
 
 		 818 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.62 
 
 		 753 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2072  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.13 
 
 		 696 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.98 
 
 		 706 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.7 
 
 		 719 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1286  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.59 
 
 		 686 aa  463  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1244  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.34 
 
 		 850 aa  463  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.912337  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.29 
 
 		 706 aa  465  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.24 
 
 		 818 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1311  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.59 
 
 		 686 aa  463  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.24 
 
 		 691 aa  464  1e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.75 
 
 		 818 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.88 
 
 		 687 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.38589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.76 
 
 		 686 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1702  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.67 
 
 		 564 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.48 
 
 		 815 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.88 
 
 		 690 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.09 
 
 		 704 aa  457  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.23 
 
 		 704 aa  458  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.73 
 
 		 692 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.75 
 
 		 842 aa  459  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>